Bibliographie
2024
Van Denderen P. Daniël, Plaza‐morlote Maider, Vaz Sandrine, Wijnhoven Sander, Borja Angel, Fernandez‐arcaya Ulla, González‐irusta José M., Hansen Jørgen L. S., Katsiaras Nikolaos, Pierucci Andrea, Serrano Alberto, Reizopoulou Sofia, Papadopoulou Nadia, Sköld Mattias, Smith Christopher J., Nygård Henrik, Van Hoey Gert, Dinesen Grete E., Virtanen Elina A., Boyé Aurélien, García‐alegre Ana, Bellas Juan, Bolam Stefan, Muñoz Pablo Durán, Sacau Mar, Riva Giada, Kenchington Ellen, Raicevich Saša, Reid David, Roux Marie Julie, Hiddink Jan Geert, Valanko Sebastian (2024). Complementarity and sensitivity of benthic state indicators to bottom‐trawl fishing disturbance . Ecological Applications , 34(8), e3050 (15p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/eap.3050 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00914/102626/
Jones Auriane, Schaal Gauthier, Boyé Aurélien, Creemers Marie, Derolez Valerie, Desroy Nicolas, Fiandrino Annie, Mouton Theophile, Simier Monique, Smith Niamh, Ouisse Vincent (2024). Disentangling the effects of eutrophication and natural variability on macrobenthic communities across French coastal lagoons . Peer Community Journal. Ecology , 4, e112 (36p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.24072/pcjournal.499 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00925/103724/
Toumi Chirine, Gauthier Olivier, Grall Jacques, Thiébaut Éric, Boyé Aurélien (2024). Disentangling the effect of space, time, and environmental and anthropogenic drivers on coastal macrobenthic β diversity in contrasting habitats over 15 years . Science Of The Total Environment , 946, 173919 (15p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.173919 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00896/100798/
Bizien Anaelle, Toumi Chirine, Boye Aurélien, Sturbois Anthony, Le Duff Michel, Grall Jacques, Helias Mathieu, Gauthier Olivier, Burel Thomas (2024). Contrasted trends of intertidal macroalgal communities and sharp decline of canopy-forming species across two decades . Marine Ecology Progress Series , 742, 73-86 . https://doi.org/10.3354/meps14652
Josso Elena, Benoit Thomas, Mourguiart Bastien, Boyé Aurélien, Marzloff Martin (2024). Study of the influence of biogenic habitats on the distribution of Australian marine fauna . AMEMR 2024 - 7th Conference of Advances in Marine Ecosystem Modelling Research. July 8 – 12, 2024, Plymouth, United Kingdom .
Marzloff Martin, Boyé Aurélien, Benoit Thomas (2024). Towards a trait-based modelling framework of seascape habitat features . AMEMR 2024 - 7th Conference of Advances in Marine Ecosystem Modelling Research. July 8 – 12, 2024, Plymouth, United Kingdom .
de Bettignies Thibaut, Van Den Beld Inge, Janson Anne-Laure, Fabri Marie-Claire, Menot Lenaick, Lartaud Franck, Le Bris Nadine, Paquignon Guillaume, Robert Alexandre, Boyé Aurélien (2024). Bilan des connaissances sur les récifs du bathyal et évaluation de l’état de conservation de l’habitat d’intérêt communautaire Récifs dans les eaux françaises hexagonales . Naturae , 2024(8), 143-177 . Publisher's official version : https://doi.org/10.5852/naturae2024a8 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00888/100024/
Millot Jade, Grall Jacques, Toumi Chirine, Maguer Marion, Boyé Aurélien (2024). Quantifying the direct and indirect relationships linking the environment, seagrass, and their associated fauna . Ecosphere , 15(2), e4708 (18p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/ecs2.4708 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00876/98742/
2023
Vincent Benoit, Biseau Alain, Laffargue Pascal, Vaz Sandrine, Boyé Aurélien, Desroy Nicolas (2023). Analyse du projet de règlement européen de restauration de la nature au regard de l’activité de pêche : quelles zones, quels impacts, quelles mesures possibles ? DGAMPA - Direction Générale des Affaires Maritimes, de la Pêche et de l’Aquaculture, Service de la Pêche et de l’Aquaculture durables, sous-direction des ressources halieutiques, Bureau de l’Appui Scientifique et des Données, La Défense , Ref. DG 2023 – 1554 / P9 23-029 - Saisine du 30 mai 2023 , 3p., 16p., 7p., 24p., 2p., 10p., 3p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00871/98340/
Lelièvre Yann, Specq Léa, Lamy Thomas, Boyé Aurélien, Downey Rachel V., Saucède Thomas (2023). Taxonomic and functional diversity of subtidal benthic communities associated with hard substrates at Crozet archipelago (sub-Antarctic, Southern Ocean) . Frontiers In Marine Science , 10, 1291038 (28p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmars.2023.1291038 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00870/98186/
Sturbois Anthony, de Cáceres Miquel, Bifolchi Aline, Bioret Frédéric, Boyé Aurélien, Gauthier Olivier, Grall Jacques, Grémare Antoine, Labrune Céline, Robert Alexandre, Schaal Gauthier, Desroy Nicolas (2023). Ecological quality assessment: A framework to report ecosystems quality and their dynamics from reference conditions . Ecosphere , 14(12), e4726 (21p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/ecs2.4726 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00869/98091/
Bissery Claire, de Bettignies Thibaut, Janson Anne-Laure, Beauvais Sophie (2023). Indicateurs et recommandations pour évaluer l’effet de mesures de gestion sur l’état de santé des habitats marins . (Pré-étude). PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), Paris, 32 pp. Photographie de couverture : Suivis sous-marins – MNHN La .
