Julien Schaeffer

Julien Schaeffer

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Employeur : Ifremer

Site : Nantes

Adresse postale : Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03

URL : https://annuaire.ifremer.fr/cv/17043/

Jeux de données

2021

2020

Desdouits Marion, Wacrenier Candice, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Le Guyader Soizick (2020). Raw deep-sequencing data of targeted metagenomics to study the diversity of norovirus GII in shellfish. IFREMER. https://doi.org/10.12770/6e0c6687-22fe-47e0-bc67-81dde633d25b
Schaeffer Julien (2020). Metagenomic to evaluate norovirus genomic diversity in oysters: Impact on hexamer selection and targeted capture-based enrichment. IFREMER. https://doi.org//10.12770/2b9e883f-d4f4-4a0e-b4ee-dd30fcfa16a4
Schaeffer Julien (2020). Metagenomic analysis of clams from Sanaga river in Cameroon. IFREMER. https://doi.org/10.12770/5abfae46-aca4-49ad-b1bc-4fe5a1ba4454

2019

Schaeffer Julien (2019). Diversité des virus entériques humains dans des huîtres contaminées avec une eau usée. https://sextant.ifremer.fr/record/52bfc95e-6877-42f1-86f0-42602ba61b9f/


Bibliographie

2023

Euller Gabriel, Le Mennec Cecile, Schaeffer Julien, Zeng Xi-Lei, Ettayebi Khalil, Atmar Robert L., Le Guyader Soizick, Estes Mary K., Desdouits Marion (2023). Human Sapovirus Replication in Human Intestinal Enteroids . Journal of Virology , 97(4), e00383-23 (14p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/jvi.00383-23 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00839/95134/
Schaeffer Julien, Desdouits Marion, Besnard Alban, Le Guyader Soizick (2023). Looking into sewage: how far can metagenomics help to detect human enteric viruses? Frontiers In Microbiology , 14, 1161674 (17p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1161674 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00834/94622/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2023). Rapport d’activités 2022. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence Microbiologie des coquillages . RBE/MASAE/LSEM 23-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00831/94264/

