Articles

Le Bras Yves, Delavaud Aurelie, Pelletier Dominique, Mihoub Jean-Baptiste (2019). From Raw Biodiversity Data to Indicators, Boosting Products Creation, Integration and Dissemination: French BON FAIR initiatives and related informatics solutions. Biodiversity Information Science and Standards, 3, e39215 (3p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.3897/biss.3.39215 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00512/62327/
Travers-Trolet Morgane, Coppin Franck, Cresson Pierre, Cugier Philippe, Oliveros-Ramos Ricardo, Verley Philippe (2019). Emergence of negative trophic level-size relationships from a size-based, individual-based multispecies fish model. Ecological Modelling, 410, 108800 (14p.). https://doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2019.108800
Hosack Geoffrey R., Trenkel Verena (2019). Functional group based marine ecosystem assessment for the Bay of Biscay via elasticity analysis. Peerj, 7, e7422 (36p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.7717/peerj.7422 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00510/62119/
Hagen Oskar, Vaterlaus Lisa, Albouy Camille, Brown Andrew, Leugger Flurin, Onstein Renske E., Santana Charles Novaes, Scotese Christopher R., Pellissier Loic (2019). Mountain building, climate cooling and the richness of cold‐adapted plants in the Northern Hemisphere. Journal of Biogeography, 46(8), 1792-1807. https://doi.org/10.1111/jbi.13653
Huret Martin, Tsiaras K, Daewel U, Skogen Md, Gatti Paul, Petitgas Pierre, Somarakis S (2019). Variation in life-history traits of European anchovy along a latitudinal gradient: a bioenergetics modelling approach. Marine Ecology Progress Series, 617-618, 95-112. Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/meps12574 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00504/61564/
ICES (2019). Working Group for the Bay of Biscay and the Iberian Waters Ecoregion ( WGBIE ). ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM, 1(31), 692p. Publisher's official version : https://doi.org/10.17895/ices.pub.5299 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00504/61545/
ICES (2019). Working Group on the Biology and Assessment of Deep-sea Fisheries Resources (WGDEEP). ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM, 1(21), 988p. Publisher's official version : https://doi.org/10.17895/ices.pub.5262 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00502/61331/
Meddeb Marouan, Niquil Nathalie, Grami Boutheina, Mejri Kaouther, Haraldsson Matilda, Chaalali Aurelie, Pringault Olivier, Hlaili Asma Sakka (2019). A new type of plankton food web functioning in coastal waters revealed by coupling Monte Carlo Markov chain linear inverse method and ecological network analysis. Ecological Indicators, 104, 67-85. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2019.04.077
Chevillot Xavier, Tecchio Samuele, Chaalali Aurelie, Lassalle Geraldine, Selleslagh Jonathan, Castelnaud Gerard, David Valerie, Bachelet Guy, Niquil Nathalie, Sautour Benoit, Lobry Jeremy (2019). Global Changes Jeopardize the Trophic Carrying Capacity and Functioning of Estuarine Ecosystems. Ecosystems, 22(3), 473-495. https://doi.org/10.1007/s10021-018-0282-9