Muller Alexandre, Dubois Stanislas, Boyé Aurélien, Becheler Ronan, Droual Gabin, Chevalier Mathieu, Pasquier Marine, Roudaut Loïg, Fournier‐sowinski Jérôme, Auby Isabelle, Nunes Flavia (2023). Environmental filtering and biotic interactions act on different facets of the diversity of benthic assemblages associated with eelgrass . Ecology And Evolution , 13(11), e10159 (18p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/ece3.10159 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00864/97602/
Djeghri Nicolas, Boyé Aurélien, Ostle Clare, Hélaouët Pierre (2023). Reinterpreting two regime shifts in North Sea plankton communities through the lens of functional traits . Global Ecology And Biogeography , 32(6), 962-975 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/geb.13659 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00828/93988/
Toumi Chirine, de Cáceres Miquel, Grall Jacques, Boyé Aurélien, Thiébaut Éric, Maguer Marion, Le Garrec Vincent, Broudin Caroline, Houbin Céline, Gauthier Olivier (2023). Long‐term coastal macrobenthic Community Trajectory Analysis reveals habitat‐dependent stability patterns . Ecography , 2023(6), e06489 (15p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/ecog.06489 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00833/94448/
Delmas Lucile (2023). Convention MTE-Ifremer 2022. Compte-rendu de fin d'exécution au 31 décembre 2022 . ODE/VIGIES/DCSMM/2023 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00834/94642/
Curd Amelia, Chevalier Mathieu, Vasquez Mickaël, Boyé Aurélien, Firth Louise B., Marzloff Martin, Bricheno Lucy M., Burrows Michael T., Bush Laura E., Cordier Celine, Davies Andrew J., Mattias Green J.A., Hawkins Stephen J., Lima Fernando P., Meneghesso Claudia, Mieszkowska Nova, Seabra Rui, Dubois Stanislas (2023). Applying landscape metrics to species distribution model predictions to characterize internal range structure and associated changes . Global Change Biology , 29(3), 631-647 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/gcb.16496 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00805/91725/
Boyé Aurélien, Robert Alexandre, Janson Anne-Laure, Beauvais Sophie, Dedieu Karine (2023). Évaluation de l’état écologique des habitats benthiques en France métropolitaine au titre de la DCSMM . Rapport scientifique pour l’évaluation 2024 (cycle 3) du Bon État Écologique au titre du descripteur 1 – « Habitats Benthiques » de la DCSMM. Ifremer-PatriNat-OFB, 640 pages . https://doi.org/10.13155/97882
2022
Pierrejean Marie, Laffargue Pascal, Desroy Nicolas (2022). Test de déploiement des suivis du compartiment de la macrofaune benthique sur les fonds meubles du plateau via les campagnes halieutiques de l’Ifremer, au titre de la DCSMM . https://doi.org/10.13155/92737
Delmas Lucile (2022). Convention MTE-Ifremer 2021. Compte-rendu de fin d'exécution au 31 décembre 2021 . ODE/VIGIES/DCSMM/2022 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00794/90639/
Deleys Noemie, Cossais Amelie (2022). Consignes de saisie Quadrige. Hermelles, Sabellaria alveolata. Protocole REEHAB . ODE/VIGIES/22-02 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00759/87105/
Boye Aurelien, Gauthier Olivier, Becheler Ronan, Le Garrec Vincent, Hily Christian, Maguer Marion, Grall Jacques (2022). Drivers and limits of phenotypic responses in vulnerable seagrass populations: Zostera marina in the intertidal . Journal Of Ecology , 110(1), 144-161 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/1365-2745.13791 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00727/83943/
ICES (2022). Workshop to evaluate proposed assessment methods and how to set thresholds for assessing adverse effects on seabed habitats (WKBENTH3) . ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM , 4(93), 102pp. Publisher's official version : https://doi.org/10.17895/ices.pub.21666260 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00809/92147/
ICES (2022). Workshop to scope assessment methods to set thresholds (WKBENTH2) . ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM , 4(70), 99p. Publisher's official version : https://doi.org/10.17895/ices.pub.20731537 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00794/90647/