2022

Munk Patrick, Brinch Christian, Duus Møller Frederik, Petersen Thomas N., Hendriksen Rene S., Seyfarth Anne Mette, Kjeldgaard Jette S., Svendsen Christina Aaby, Van Bunnik Bram, Berglund Fanny, Bego Artan, Power Pablo, Rees Catherine, Lambrinidis Dionisia, Neilson Elizabeth Heather Jakobsen, Gibb Karen, Coventry Kris, Collignon Peter, Cassar Susan, Allerberger Franz, Begum Anowara, Hossain Zenat Zebin, Worrell Carlon, Vandenberg Olivier, Pieters Ilse, Victorien Dougnon Tamègnon, Gutierrez Angela Daniela Salazar, Soria Freddy, Grujić Vesna Rudić, Mazalica Nataša, Rahube Teddie O., Tagliati Carlos Alberto, Rodrigues Dalia, Oliveira Guilherme, de Souza Larissa Camila Ribeiro, Ivanov Ivan, Juste Bonkoungou Isidore, Oumar Traoré, Sopheak Thet, Vuthy Yith, Ngandijo Antoinette, Nzouankeu Ariane, Olivier Ziem A. Abah Jacques, Yost Christopher K., Kumar Pratik, Brar Satinder Kaur, Tabo Djim-Adjim, Adell Aiko D., Paredes-Osses Esteban, Martinez Maria Cristina, Cuadros-Orellana Sara, Ke Changwen, Zheng Huanying, Baisheng Li, Lau Lok Ting, Chung Teresa, Jiao Xiaoyang, Yu Yongjie, Jiayong Zhao, Morales Johan F. Bernal, Valencia Maria Fernanda, Donado-Godoy Pilar, Coulibaly Kalpy Julien, Hrenovic Jasna, Jergović Matijana, Karpíšková Renáta, Deogratias Zozo Nyarukweba, Elsborg Bodil, Hansen Lisbeth Truelstrup, Jensen Pernille Erland, Abouelnaga Mohamed, Salem Mohamed Fathy, Koolmeister Marliin, Legesse Mengistu, Eguale Tadesse, Heikinheimo Annamari, Le Guyader Soizick, Schaeffer Julien, Villacis Jose Eduardo, Sanneh Bakary, Malania Lile, Nitsche Andreas, Brinkmann Annika, Schubert Sara, Hesse Sina, Berendonk Thomas U., Saba Courage Kosi Setsoafia, Mohammed Jibril, Feglo Patrick Kwame, Banu Regina Ama, Kotzamanidis Charalampos, Lytras Efthymios, Lickes Sergio A., Kocsis Bela, Solymosi Norbert, Thorsteinsdottir Thorunn R., Hatha Abdulla Mohamed, Ballal Mamatha, Bangera Sohan Rodney, Fani Fereshteh, Alebouyeh Masoud, Morris Dearbhaile, O’connor Louise, Cormican Martin, Moran-Gilad Jacob, Battisti Antonio, Diaconu Elena Lavinia, Corno Gianluca, Di Cesare Andrea, Alba Patricia, Hisatsune Junzo, Yu Liansheng, Kuroda Makoto, Sugai Motoyuki, Kayama Shizuo, Shakenova Zeinegul, Kiiyukia Ciira, Ng’eno Eric, Raka Lul, Jamil Kazi, Fakhraldeen Saja Adel, Alaati Tareq, Bērziņš Aivars, Avsejenko Jeļena, Kokina Kristina, Streikisa Madara, Bartkevics Vadims, Matar Ghassan M., Daoud Ziad, Pereckienė Asta, Butrimaite-Ambrozeviciene Ceslova, Penny Christian, Bastaraud Alexandra, Rasolofoarison Tiavina, Collard Jean-Marc, Samison Luc Hervé, Andrianarivelo Mala Rakoto, Banda Daniel Lawadi, Amin Arshana, Rajandas Heraa, Parimannan Sivachandran, Spiteri David, Haber Malcolm Vella, Santchurn Sunita J., Vujacic Aleksandar, Djurovic Dijana, Bouchrif Brahim, Karraouan Bouchra, Vubil Delfino Carlos, Pal Pushkar, Schmitt Heike, Van Passel Mark, Jeunen Gert-Jan, Gemmell Neil, Chambers Stephen T., Mendoza Fania Perez, Huete-Pιrez Jorge, Vilchez Samuel, Ahmed Akeem Olayiwola, Adisa Ibrahim Raufu, Odetokun Ismail Ayoade, Fashae Kayode, Sørgaard Anne-Marie, Wester Astrid Louise, Ryrfors Pia, Holmstad Rune, Mohsin Mashkoor, Hasan Rumina, Shakoor Sadia, Gustafson Natalie Weiler, Schill Claudia Huber, Rojas Maria Luz Zamudio, Velasquez Jorge Echevarria, Magtibay Bonifacio B., Catangcatang Kris, Sibulo Ruby, Yauce Felipe Campos, Wasyl Dariusz, Manaia Celia, Rocha Jaqueline, Martins Jose, Álvaro Pedro, Di Yoong Wen Doris, Shin Hanseob, Hur Hor-Gil, Yoon