Godino Sanchez Alisson, Serghine Joelle, Le Mennec Cecile, Noel Cyril, Schaeffer Julien, Goraguer Herle, Vincent Cécile, Vitre Thomas, Le Guyader Soizick, Gourmelon Michele (2024). Grey and harbor seals in France (mainland and Saint-Pierre et Miquelon): microbial communities and identification of a microbial source tracking seal marker . Frontiers in Microbiology , 15, 1484094. (17p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2024.1484094 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00925/103668/

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2024). Rapport d’activités 2023. Laboratoire Santé, Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00900/101169/

Euller Gabriel, Le Mennec Cecile, Schaeffer Julien, Zeng Xi-Lei, Ettayebi Khalil, Atmar Robert L., Le Guyader Soizick, Estes Mary K., Desdouits Marion (2023). Human Sapovirus Replication in Human Intestinal Enteroids . Journal of Virology , 97(4), e00383-23 (14p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/jvi.00383-23 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00839/95134/

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2023). Rapport d’activités 2022. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence Microbiologie des coquillages . RBE/MASAE/LSEM 23-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00831/94264/

Desdouits Marion, Polo Montero David, Le Mennec Cecile, Strubbia Sofia, Zeng Xi-Lei, Ettayebi Khalil, Atmar Robert L., Estes Mary K., Le Guyader Soizick (2022). Use of Human Intestinal Enteroids to Evaluate Persistence of Infectious Human Norovirus in Seawater . Emerging Infectious Diseases , 28(7), 1475-1479 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3201/eid2807.220219 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00786/89824/

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2022). Rapport d'activités 2021. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence Microbiologie des coquillages . RBE/MASAE/LSEM 22-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00760/87250/

Desdouits Marion, Piquet Jean-Come, Jousse Sarah, Wacrenier Candice, Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Rocq Sophie, Bigault Lionel, Contrant Maud, Garry Pascal, Blanchard Yannick, Le Guyader Soizick (2021). Utiliser les coquillages pour surveiller la contamination du littoral par SARS-CoV-2 ? SFM 2021 - 16e congrès national de la Société Française de Microbiologie « MICROBES ». 22 au 24 septembre 2021, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00727/83880/

Desdouits Marion, Piquet Jean-Come, Wacrenier Candice, Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Jousse Sarah, Rocq Sophie, Bigault Lionel, Contrant Maud, Garry Pascal, Chavanon Fabienne, Gabellec Raoul, Lamort Laure, Lebrun Luc, Le Gall Patrik, Meteigner Claire, Schmitt Anne, Seugnet Jean-Luc, Serais Ophelie, Peltier Cécile, Bressolette-Bodin Céline, Blanchard Yannick, Le Guyader Soizick (2021). Can shellfish be used to monitor SARS-CoV-2 in the coastal environment? Science Of The Total Environment , 778, 146270 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.146270 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00684/79569/

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2021). Rapport d'activités 2020. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . RBE/SGMM/LSEM 21-03 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00691/80332/

Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Wacrenier Candice, Le Mennec Cecile, Garry Pascal, Desdouits Marion, Le Guyader Soizick (2020). Metagenomic to evaluate norovirus genomic diversity in oysters: Impact on hexamer selection and targeted capture-based enrichment . International Journal Of Food Microbiology , 323, 108588 (13p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108588 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00614/72575/

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2020). Rapport d’activités 2019. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . RBE/SG2M/LSEM . https://archimer.ifremer.fr/doc/00615/72671/

Desdouits Marion, Garry Pascal, Gourmelon Michele, Hervio Heath Dominique, Hubert Francoise, Kaelin Gaelle, Kergaravat Cedric, Le Mennec Cecile, Le Guyader Soizick, Loiseau Veronique, Lozach Solen, Maillot Jessica, Ollivier Joanna, Parnaudeau Sylvain, Piquet Jean-Come, Quenot Emmanuelle, Rocq Sophie, Schaeffer Julien, Serghine Joelle, Vallade Emilie, Veron Antoine, Wacrenier Candice (2019). Rapport d’activités 2018 – Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. RBE/SG2M/LSEM 18-1 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00491/60218/

Lapegue Sylvie, Bechemin Christian, Le Guyader Soizick, Stavrakakis Christophe, Rivet Florence (2018). Rapport d’activités 2017 de l’unité SG2M, Santé Génétique et Microbiologie des Mollusques . R.RBE/SG2M/2018-01 .

Monnot Mathias, Pinchai Chamaiporn, Cordier Clemence, Lefevre Sébastien, Le Mennec Cecile, Le Guyader Soizick, Stavrakakis Christophe, Moulin Philippe (2018). Concentration by membrane filtration before wet air oxidation for full intensified wastewater treatment . Euromembranes 2018. 9th - 13th July 2018, Valencia .

