La Délégation Ifremer de Nouvelle-Calédonie, implantée à Nouméa sur le Campus du Centre IRD assure la représentation de l'Institut auprès des autorités de la Nouvelle-Calédonie : Haut Commissariat de la République, Collectivités territoriales (Gouvernement et trois provinces) et des organismes de recherche représentés sur le territoire et est composée de trois entités :

 1/ L'Unité de Recherche "Lagons, Ecosystèmes et Aquaculture Durable" de Nouvelle-Calédonie, (LEAD), rattachée au Département Ressources Biologiques et Environnement, elle même répartie sur 2 sites (Nouméa et Saint Vincent), qui a pour mission de mettre en œuvre, d'une part les différentes actions de recherche en matière d'appui scientifique et technique à l'Aquaculture de crevettes tropicales et d'autre part d'ouvrir, et de contribuer, à la diversification des activités de l'Ifremer en Nouvelle-Calédonie conformément aux axes de travail privilégiés retenus dans le contexte de l'Accord-Cadre établi avec les collectivités de la Nouvelle-Calédonie et l'Etat; (se reporter au texte de présentation de cette Unité).

Ses domaines de compétence sont l'aquaculture de crustacés, poissons et micro-algues et l'environnement littoral et sa biodiversité.

2/ L'Unité Administration et Finances et Finances de Nouvelle-Calédonie, rattachée au Secrétaire Général du Centre du Pacifique, Unité également répartie sur les sites de Nouméa et de Saint Vincent.

3/ L'Unité Infrastructures et Moyens Associés de Nouvelle-Calédonie rattachée au Secrétaire Général du Centre du Pacifique et implantée sur le site de Saint Vincent.