Lomnard Fabien, Boss Emmanuel, Waite Anya M., Vogt Meike, Uitz Julia, Stemman Lars, Sosik Heidi M., Schulz Jan, Romagnan Jean-Baptiste, Picheral Marc, Pearlman Jay, Ohman Mark D, Niehoff Barbara, Moller Klas O, Miloslavich Patricia, Lara-Lpez Ana, Kudela Raphael, Lopes Ribens M, Kiko Rainer, Karp-Boss Lee, Jaffe Jules S, Iversen Morten H, Irisson Jean-Olivier, Fennel Katja, Hauss Helena, Guidi Lionel, Gorsky Gaby, Giering Sarah L.C., Gaube Peter, Gallager Scott, Dubelaar George, Cowen Robert K, Carlotti Francois, Briseno-Avena Christian, Berline Leo, Benoit-Bird Kelly, Bax Nicholas, Batten Sonia, Ayata Sakina Dorothee, Artigas Luis Felipe, Appeltans Ward (2019). Globally Consistent Quantitative Observations of Planktonic Ecosystems. Frontiers In Marine Science, 6(196), 21p. Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmars.2019.00196 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00490/60217/
Saulnie Erwan, Brind'Amour Anik, Tableau Adrien, Rufino Marta, Dauvin Jean‐claude, Luczak Christophe, Le Bris Herve (2019). Seasonality in coastal macrobenthic biomass and its implications for estimating secondary production using empirical models. Limnology And Oceanography, 64(3), 935-949. Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/lno.11086 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00489/60091/
Lambert Charlotte, Authier Matthieu, Doray Mathieu, Doremus Ghislain, Spitz Jerome, Ridoux Vincent (2019). Hide and seek in the Bay of Biscaya functional investigation of marine megafauna and small pelagic fish interactions. Ices Journal Of Marine Science, 76(1), 113-123. https://doi.org/10.1093/icesjms/fsy143
ICES (2019). Benchmark Workshop on Baltic Cod Stocks (WKBALTCOD2). ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM, 1(9), 314p. https://doi.org/10.17895/ices.pub.4984
Bănaru Daniela, Diaz Frederic, Verley Philippe, Campbell Rose, Navarro Jonathan, Yohia Christophe, Oliveros-Ramos Ricardo, Mellon Capucine, Shin Yunne-Jai (2019). Implementation of an end-to-end model of the Gulf of Lions ecosystem (NW Mediterranean Sea). I. Parameterization, calibration and evaluation. Ecological Modelling, 401, 1-19. https://doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2019.03.005
Pointin Fabien, Daures Fabienne, Rochet Marie-Joelle Use of avoidance behaviours to reduce the economic impacts of the EU Landing Obligation: the case study of a mixed trawl fishery. ICES Journal of Marine Science IN PRESS. https://doi.org/10.1093/icesjms/fsz032
Day Louise, Kopp Dorothee, Robert Marianne, Le Bris Herve (2019). Trophic ecology of large gadiforms in the food web of a continental shelf ecosystem. Progress In Oceanography, 175, 105-114. https://doi.org/10.1016/j.pocean.2019.03.007
Caputi Luigi, Carradec Quentin, Eveillard Damien, Kirilovsky Amos, Pelletier Eric, Pierella Karlusich Juan J., Rocha Jimenez Vieira Fabio, Villar Emilie, Chaffron Samuel, Malviya Shruti, Scalco Eleonora, Acinas Silvia G., Alberti Adriana, Aury Jean-Marc, Benoiston Anne-Sophie, Bertrand Alexis, Biard Tristan, Bittner Lucie, Boccara Martine, Brum Jennifer R., Brunet Cedric, Busseni Greta, Carratala Anna, Claustre Herve, Coelho Luis Pedro, Colin Sebastien, D'Aniello Salvatore, Da Silva Corinne, Del Core Marianna, Dore Hugo, Gasparini Stephane, Kokoszka Florian, Jamet Jean-Louis, Lejeusne Christophe, Lepoivre Cyrille, Lescot Magali, Lima-Mendez Gipsi, Lombard Fabien, Lukeš Julius, Maillet Nicolas, Madoui Mohammed-Amin, Martinez Elodie, Mazzocchi Maria Grazia, Neou Mario B., Paz-Yepes Javier, Poulain Julie, Ramondenc Simon, Romagnan Jean-Baptiste, Roux Simon, Salvagio Manta Daniela, Sanges Remo, Speich Sabrina, Sprovieri Mario, Sunagawa Shinichi, Taillander Vincent, Tanaka