Delmas Lucile, Chao Marie-Laure, Alunno Bruscia Marianne, Biseau Alain, Daniel Anne, Buchet Remi, Rocq Sophie, Boulben Sylviane, Renault Tristan, Riou Philippe, Le Pivert Olivier, Wessel Nathalie, Mauffret Aourell, Brun Melanie, Lefebvre Alain, Devreker David, Robert Alexandre, Boye Aurelien, Brind'Amour Anik, Delaunay Damien, Regimbart Amelie, Foucher Eric, Gerigny Olivia, Galgani Francois, Mongruel Remi, Bas Adeline, Le Gentil Eric (2022). DCSMM - DCE. L’appui aux politiques publiques : Cadre d’intervention, enjeux et perspectives. Séminaire DCSMM - DCE. 18 et 19 janvier 2022. Ordre du jour, Compte-rendu et Présentations .
Boyé Aurélien, Robert Alexandre, Beauvais Sophie, Dedieu Karine, Janson Anne-Laure (2022). Note technique. Définition des modalités de l’évaluation qualitative appliquée à certains habitats benthiques dans le cadre de l’évaluation DCSMM cycle 3. Thématique D1 - habitats benthiques . Rapport Ifremer, PatriNat, OFB, 11 p. + annexes . https://doi.org/10.13155/90285
2021
Curd Amelia, Boyé Aurelien, Cordier Celine, Pernet Fabrice, Firth Louise B., Bush Laura E., Davies Andrew J., Lima Fernando P., Meneghesso Claudia, Quéré Claudie, Seabra Rui, Vasquez Mickael, Dubois Stanislas (2021). Environmental optima for an ecosystem engineer: a multidisciplinary trait-based approach . Scientific Reports , 11(1), 22986 (12p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1038/s41598-021-02351-7 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00736/84819/
Robert Alexandre, Boye Aurelien, Janson Anne-Laure, Beauvais Sophie, Dedieu Karine (2021). DCSMM - Descripteur n°1 - BIODIVERSITE Habitats benthiques . Note de l’équipe RT/RS D1 Habitats Benthiques . https://doi.org/10.13155/84522
Muller Alexandre, Poitrimol Camille, Nunes Flavia, Boye Aurelien, Curd Amelia, Desroy Nicolas, Firth Louise B, Bush Laura, Davies Andrew J, Lima Fernando P, Marzloff Martin, Meneghesso Claudia, Seabra Rui, Dubois Stanislas (2021). Musical Chairs on Temperate Reefs: Species Turnover and Replacement Within Functional Groups Explain Regional Diversity Variation in Assemblages Associated With Honeycomb Worms . Frontiers In Marine Science , 8(654141), 18p. Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmars.2021.654141 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00693/80506/
Firth Louise B, Harris Daniel, Blaze Julie A, Marzloff Martin, Boye Aurelien, Miller Peter I, Curd Amelia, Vasquez Mickael, Dunn Julia D, O'Connor Nessa E, Power Anne-Marie, Mieszkowska Nova, O’riordan Ruth M, Burrows Michael T, Bricheno Lucy M, Knights Anthony M, Nunes Flavia, Bordeyne François, Bush Laura E, Byers James E, David Carmen, Davies Andrew J, Dubois Stanislas, Edwards Hugh, Foggo Andy, Grant Lisa, Mattias Green Ja, Gribben Paul E, Lima Fernado P, McGrath David, Noel Laure Mlj, Seabra Rui, Simkanin Christina, Hawkins Stephen J (2021). Specific niche requirements underpin multidecadal range edge stability, but may introduce barriers for climate change adaptation . Diversity And Distributions , 27(4), 668-683 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/ddi.13224 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00677/78938/
Martini Séverine, Larras Floriane, Boye Aurelien, Faure Emile, Aberle Nicole, Archambault Philippe, Bacouillard Lise, Beisner Beatrix E, Bittner Lucie, Castella Emmanuel, Danger Michael, Gauthier Olivier, Karp‐boss Lee, Lombard Fabien, Maps Frédéric, Stemmann Lars, Thiébaut Eric, Usseglio‐polatera Philippe, Vogt Meike, Laviale Martin, Ayata Sakina‐dorothée (2021). Functional trait‐based approaches as a common framework for aquatic ecologists . Limnology And Oceanography , 66(3), 965-994 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/lno.11655 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00663/77504/
2020
Curd Amelia, Vasquez Mickael, Boye Aurelien, Bricheno Lucy, Bush Laura, Burrows Michael T., Cordier Celine, Davies Andrew J., Firth Louise B., Green Mattias, Lima Fernando, Marzloff Martin, Meneghesso Claudia, Seabra Rui, Dubois Stanislas (2020). Modélisation statistique de la distribution spatiale des récifs intertidaux d’hermelles en Atlantique . Actes du Z-colloque merIGéo 2020 "De l'océan à la côte : l'information géographique en mouvement". 24 au 26 novembre 2020, Nantes. Session 4 ‐ Analyse et cartographie des habitats. pp.111-114 .