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2018). Rapport d’activités 2017. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00465/57686/

Garry Pascal, Hervio Heath Dominique, Le Guyader Soizick (2017). Rapport d’activités 2016. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00433/54493/

Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Rumebe Myriam, Le Saux Jean-Claude, Piquet Jean-Come, Le Guyader Soizick (2017). Follow-Up of Norovirus Contamination in an Oyster Production Area Linked to Repeated Outbreaks . Food And Environmental Virology , 9(1), 54-61 . https://doi.org/10.1007/s12560-016-9260-6

Garry Pascal, Le Saux Jean-Claude, Hervio Heath Dominique, Le Guyader Soizick (2016). Rapport d’activités 2015. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00380/49138/

Lapegue Sylvie, Renault Tristan, Bechemin Christian, Le Guyader Soizick, Stavrakakis Christophe, Rivet Florence (2016). Rapport d'activités 2015 de l'Unité SG2M : Santé, Génétique et Microbiologie des Mollusques . https://archimer.ifremer.fr/doc/00319/43055/

Marques Souza Doris Sobral, Miura Takayuki, Le Mennec Cecile, Monte Barardi Celia Regina, Le Guyader Francoise S. (2015). Retention of Rotavirus Infectivity in Mussels Heated by Using the French Recipe Moules Marinières . Journal Of Food Protection , 78(11), 2064-2069 . Publisher's official version : https://doi.org/10.4315/0362-028X.JFP-15-191 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00297/40783/

Renault Tristan, Lapegue Sylvie, Le Guyader Soizick, Hatt Philippe-Jacques, Rivet Florence (2015). Rapport d'activités 2014 de l'Unité SG2M. Santé, Génétique et Microbiologie des mollusques . https://archimer.ifremer.fr/doc/00283/39455/

Parnaudeau Sylvain, Le Mennec Cecile, Miura Takayuki, Le Saux Jean-Claude, Le Guyader Soizick (2014). Virus entériques humains et coquillages . Bulletin de l'Académie vétérinaire de France , 167(3), 227-233 . Publisher's official version : https://doi.org/10.4267/2042/54194 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00317/42849/

Cantet Franck, Hervio-Heath Dominique, Caro A, Le Mennec Cecile, Monteil Caroline, Quemere Catherine, Jolivet-Gougeon Anne, Colwell Rita R., Monfort Patrick (2013). Quantification of Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio cholerae in French Mediterranean coastal lagoons . Research In Microbiology , 164(8), 867-874 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.resmic.2013.06.005 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00148/25890/

Mieszkin Sophie, Caprais Marie-Paule, Le Mennec Cecile, Le Goff Manon, Edge T. A., Gourmelon Michele (2013). Identification of the origin of faecal contamination in estuarine oysters using Bacteroidales and F-specific RNA bacteriophage markers . Journal Of Applied Microbiology , 115(3), 897-907 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/jam.12260 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00153/26426/

Pommepuy Monique, Dupied Simon, Bougeard Morgane, Le Saux Jean-Claude, Le Mennec Cecile, Gueguen M., Stanisiere Jean-Yves, Le Guyader Soizick (2011). Etude des cinétiques de contamination et de décontamination de Crassostrea gigas en Escherichia coli en bassin .

Bougeard Morgane, Le Saux Jean-Claude, Teillon Anna, Belloir Jerome, Le Mennec Cecile, Thome Sterenn, Durand Gael, Pommepuy Monique (2011). Combining modeling and monitoring to study fecal contamination in a small rural catchment . Journal Of Water And Health , 9(3), 467-482 . https://doi.org/10.2166/wh.2011.189

Ifremer, Université de Nantes (2010). Gestion globale des ressources marines et des risques dans les espaces côtiers. Gerrico. Volume 1 : rapport de synthèse. Volume 2 : Fiches actions par axe . https://archimer.ifremer.fr/doc/00136/24733/

Gourmelon Michele, Caprais Marie-Paule, Le Mennec Cecile, Mieszkin Sophie, Ponthoreau C., Gendronneau M. (2010). Application of library-independent microbial source tracking methods for identifying the sources of faecal contamination in coastal areas . Water Science And Technology , 61(6), 1401-1409 . Publisher's official version : https://doi.org/10.2166/wst.2010.033 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00003/11384/

Lassus Patrick (ed.), Abarnou Alain, Arnich Nathalie, Amzil Zouher, Biré Ronel, Frémy Jean-Marc, Hervio Heath Dominique, Hess Philipp, Massé Anthony, Pommepuy Monique (2009). Proceedings of the seventh International Conference on Molluscan Shellfish Safety - ICMSS09. Nantes, France, 14-19 June 2009 .