Atsuko, Tirichine Leila, Trottier Camille, Uitz Julia, Veluchamy Alaguraj, Veselá Jana, Vincent Flora, Yau Sheree, Kandels-Lewis Stefanie, Searson Sarah, Dimier Celine, Picheral Marc, Bork Peer, Boss Emmanuel, De Vargas Colomban, Follows Michael J., Grimsley Nigel, Guidi Lionel, Hingamp Pascal, Karsenti Eric, Sordino Paolo, Stemmann Lars, Sullivan Matthew B., Tagliabue Alessandro, Zingone Adriana, Garczarek Laurence, D'Ortenzio Fabrizio, Testor Pierre, Not Fabrice, Ribera D'Alcala Maurizio, Wincker Patrick, Bowler Chris, Iudicone Daniele, Acinas Silvia G., Bork Peer, Boss Emmanuel, De Vargas Colomban, Follows Michael J., Gorsky Gabriel, Grimsley Nigel, Hingamp Pascal, Jaillon Olivier, Kandels-Lewis Stefanie, Karp-Boss Lee, Karsenti Eric, Krzic Uros, Not Fabrice, Ogata Hiroyuki, Pesant Stephane, Raes Jeroen, Reynaud Emmanuel G., Sardet Christian, Sieracki Mike, Speich Sabrina, Stemmann Lars, Sullivan Matthew B., Sunagawa Shinichi, Velayoudon Didier, Weissenbach Jean (2019). Community-Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Planktonic Ecosystems. Global Biogeochemical Cycles, 33(3), 391-419. Publisher's official version : https://doi.org/10.1029/2018GB006022 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00475/58680/
Malvarosa Loretta, Murillas Arantza, Lehuta Sigrid, Nielsen J. Rasmus, Macher Claire, Goti Leyre, Motova Arina, Doering Ralf, Haraldson Gunnar, Accadia Paolo, Hamon Katell, Bastardie Francois, Maravelias Christos D., Mardle Simon, Thøgersen Thomas (2019). Sustainability Impact Assessment (SIA) in fisheries: Implementation in EU fishing regions. Marine Policy, 101, 63-79. https://doi.org/10.1016/j.marpol.2018.11.039
Rufino Marta, Bez Nicolas, Brind'Amour Anik (2019). Influence of data pre-processing on the behavior of spatial indicators. Ecological Indicators, 99, 108-117. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2018.11.058
Le Pape Olivier, Brind'Amour Anik, Begout Marie-Laure (2019). Flatfish ecology: Advances from the 10th international flatfish symposium. Journal Of Sea Research, 144, 156-157. https://doi.org/10.1016/j.seares.2018.12.004
Marandel Florianne, Lorance Pascal, Berthele Olivier, Trenkel Verena, Waples Robin S., Lamy Jean-Baptiste (2019). Estimating effective population size of large marine populations, is it feasible? Fish And Fisheries, 20(1), 189-198. https://doi.org/10.1111/faf.12338
Trenkel Verena, Vaz Sandrine, Albouy Camille, Brind'Amour Anik, Duhamel Erwan, Laffargue Pascal, Romagnan Jean-Baptiste, Simon Julien, Lorance Pascal (2019). We can reduce the impact of scientific trawling on marine ecosystems. Marine Ecology Progress Series, 609, 277-282. https://doi.org/10.3354/meps12834
Pinto Cecilia, Travers-Trolet Morgane, Macdonald Jed, Rivot Etienne, Vermard Youen (2019). Combining multiple data sets to unravel the spatiotemporal dynamics of a data-limited fish stock. Canadian Journal Of Fisheries And Aquatic Sciences, 76(8), 1338-1349. Publisher's official version : https://doi.org/10.1139/cjfas-2018-0149 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00460/57187/
Bourdaud Pierre, Travers-Trolet Morgane, Vermard Youen, Marchal Paul (2019). Improving the interpretation of fishing effort and pressures in mixed fisheries using spatial overlap metrics. Canadian Journal Of Fisheries And Aquatic Sciences, 76(4), 586-596. Publisher's official version : https://doi.org/10.1139/cjfas-2017-0529 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00446/55747/

