Articles

Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Oude Munnink Bas B., Besnard Alban, Phan My V. T., Nieuwenhuijse David F., De Graaf Miranda, Schapendonk Claudia M. E., Wacrenier Candice, Cotten Matthew, Koopmans Marion P. G., Le Guyader Soizick (2019). Metavirome Sequencing to Evaluate Norovirus Diversity in Sewage and Related Bioaccumulated Oysters. Frontiers in Microbiology, 10(2394), 13p. Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.02394 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00586/69765/
Strubbia Sofia, Phan My V. T., Schaeffer Julien, Koopmans Marion, Cotten Matthew, Le Guyader Soizick Characterization of Norovirus and Other Human Enteric Viruses in Sewage and Stool Samples Through Next-Generation Sequencing. Food and Environmental Virology IN PRESS. Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s12560-019-09402-3 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00512/62332/
Lowther J. A., Bosch A., Butot S., Ollivier Joanna, Maede D., Rutjes S. A., Hardouin G., Lombard B., In'T Veld P., Leclercq A. (2019). Validation of EN ISO method 15216-Part 1-Quantification of hepatitis A virus and norovirus in food matrices. International Journal Of Food Microbiology, 288, 82-90. Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2018.11.014 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00476/58776/
Hartnell R. E., Stockley L., Keay W., Rosec J. -P., Hervio-Heath Dominique, Van Den Berg H., Leoni F., Ottaviani D., Henigman U., Denayer S., Serbruyns B., Georgsson F., Krumova-Valcheva G., Gyurova E., Blanco C., Copin S., Strauch E., Wieczorek K., Lopatek M., Britova A., Hardouin G., Lombard B., Veld P. In'T, Leclercq A., Baker-Austin C. (2019). A pan-European ring trial to validate an International Standard for detection of Vibrio cholerae , Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus in seafoods. International Journal Of Food Microbiology, 288, 58-65. Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2018.02.008 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00425/53680/

Rapports

Serais Ophelie, Cimiterra Nicolas, Fiandrino Annie, Crottier Anais, Grouhel-Pellouin Anne, Piquet Jean-Come (2019). Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Région Occitanie. Edition 2019. ODE/UL/LER/LR/19.011. https://doi.org/10.13155/61320
Garcia Celine, Canier Lydie, Arzul Isabelle, Hubert Francoise, Travers Marie-Agnes, Moussa Pouly Mirna, Chollet Bruno, Serpin Delphine, Noyer Mathilde, Lupo Coralie (2019). Synthèse de la journée des laboratoire agréés et reconnus.
Piquet Jean-Come, Schmitt Anne, Rocq Sophie, Cochennec-Laureau Nathalie (2019). Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de Loire-Atlantique. Edition 2019. RST/LER/MPL/19.07. https://archimer.ifremer.fr/doc/00495/60625/
Rocq Sophie, Gabellec Raoul (2019). Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département du Morbihan. Edition 2019. RBE/SGMM/LSEM 019-02. https://archimer.ifremer.fr/doc/00492/60355/
Piquet Jean-Come, Kaelin Gaelle (2019). Plan d'échantillonnage national du réseau de surveillance microbiologique des zones de production de coquillages (REMI) mars 2019. Prescriptions du réseau de contrôle officiel microbiologique des coquillages dans les zones de productions classées. https://archimer.ifremer.fr/doc/00486/59725/

Expertises / Avis

Cochennec-Laureau Nathalie, Piquet Jean-Come, Rocq Sophie (2019). Avis sur l'opportunité d'un classement alternatif des zones n° 56.17.4 pour le groupe 3 (estuaire de la Vilaine - baie de la Vilaine) et n° 56.18.1 pour le groupe 3 (baie de Mont Mahé). DDTM 56 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer du Morbihan, Délégation à la Mer et au Littoral, Vannes, Ref. ODE/UL/LER/MPL/19.42 - 199/2019 – CM VA, 5p.
Lemoine Maud, Neaud-Masson Nadine, Piquet Jean-Come, Gabellec Raoul, Cochennec-Laureau Nathalie (2019). Demande de déplacement du point REMI « Kerivor ». DDTM 56 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer du Morbihan, SAMEL – DML, Vannes, Ref. LER/MPL n° 19.26/Lo - Courrier du 9 avril 2019, 5p.

Communications sans actes

Serais Ophelie, Cimiterra Nicolas, Crottier Anais, Piquet Jean-Come, Rocq Sophie, Fiandrino Annie, Munaron Dominique (2019). Restitution des évaluations de la qualité des zones de production conchylicole de l’Hérault et du Gard. Commission de classement sanitaire des zones de production de l'Hérault et du Gard. 11/07/2019, Sète.
Schaeffer Julien, Besnard Alban, Strubbia Sofia, Le Guyader Soizick (2019). Enteric virus diversity in sewages collected during last decade. 7th Meeting of The European Society for Virology (ESV). 28 April - 1 May 2019 in Rotterdam, the Netherlands.

Posters

Verrez-Bagnis Veronique, Soree Marion, Passerini Delphine, Kolypczuk Laetitia, Marchand Laetitia, Bonnetot Sandrine, Fecamp Florian, Lozach Solen, Hervio Heath Dominique, Delbarre Ladrat Christine (2019). Mining of the biosynthetic mechanisms of Vibrio spp. polysaccharides and potential role in biofilm formation. CBM 13 - 13th Carbohydrate Bioengineering Meeting. 19-22 mai 2019, Toulouse. https://archimer.ifremer.fr/doc/00514/62605/
Pepin Jean-Francois, Bouget Jean-Francois, Chabirand Jean-Michel, Chasselin Leo, Costes Louis, Grizon James, Lejolivet Aurore, Le Noc Sandrine, Palvadeau Hubert, Schmitt Anne, Seugnet Jean-Luc, Soletchnik Patrick, Travers Marie-Agnes, Tourbiez Delphine, Guesdon Stephane (2019). Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental. Journées scientifiques et techniques Mer " (JST) : Journées de partage entre les experts de la biodiversité marine, AFB - Agence Française pour la Biodiversité. 11-12 juin 2019, Océanopolis Brest, France.
Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Phan My Vt, Cotten Matthew, Oude Munnik Bas B., Nieuwenhuijse David F., Koopmans Marion, Le Guyader Soizick (2019). Metagenomic approach to study norovirus diversity in sewage and oyster samples. 7th Meeting of The European Society for Virology (ESV). 28 April - 1 May 2019 in Rotterdam, the Netherlands.
Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Le Guyader Soizick (2019). Etude de la diversité des norovirus dans les eaux usées par la métagénomique. XXIe Journées Francophones de Virologie. 28 au 29 mars 2019 à l'ENS de Lyon.