Caprais Marie-Paule, Le Mennec Cecile, Pommepuy Monique, Le Saux Jean-Claude, Gourmelon Michele (2009). Potential of F-specific RNA bacteriophages to discriminate sources of faecal pollution in French shellfish . ICMSS09 – Nantes, France – June 2009 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17749/

Caprais Marie-Paule, Gourmelon Michele, Le Mennec Cecile, Joubrel Rozenn (2008). Identification de l'origine de la contamination observée en baie de La Baule : Première partie de l'étude . EMP/MIC/RST05.2008 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00622/73452/

Gourmelon Michele, Caprais Marie-Paule, Segura Raphael, Le Mennec Cecile, Lozach Solen, Piriou Jean-Yves, Rince A (2007). Evaluation of two library-independent microbial source tracking methods to identify sources of fecal contamination in french estuaries . Applied and environmental microbiology , 73(15), 4857-4866 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.03003-06 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3535/

Le Saux Jean-Claude, Hervio Heath Dominique, Pommepuy Monique, Le Guyader Soizick (2007). Toxi-infections alimentaires collectives à coquillages et expertise crise d'Arcachon - Année 2006 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00306/41708/

Monfort Patrick, Hervio Heath Dominique, Caprais Marie-Paule, Pommepuy Monique, Annezo Jean-Pierre, Loaec Solen, Le Mennec Cecile, Guillerm Emmanuelle, Boulben Sylviane, Bilien Gwenael, Bonsor Robert, Porter Jonathan, Pickup Roger (2006). Le bassin versant du Bélon : vers une restauration durable de la qualité bactériologique des eaux estuariennes . RST/LER/FBN/CC/06.10 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00200/31077/

Gourmelon Michele, Montet M, Lozach Solen, Le Mennec Cecile, Pommepuy Monique, Beutin L, Vernozy Rozand C (2006). First isolation of Shiga toxin 1d producing Escherichia coli variant strains in shellfish from coastal areas in France . Journal of Applied Microbiology , 100(1), 85-97 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2005.02753.x , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1096/

Caprais Marie-Paule, Le Mennec Cecile, Le Saux Jean-Claude, Pommepuy Monique (2004). Etude sur le niveau de contamination en bactériophages F+ ARN spécifiques des zones d'élevage conchylicole classées . Etude ECOLlPHAGES .

Caprais Marie-Paule, Le Mennec Cecile, Pommepuy Monique (2004). Recherche des bactériophages en milieu marin. Cas des coquillages . DEL/MP/Brest/RST/01.004 .

Pommepuy Monique, Dumas Franck, Caprais Marie-Paule, Camus Patrick, Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Haugarreau Larissa, Sarrette B, Vilagines P, Pothier P, Kholi E, Le Guyader Soizick (2004). Sewage impact on shellfish microbial contamination . Water Science And Technology , 50(1), 117-124 .

Le Saux Jean-Claude, Pommepuy Monique, Caprais Marie-Paule, Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Le Guyader Francoise (2003). Evaluation et adaptation d'un système de purification des coquillages pour l'élimination des virus entériques . Convention OFIMER / CNC N°054-01C . https://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15545/

Gourmelon Michele, Montet Mp, Loaec Solen, Le Mennec Cecile, Pommepuy Monique, Vernoy-Rozand C (2003). Recherche des Escherichia coli vérotoxiques (VTEC) dont E. coli O157 : H7 dans l'environnement marin (coquillages) . https://archimer.ifremer.fr/doc/00106/21697/

Pommepuy Monique, Caprais Marie-Paule, Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Le Guyader Francoise, Camus Patrick, Dimeet Joel, Treguier Cathy, Bon Fabienne, Pothier Pierre, Kohli e Evelyne, Brachet R., Flahault A., Sarrette B., Vilagines P. (2002). Contamination virale et indicateurs du risque (Programme Liteau) . Contrat N° LT98036 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15549/

Pommepuy Monique, Caprais Marie-Paule, Le Saux Jean-Claude, Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Madec Yvon, Monier Martial, Brest Goulven, Le Guyader Francoise (2002). Evaluation of viral shellfish depuration in a semi-professional tank . 4th International Conference on Molluscan Shellfish Safety, pp. 485-499 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1208/

Hervio Heath Dominique, Loaec Solen, Le Mennec Cecile, Pommepuy Monique, Le Gal Dominique, Rocher Gregory, Le Saux Jean-Claude (2002). Recherche de Vibrio parahaemolyticus dans la rivière du Belon . RST.DEL/02.01/Brest .

(2001) Purification virale des coquillages - Phase 1 : Etude préliminaire . Contrat DAGL - Convention 2001 - 44-70 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15544/