Thesis / HDR

Blanluet Arthur (2019). Étude par acoustique large bande de la composition et de la distribution spatiale de couches diffusantes denses dans le golfe de Gascogne. PhD Thesis, AGROCAMPUS OUEST, COMUE UNIVERSITE BRETAGNE LOIRE. https://archimer.ifremer.fr/doc/00497/60865/

Reports

Thomas Amandine, Baudrier Jerome, Gauthier Emilie (2019). Bancarisation des données planctoniques des campagnes halieutiques. Proposition de structuration des données planctoniques des campagnes optimisées pour une intégration dans le SI Quadrige². ODE/VIGIES/19/06. https://doi.org/10.13155/62496
Lecordier Enora (2019). Bancs de surface de petits poissons pélagiques dans le Golfe de Gascogne : caractérisation et implications pour l’évaluation de biomasse.
Garric Sarah (2019). Évaluation du potentiel halieutique de la Zone Économique Exclusive française en 2050. https://archimer.ifremer.fr/doc/00512/62328/
Vaz Sandrine, Brind'Amour Anik, Delaunay Damien, Baudrier Jerome (2019). Rapport de campagne de nourriceries côtières : Campagne NOURMED 2018. R.RBE / MARBEC-2019. https://archimer.ifremer.fr/doc/00506/61742/
Brind'Amour Anik (2019). Compte rendu de participation au groupe d'experts du CIEM consacré à la biodiversité (WGBIODIV). Copenhague, 4-8 février 2019. RBE/ederu/2019/CR7.
Delaunay Damien, Brind'Amour Anik, Vaz Sandrine, Baudrier Jerome (2019). Note sur les objectifs des campagnes scientifiques "Nourriceries" des zones côtières à substrat meuble. https://archimer.ifremer.fr/doc/00499/61057/
Brind'Amour Anik, Le Bris Herve, Delaunay Damien, Berthele Olivier, Baudrier Jerome (2019). Rapport de campagne sur les nourriceries côtières : Campagne Nurse 2018. Rapport intermédiaire. https://doi.org/10.13155/60651
Vermard Youen (2019). Compte rendu de participation au Groupe de rédaction de l’avis sur l’évaluation des stratégies de gestion à long-terme pour certains stocks de mer du Nord et islandais (ADGMSE). Copenhague, 9-11 avril 2019. RBE/ederu/2019/CR6.
Drogou Mickael, Le Goff Ronan, Le Roy Didier, Martin Stephane, Le Ru Loic, Bouche Ludovic, Roy Amedee, Berthele Olivier, Lebigre Christophe (2019). Nourdem Loire et Nourdem Seine : bilan des campagnes 2018. RST-RBE STH 2019. https://archimer.ifremer.fr/doc/00487/59889/
Berger Laurent, Doray Mathieu (2019). Converting RAW data into HAC format using HERMES. Tutorial. https://archimer.ifremer.fr/doc/00487/59837/
Lorance Pascal, Baulier Loic (2019). Compte rendu de participation à l'atelier du CIEM pour l'élévation des captures des observations à la mer et estimation de captures compatibles avec l'approche de précaution (WKSHARK5), Leeuwarden, Pays-Bas, 25 février-1er mars 2019. RBE/ederu/2019/CR3.
ICES (2019). Report of the Working Group on Mixed Fisheries Advice Methodology (WGMIXFISH-METH), 15-19 October 2018, Nantes, France. ICES CM 2018/ACOM:68. https://archimer.ifremer.fr/doc/00476/58816/
Doray Mathieu (2019). Manuel d'utilisation d'Echobase. RBE/EMH 13- 01. https://doi.org/10.13155/27730
Bled--Defruit Geoffrey, Chantre Celina, Dufour Jean-Louis, Elleboode Romain, Tribouilloy Karine, Telliez Solene, Badts Vincent, Mahe Kelig (2019). Guide de prélèvements et d’envoi des pièces calcifiées. https://archimer.ifremer.fr/doc/00116/22764/

Books / Conference proceedings

Reid David G, Calderwood Julia, Afonso Pedro, Bourdaud Pierre, Fauconnet Laurence, Gonzalez-Irusta Jose Manuel, Mortensen Lars O, Ordines Francesc, Lehuta Sigrid, Pawlowski Lionel, Plet-Hansen Kristian S, Radford Zachary, Robert Marianne, Rochet Marie-Joelle, Rueda Lucia, Ulrich Clara, Vermard Youen (2019). The Best Way to Reduce Discards Is by Not Catching Them! In The European Landing Obligation, S. S. Uhlmann et al. (eds.), 2018. ISBN 978-3-030-03307-1 ISBN 978-3-030-03308-8 (eBook) https://doi.org/10.1007/978-3-030-03308-8.Chap.13, pp.257-278 (Springer Nature). https://archimer.ifremer.fr/doc/00473/58428/

