Articles

Saad Jamal, Boulo Viviane, Goudenège David, Broquard Coralie, Andree Karl B., Auguste Manon, Petton Bruno, Labreuche Yannick, Tris Pablo, Furones Dolors, Gil Augusti, Vezzulli Luigi, Corno Gianluca, Di Cesare Andrea, Koechlin Hugo, Labadie-Lafforgue Emilie, Courtay Gaelle, Romatif Oceane, Pouzadoux Juliette, Escoubas Jean Michel, Munaron Dominique, Charriere Guillaume, Toulza Eve, Travers Agnes, Montagnani Caroline, Wegner Mathias K., Destoumieux Garzon Delphine. Vibrio are a potential source of novel colistin-resistance genes in European coastal environments. bioRxiv IN PRESS. Publisher's official version : https://doi.org/10.1101/2024.10.10.617683 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00921/103241/
Le Guyader Soizick, Ollivier Joanna, Parnaudeau Sylvain, Gauffriau Mathias, Papin Mathias, Stavrakakis Christophe, François Virginie, Vincent Hubert Francoise, Garry Pascal. Comparing Two Seawater Temperatures For Human Norovirus Depuration From Oysters. Journal of Food Protection IN PRESS. Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jfp.2024.100406 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00919/103130/
Sorée Marion, Lozach Solen, Kéomurdjian Natacha, Richard David, Hughes Alexandra, Delbarre-Ladrat Christine, Verrez-Bagnis Véronique, Rincé Alain, Passerini Delphine, Ritchie Jennifer M., Hervio Heath Dominique (2024). Virulence phenotypes differ between toxigenic Vibrio parahaemolyticus isolated from western coasts of Europe. Microbiological Research, 285, 127744 (11p.). Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.micres.2024.127744 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00888/100022/
Boxman Ingeborg L.A., Molin Ramia, Persson Sofia, Juréus Anna, Jansen Claudia C.C., Sosef Nils P., Le Guyader Soizick, Ollivier Joanna, Summa Maija, Hautaniemi Maria, Suffredini Elisabetta, Di Pasquale Simona, Myrmel Mette, Khatri Mamata, Jamnikar-Ciglenecki Urska, Kusar Darja, Moor Dominik, Butticaz Lisa, Lowther James A., Walker David I., Stapleton Tina, Simonsson Magnus, Dirks René A.M. (2024). An international inter-laboratory study to compare digital PCR with ISO standardized qPCR assays for the detection of norovirus GI and GII in oyster tissue. Food Microbiology, 120, 104478 (12p.). https://doi.org/10.1016/j.fm.2024.104478
Monnot M., Ollivier Joanna, Taligrot H., Garry Pascal, Cordier Clémence, Stavrakakis Christophe, Le Guyader Soizick, Moulin Philippe (2024). Retention of Virus Versus Surrogate, by Ultrafiltration in Seawater: Case Study of Norovirus Versus Tulane. Food And Environmental Virology, 16(1), 14-24. Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s12560-023-09574-z , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00869/98136/