Sukhwan, Bosevska Golubinka, Kochubovski Mihail, Cojocaru Radu, Burduniuc Olga, Hong Pei-Ying, Perry Meghan Rose, Gassama Amy, Radosavljevic Vladimir, Tay Moon Y. F., Zuniga-Montanez Rogelio, Wuertz Stefan, Gavačová Dagmar, Pastuchová Katarína, Truska Peter, Trkov Marija, Keddy Karen, Esterhuyse Kerneels, Song Min Joon, Quintela-Baluja Marcos, Lopez Mariano Gomez, Cerdà-Cuéllar Marta, Perera R. R. D. P., Bandara N. K. B. K. R. G. W., Premasiri H. I., Pathirage Sujatha, Charlemagne Kareem, Rutgersson Carolin, Norrgren Leif, Örn Stefan, Boss Renate, Van Der Heijden Tanja, Hong Yu-Ping, Kumburu Happiness Houka, Mdegela Robinson Hammerthon, Hounmanou Yaovi Mahuton Gildas, Chonsin Kaknokrat, Suthienkul Orasa, Thamlikitkul Visanu, de Roda Husman Ana Maria, Bidjada Bawimodom, Njanpop-Lafourcade Berthe-Marie, Nikiema-Pessinaba Somtinda Christelle, Levent Belkis, Kurekci Cemil, Ejobi Francis, Kalule John Bosco, Thomsen Jens, Obaidi Ouidiane, Jassim Laila Mohamed, Moore Andrew, Leonard Anne, Graham David W., Bunce Joshua T., Zhang Lihong, Gaze William H., Lefor Brett, Capone Drew, Sozzi Emanuele, Brown Joe, Meschke John Scott, Sobsey Mark D., Davis Michael, Beck Nicola Koren, Sukapanpatharam Pardi, Truong Phuong, Lilienthal Ronald, Kang Sanghoon, Wittum Thomas E., Rigamonti Natalia, Baklayan Patricia, Van Chinh Dang, Tran Doan Minh Nguyen, Do Phuc Nguyen, Kwenda Geoffrey, Larsson D. G. Joakim, Koopmans Marion, Woolhouse Mark, Aarestrup Frank M. (2022). Genomic analysis of sewage from 101 countries reveals global landscape of antimicrobial resistance . Nature Communications , 13(1), 7251 (16p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1038/s41467-022-34312-7 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00808/91994/
Vincent-Hubert Francoise, Wacrenier Candice, Desdouits Marion, Jousse Sarah, Schaeffer Julien, Le Mehaute Phillipe, Nakache-Danglot Frederique, Le Guyader Soizick, Obepine Consortium (2022). Development of passive samplers for the detection of SARS-CoV-2 in sewage and seawater: Application for the monitoring of sewage . Science Of The Total Environment , 833, 155139 (8p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.155139 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00765/87737/
Barbe Laure, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Jousse Sarah, Wurtzer Sébastien, Moulin Laurent, Le Guyader Soizick, Desdouits Marion (2022). SARS-CoV-2 Whole-Genome Sequencing Using Oxford Nanopore Technology for Variant Monitoring in Wastewaters . Frontiers In Microbiology , 13, 889811 (14p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.889811 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00775/88715/
Ollivier Joanna, Lowther James, Desdouits Marion, Schaeffer Julien, Wacrenier Candice, Oude Munnink Bas B., Besnard Alban, Mota Batista Frederico, Stapleton Tina, Schultz Anna Charlotte, Aarestrup Frank, Koopmans Marion, de Graaf Miranda, Le Guyader Soizick (2022). Application of Next Generation Sequencing on Norovirus‐contaminated oyster samples . EFSA Supporting Publications , 19(6), EN-7348E (144p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2022.EN-7348 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00776/88826/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2022). Rapport d'activités 2021. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence Microbiologie des coquillages . RBE/MASAE/LSEM 22-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00760/87250/