Expertises

Cornou Anne Sophie, Demaneche Sebastien, Billet Norbert (2019). Informations sur l’exploitation des combinaisons zone-engin-espèce concernées par une exemption de minimis à l’obligation de débarquement. DPMA - Direction des Pêches Maritimes et de l'Aquaculture, La Défense, Ref. DG/2019.194 - Saisine DPMA 19-13937 (I), 16p., 11p.https://archimer.ifremer.fr/doc/00506/61729/
Simplet Laure, Blanchet Aline, Brind'Amour Anik, Dreves Luc (2019). Demande d’avis de l'Ifremer sur le bilan de la fermeture de la concession du Pilier. DREAL des Pays de Loire - Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement des Pays de Loire, Service risques naturels et technologiques, Division des risques naturels, hydrauliques et sous-sols, Nantes, Ref. Ifremer-PDG/2019-207 - SRNT/AM/2019-0029 du 17 janvier 2019, 8p.

Meeting abstracts

Delaunay Damien, Brind'Amour Anik, Foucher Eric (2019). Evaluation du bon état écologique 2018 et perspectives de développement. Descripteur 1 "Biodiversité - Poissons et céphalopodes". Descripteur 3 "Espèces commerciales". 14e colloque de l’AFH "Recherche Halieutique et Développement Durable". 26 au 28 juin 2019 , Université de Caen Normandie.
Travers-Trolet Morgane, Mille Tiphaine, Ernande Bruno, Vaz Sandrine (2019). Structuration spatiale de la Manche Ouest et proposition de stratification. La CGFS a 30 ans, 24-25 avril 2019, Boulogne sur Mer, France.
Trenkel Verena (2019). La Manche Est vue par les indicateurs. La CGFS a 30 ans, 24-25 avril 2019, Boulogne sur Mer, France.
Travers-Trolet Morgane, Auber Arnaud, Coppin Franck, Verin Yves, Ernande Bruno (2019). Intercalibration entre Gwen Drez et Thalassa. La CGFS a 30 ans. 24-25 avril 2019, Boulogne sur Mer, France.
Brind'Amour Anik, Delaunay Damien, Foucher Eric (2019). Evaluation du bon état écologique 2018. Descripteur 1 « Poissons et céphalopodes », Descripteur 3 « Espèces commerciales ». Séminaire "Zones fonctionnelles halieutiques : Focus nourriceries" du réseau thématique AFB "Pêche, aquaculture, ressources halieutiques". 25 au 26 mars 2019, Cabourg.
Delaunay Damien, Brind'Amour Anik (2019). Les espèces de la colonne d'eau : les connaissances. Assemblée Régionale Mer & Littoral - Ateliers pédagogiques « éolien maritime et environnement ». 29 avril 2019, Nantes.

Posters

Doray Mathieu, Huret Martin, Couturier Christian, Doublet Sylvain (2019). Vers un développement durable de la pêche française ? Perspectives du scénario d’agriculture durable Afterres2050. 14e colloque de l’AFH "Recherche Halieutique et Développement Durable". 26 au 28 juin 2019 , Université de Caen Normandie. https://archimer.ifremer.fr/doc/00512/62325/
Lemoine Andrea, Day Louise, Brind'Amour Anik, Vogel Camille (2019). Evolution saisonnière de la condition des juvéniles de plie (Pleuronectes platessa) en estuaire de Seine. 14e colloque de l’AFH "Recherche Halieutique et Développement Durable". 26 au 28 juin 2019 , Université de Caen Normandie.
Engler Alexandra, Day Louise, Chouquet Bastien, Vogel Camille, Brind'Amour Anik, Cresson Pierre (2019). Variations spatiales de l’alimentation des juvéniles de sole et de plie en Baie de Seine. 14e colloque de l’AFH "Recherche Halieutique et Développement Durable". 26 au 28 juin 2019, Université de Caen Normandie.
Hazevis Gaetan, Baudrier Jerome, Laffargue Pascal, Brind'Amour Anik, Delaunay Damien, Vaz Sandrine (2019). Harmonisation des suivis de la mégafaune invertébrée benthique sur les campagnes halieutiques de l'Ifremer. Journées scientifiques et techniques Mer. 11 et 12 juin 2019, Brest. https://archimer.ifremer.fr/doc/00502/61360/