Handal William, Szostek Claire, Hold Natalie, Andrello Marco, Thiébaut Eric, Harney Ewan, Lefebvre Gwendoline, Borcier Elodie, Jolivet Aurélie, Nicolle Amandine, Boyé Aurelien, Foucher Eric, Boudry Pierre, Charrier Gregory (2020). New insights on the population genetic structure of the great scallop ( Pecten maximus ) in the English Channel, coupling microsatellite data and demogenetic simulations . Aquatic Conservation-marine And Freshwater Ecosystems , 30(10), 1841-1853 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/aqc.3316 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00648/76025/
Derrien-Courtel Sandrine, Androuin Thibault, Ar Gall Erwan, Aublet Erwan, Bouriat Alize, Boyé Aurélien, Broudin Caroline, Catherine Elodie, Decaris François-Xavier, Derrien René, Grall Jacques, Houbin Céline, Huber Matthias, Le Duff Michel, Le Gal Aodren, Le Garrec Vincent, Maguer Marion, Perrier Lucile, Thiébaut Eric (2020). Le REBENT-II Bretagne. Surveillance du Benthos du littoral breton. Années 2015-2016. Rapport final. Vf2-11/03/2019. 257p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00848/96026/
2019
Boyé Aurelien, Thiébaut Éric, Grall Jacques, Legendre Pierre, Broudin Caroline, Houbin Céline, Le Garrec Vincent, Maguer Marion, Droual Gabin, Gauthier Olivier (2019). Trait‐based approach to monitoring marine benthic data along 500 km of coastline . Diversity And Distributions , 25(12), 1879-1896 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/ddi.12987 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00515/62688/
Le Croizier Gael, Schaal Gauthier, Point David, Le Loc'h Francois, Machu Eric, Fall Massal, Munaron Jean-Marie, Boye Aurelien, Walter Pierre, Lae Raymond, de Morais Luis Tito (2019). Stable isotope analyses revealed the influence of foraging habitat on mercury accumulation in tropical coastal marine fish . Science Of The Total Environment , 650(Part.2), 2129-2140 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.09.330 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00458/57013/
2018
Boye Aurelien (2018). Diversité taxinomique et fonctionnelle des habitats benthiques dans l'espace et dans le temps : une perspective régionale et décennale / Taxonomic and functional diversity of benthic habitats : variability and drivers from a regional and decadal . PhD Thesis , Université de Bretagne Occidentale, Université de Montréal .
2017
Boye Aurelien, Legendre Pierre, Grall Jacques, Gauthier Olivier (2017). Constancy despite variability: Local and regional macrofaunal diversity in intertidal seagrass beds . Journal Of Sea Research , 130, 107-122 . https://doi.org/10.1016/j.seares.2017.06.004
Jeux de données
2024
Chevalier Mathieu, Boyé Aurélien, Violet Clement (2024). BioOverlap - a database of niche and range overlap measures between species at the global scale . SEANOE . https://doi.org/10.17882/101615
2022
Muller Alexandre, Auby Isabelle, Becheler Ronan, Boye Aurelien, Chevalier Mathieu, Droual Gabin, Dubois Stanislas, Fournier Jérôme, Nunes Flávia L. D. (2022). Functional traits of benthic marine invertebrates associated with eelgrass meadows in France . SEANOE . https://doi.org/10.17882/87709