2021

Bonny Patrice, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Desdouits Marion, Essia Ngang Jean Justin, Le Guyader Soizick (2021). Human and Animal RNA Virus Diversity Detected by Metagenomics in Cameroonian Clams . Frontiers In Microbiology , 12, 770385 (15p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.770385 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00737/84861/
Garry Pascal, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Jousse Sarah, Ccos Obepine , Le Guyader Soizick (2021). Intérêt des essais interlaboratoires dans la validation d’un indicateur national de suivi épidémiologique de l’épidémie de SARS-CoV-2 par les eaux usées (en France) . SFM 2021 - 16e congrès national de la Société Française de Microbiologie « MICROBES ». 22 au 24 septembre 2021, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00727/83882/
Bonny Patrice, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Desdouits Marion, Essia Ngang Jean Justin, Le Guyader Soizick (2021). Diversité des virus entériques dans les palourdes du fleuve SANAGA au Cameroun . SFM 2021 - 16e congrès national de la Société Française de Microbiologie « MICROBES ». 22 au 24 septembre 2021, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00727/83884/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2021). Rapport d'activités 2020. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . RBE/SGMM/LSEM 21-03 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00691/80332/

2020

Sala Claudia, Mordhorst Hanne, Grützke Joesphine, Brinkmann Annika, Petersen Thomas N, Poulsen Casper, Cotter Paul D, Crispie Fiona, Ellis Richard J, Castellani Gastone, Amid Clara, Hakhverdyan Mikhayil, Le Guyader Soizick, Manfreda Gerardo, Mossong Joël, Nitsche Andreas, Ragimbeau Catherine, Schaeffer Julien, Schlundt Joergen, Tay Moon Y. F., Aarestrup Frank M., Hendriksen Rene S., Pamp Sünje Johanna, de Cesare Alessandra (2020). Metagenomics-Based Proficiency Test of Smoked Salmon Spiked with a Mock Community . Microorganisms , 8(12), 1861 (16p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/microorganisms8121861 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00664/77615/
Desdouits Marion, Wacrenier Candice, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Le Guyader Soizick (2020). A Targeted Metagenomics Approach to Study the Diversity of Norovirus GII in Shellfish Implicated in Outbreaks . Viruses-basel , 12(9), 978 (17p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/v12090978 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00646/75831/
Bonny Patrice, Desdouits Marion, Schaeffer Julien, Garry Pascal, Essia Ngang Jean Justin, Le Guyader Soizick (2020). Contamination of Clams with Human Norovirus and a Novel Hepatitis A Virus in Cameroon . Food And Environmental Virology , 12(3), 274-277 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s12560-020-09432-2 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00635/74745/
Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Wacrenier Candice, Le Mennec Cecile, Garry Pascal, Desdouits Marion, Le Guyader Soizick (2020). Metagenomic to evaluate norovirus genomic diversity in oysters: Impact on hexamer selection and targeted capture-based enrichment . International Journal Of Food Microbiology , 323, 108588 (13p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108588 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00614/72575/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2020). Rapport d’activités 2019. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . RBE/SG2M/LSEM . https://archimer.ifremer.fr/doc/00615/72671/
Boukerb Amine Mohamed, Schaeffer Julien, Serghine Joelle, Carrier Gregory, Le Guyader Soizick, Gourmelon Michele (2020). Complete Genome Sequence of Campylobacter armoricus CA639, Which Carries Two Plasmids, Compiled Using Oxford Nanopore and Illumina Sequencing Technologies . Microbiology Resource Announcements , 9(1), e01309-19 (3p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/MRA.01309-19 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00600/71164/

2019

Strubbia Sofia, Phan My V. T., Schaeffer Julien, Koopmans Marion, Cotten Matthew, Le Guyader Soizick (2019). Characterization of Norovirus and Other Human Enteric Viruses in Sewage and Stool Samples Through Next-Generation Sequencing . Food And Environmental Virology , 11(4), 400-409 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s12560-019-09402-3 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00512/62332/
Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Oude Munnink Bas B., Besnard Alban, Phan My V. T., Nieuwenhuijse David F., de Graaf Miranda, Schapendonk Claudia M. E., Wacrenier Candice, Cotten Matthew, Koopmans Marion P. G., Le Guyader Soizick (2019). Metavirome Sequencing to Evaluate Norovirus Diversity in Sewage and Related Bioaccumulated Oysters . Frontiers In Microbiology , 10(2394), 13p. Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.02394 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00586/69765/
Schaeffer Julien, Besnard Alban, Strubbia Sofia, Le Guyader Soizick (2019). Enteric virus diversity in sewages collected during last decade . 7th Meeting of The European Society for Virology (ESV). 28 April - 1 May 2019 in Rotterdam, the Netherlands .
Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Phan My Vt, Cotten Matthew, Oude Munnik Bas B., Nieuwenhuijse David F., Koopmans Marion, Le Guyader Soizick (2019). Metagenomic approach to study norovirus diversity in sewage and oyster samples . 7th Meeting of The European Society for Virology (ESV). 28 April - 1 May 2019 in Rotterdam, the Netherlands .
Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Le Guyader Soizick (2019). Etude de la diversité des norovirus dans les eaux usées par la métagénomique . XXIe Journées Francophones de Virologie. 28 au 29 mars 2019 à l'ENS de Lyon .