Rapports

Rocq Sophie (2024). Etude sanitaire en vue du classement d’une zone de production de coquillages. Zone au large de la baie de Somme (80) - groupe 2 (coquillages bivalves fouisseurs). RBE/MASAE/LSEM 24-02. https://archimer.ifremer.fr/doc/00911/102325/
Chavanon Fabienne, Herlory Olivier, Marco-Miralles Francoise, Rocq Sophie (2024). Étude sanitaire de la zone 13.06.01 « Anse de Carteau Sud » groupe 2 (coquillages bivalves fouisseurs). Étude en vue du classement d’une zone de production de coquillages. ODE/UL/LER PAC 24-02. https://archimer.ifremer.fr/doc/00900/101199/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2024). Rapport d’activités 2023. Laboratoire Santé, Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages. https://archimer.ifremer.fr/doc/00900/101169/
Buchet Rémi, Allenou Jean-Pierre, Gabellec Raoul, Treguier Cathy, Rocq Sophie (2024). Etude sanitaire de la zone 56.08.2 « Baie de Quiberon » - groupes 2 et 3 (coquillages bivalves fouisseurs et non fouisseurs). ODE/UL/LERMPL/24-11. https://archimer.ifremer.fr/doc/00893/100479/
Serais Ophelie, Crottier Anaïs, Rocq Sophie, Lagarde Franck (2024). Procédure de déclenchement des alertes préventives REMI en Occitanie. Alertes « pluviométriques ». Date d’application : 01/06/2024. ODE/UL/LER/LR/24.07. https://archimer.ifremer.fr/doc/00892/100343/
Le Fur Ines, Costes Louis, Bruneau Audrey, Grouhel Anne, Rocq Sophie (2024). Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Charente-Maritime. Période 2021-2023. ODE/LITTORAL/LER/PC 24.01. https://doi.org/10.13155/100340
Serais Ophelie, Crottier Anaïs, Grouhel Anne, Cimiterra Nicolas, Munaron Dominique, Lagarde Franck, Rocq Sophie (2024). Évaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Région Occitanie. Période 2021-2023. ODE/UL/LER/LR/24.04. 97p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00891/100308/
Rocq Sophie, Kaelin Gaelle, Reynaud Yann (2024). Eléments d’aide à la décision pour le déclenchement d’alertes préventives dans le cadre du REMI. https://archimer.ifremer.fr/doc/00888/100040/
Buchet Remi, Allenou Jean-Pierre, Gabellec Raoul, Treguier Cathy, Rocq Sophie (2024). Etude sanitaire de la zone 56.08.1 « Baie de Plouharnel» - groupes 2 et 3 (coquillages bivalves fouisseurs et non fouisseurs). ODE/UL/LERMPL/24-10. https://archimer.ifremer.fr/doc/00886/99798/
Serais Ophelie, Crottier Anaïs (2024). Stratégie d’échantillonnage REMI en Occitanie - Année 2024. Réseau de surveillance microbiologique des zones de production de coquillages (REMI). ODE/UL/LER-LR/24.03. Version 1 du 30/05/2024. https://archimer.ifremer.fr/doc/00884/99613/
Le Fur Ines, Bruneau Audrey, Guesdon Stephane, Gueux Aurore, Piraud Aude, Costes Louis (2024). Qualité du Milieu Marin Littoral. Bulletin de la surveillance 2022. Départements de Charente-Maritime et de Vendée (sud). ODE/LITTORAL/LER-PC/24.001. https://archimer.ifremer.fr/doc/00882/99431/

Expertises / Avis

Normand Julien (2024). Avis sur l’ouverture à la pêche de la zone gisement à éclipse 50-08 "Est Cotentin - Ravenoville" (Moules). DDTM 50 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer de la Manche, Service Mer et Littoral, Pôle cultures marines, Cherbourg en Cotentin, Ref. Archivage Alfresco et Archimer Avis 24-054 - Votre courriel en date du 04/07/2024 et ses pièces jointes, 6p.https://archimer.ifremer.fr/doc/00901/101285/
Serais Ophelie, Rocq Sophie, Lemoine Maud (2024). Avis pour la transformation du lieu ponctuel « Avant Port de Leucate » en lieu surfacique pour les suivis REMI et REPHYTOX de la zone de pêche n°11.19 « Avant-port de Leucate ». DDPP 34 - Direction Départementale de la Protection des Populations de l’Hérault, Unité territoriale de Sète, Montpellier, Ref. Avis Ifremer 24-022 - votre courriel du 26 février 2024, 5p., 11p.https://archimer.ifremer.fr/doc/00891/100325/
Treguier Cathy, Schmitt Anne, Rocq Sophie (2024). Avis de l'Ifremer relatif à l'exploitation d'un gisement à éclipse, zone de production 44.09, estuaires de la Loire, groupe 2. DDTM 44 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer de Loire-Atlantique, Délégation à la Mer et au Littoral, Nantes, Ref. LER/MPL/24.18/Na et Réf. Avis P9 : 24.10, 5p., 6p.https://archimer.ifremer.fr/doc/00881/99277/
Lebon Fabien, Devreker David, Normand Julien, Reynaud Yann, Lefebvre Alain (2024). Avis de l’Ifremer portant sur la récolte par les pêcheurs à pied de moules échouées au-delà des gisements, en dehors des bâches d’eau. DDTM 62 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer du Pas-de-Calais, Délégation à la Mer et au Littoral, Service des Affaires Maritimes et du Littoral, Unité encadrement et contrôle des activités maritimes, Pôle cultures marines, Boulogne-sur-Mer, Ref. FP/FP/23-1027 - DC/MMN/2024.009, 2p., 1p., 4p., 2p.https://archimer.ifremer.fr/doc/00872/98414/

Communications sans actes

Troja Fulvia, Schaeffer Julien, Desdouits Marion, Indio Valentina, de Cesare Alessandra, Le Guyader Soizick (2024). Use of shotgun metagenomic for the analysis of shellfish virome: Comparative assessment of the performances of three capture enrichment kits. FSM 2024 - Food System Microbiomes. 14-17 May 2024, Torino, Italy.