2018

Schaeffer Julien, Treguier Cathy, Piquet Jean-Come, Gachelin Sonia, Cochennec-Laureau Nathalie, Le Saux Jean-Claude, Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2018). Improving the efficacy of sewage treatment decreases norovirus contamination in oysters . International Journal Of Food Microbiology , 286, 1-5 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2018.07.016 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00450/56140/
Schaeffer Julien, Treguier Cathy, Le Guyader Soizick, Gachelin Sonia (2018). Station d'épuration modernisée: qualité des coquillages améliorée . Journée pour la santé, l'environnement et la microbiologie 2018. 18 octobre 2018, Nantes .
Lapegue Sylvie, Bechemin Christian, Le Guyader Soizick, Stavrakakis Christophe, Rivet Florence (2018). Rapport d’activités 2017 de l’unité SG2M, Santé Génétique et Microbiologie des Mollusques . R.RBE/SG2M/2018-01 .
Miura Takayuki, Schaeffer Julien, Le Saux Jean-Claude, Le Mehaute Philippe, Le Guyader Soizick (2018). Virus Type-Specific Removal in a Full-Scale Membrane Bioreactor Treatment Process . Food And Environmental Virology , 10(2), 176-186 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s12560-017-9330-4 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00414/52548/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2018). Rapport d’activités 2017. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00465/57686/
Polo David, Schaeffer Julien, Teunis Peter, Buchet Vincent, Le Guyader Soizick (2018). Infectivity and RNA Persistence of a Norovirus Surrogate, the Tulane Virus, in Oysters . Frontiers In Microbiology , 9(716), 8p. Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.00716 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00436/54736/

2017

Garry Pascal, Hervio Heath Dominique, Le Guyader Soizick (2017). Rapport d’activités 2016. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00433/54493/

2016

Polo David, Schaeffer Julien, Fournet Nelly, Le Saux Jean-Claude, Parnaudeau Sylvain, McLeod Catherine, Le Guyader Soizick (2016). Digital PCR for Quantifying Norovirus in Oysters Implicated in Outbreaks, France . Emerging Infectious Diseases , 22(12), 2189-2191 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3201/eid2212.160841 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00359/46971/
Garry Pascal, Le Saux Jean-Claude, Hervio Heath Dominique, Le Guyader Soizick (2016). Rapport d’activités 2015. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00380/49138/
Lapegue Sylvie, Renault Tristan, Bechemin Christian, Le Guyader Soizick, Stavrakakis Christophe, Rivet Florence (2016). Rapport d'activités 2015 de l'Unité SG2M : Santé, Génétique et Microbiologie des Mollusques . https://archimer.ifremer.fr/doc/00319/43055/

2015

Treguier Cathy, Schaeffer Julien, Le Saux Jean-Claude, Le Guyader Soizick, Cochennec-Laureau Nathalie (2015). Contamination des coquillages par les norovirus en rivière d'Auray en lien avec la rénovation d'une station d'épuration littorale . 31ème Salon de la conchyliculture et des cultures marines. 8 et 9 septembre 2015, Vannes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00312/42358/
Treguier Cathy, Schaeffer Julien, Le Saux Jean-Claude, Le Guyader Soizick, Cochennec-Laureau Nathalie (2015). Contamination des coquillages par les norovirus en rivière d'Auray en lien avec la rénovation d'une station d'épuration littorale . 2nde édition du colloque "Qualité sanitaire des eaux de baignade et conchylicoles"- RiskManche. 3 décembre 2015, Brest .
Drouaz Najoua, Schaeffer Julien, Farkas Tibor, Le Pendu Jacques, Le Guyader Soizick (2015). Tulane Virus as a Potential Surrogate To Mimic Norovirus Behavior in Oysters . Applied And Environmental Microbiology , 81(15), 5249-5256 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.01067-15 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00275/38633/
Renault Tristan, Lapegue Sylvie, Le Guyader Soizick, Hatt Philippe-Jacques, Rivet Florence (2015). Rapport d'activités 2014 de l'Unité SG2M. Santé, Génétique et Microbiologie des mollusques . https://archimer.ifremer.fr/doc/00283/39455/
Schaeffer Julien, Treguier Cathy, Le Saux Jean-Claude, Le Guyader Soizick (2015). La rénovation d’une station d'épuration : quel impact sur la contamination virale des coquillages ? QSPA 2015 Colloque Qualité et Sécurité des Produits Aquatiques, 17, 18-19 Juin 2015, Boulogne-sur-Mer .
Treguier Cathy, Schaeffer Julien, Le Saux Jean-Claude, Cochennec-Laureau Nathalie, Le Guyader Soizick (2015). Contamination des coquillages par les norovirus en rivière d'Auray (Norocoqauray) . RST/LER/MPL/15.08 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00267/37778/

2014

Grodzki Marco, Schaeffer Julien, Piquet Jean-Come, Le Saux Jean-Claude, Cheve Julien, Ollivier Joanna, Le Pendu Jacques, Le Guyader Soizick (2014). Bioaccumulation Efficiency, Tissue Distribution, and Environmental Occurrence of Hepatitis E Virus in Bivalve Shellfish from France . Applied And Environmental Microbiology , 80(14), 4269-4276 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.00978-14 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31501/

2013

Schaeffer Julien, Le Saux Jean-Claude, Lora Monica, Atmar Robert L., Le Guyader Soizick (2013). Norovirus contamination on French marketed oysters . International Journal Of Food Microbiology , 166(2), 244-248 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2013.07.022 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00152/26367/
Benabbes Laila, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Parnaudeau Sylvain, Rhaissi Houria, Nourlil Jalal, Le Guyader Soizick (2013). Norovirus and Other Human Enteric Viruses in Moroccan Shellfish . Food And Environmental Virology , 5(1), 35-40 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s12560-012-9095-8 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00130/24102/
Ventrone Iole, Schaeffer Julien, Ollivier Joanna, Parnaudeau Sylvain, Pepe Tiziana, Le Pendu Jacques, Le Guyader Soizick (2013). Chronic or accidental exposure of oysters to Norovirus: is there any difference in contamination? Journal Of Food Protection , 76(3), 505-509 . https://doi.org/10.4315/0362-028X.JFP-12-296
Le Saux Jean-Claude, Lora M., Schaeffer Julien, Poiraud G., Le Guyader Soizick (2013). Prévalence des norovirus dans les huîtres mises sur le marché dans le Département de la Vendée. Période février 2010-mai 2011 . Convention DGAL 2010-2011 RI/MIC-LNR/ EV 02.2012 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00185/29650/

2011

Sima Laura C., Schaeffer Julien, Le Saux Jean-Claude, Parnaudeau Sylvain, Elimelech Menachem, Le Guyader Soizick (2011). Calicivirus Removal in a Membrane Bioreactor Wastewater Treatment Plant . Applied And Environmental Microbiology , 77(15), 5170-5177 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.00583-11 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15378/
Maalouf Haifa, Schaeffer Julien, Parnaudeau Sylvain, Le Pendu Jacques, Atmar Robert L., Crawford Sue E., Le Guyader Soizick (2011). Strain-Dependent Norovirus Bioaccumulation in Oysters . Applied And Environmental Microbiology , 77(10), 3189-3196 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.03010-10 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00036/14753/

2009

Luz Vilarino M., Le Guyader Soizick, Polo David, Schaeffer Julien, Krol Joanna, Romalde Jesus L. (2009). Assessment of human enteric viruses in cultured and wild bivalve molluscs . International Microbiology , 12(3), 145-151 . Publisher's official version : https://doi.org/10.2436/20.1501.01.92 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6957/
Le Guyader Soizick, Parnaudeau Sylvain, Schaeffer Julien, Bosch Albert, Loisy Fabienne, Pommepuy Monique, Atmar Robert L. (2009). Detection and Quantification of Noroviruses in Shellfish . Applied and environmental microbiology , 75(3), 618-624 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.01507-08 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6137/


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