Emmanuelle Roque D'Orbcastel

Emmanuelle Roque D'Orbcastel

Contact par courriel

Employeur : Ifremer

Site : Sete

Adresse postale : Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex

URL : https://annuaire.ifremer.fr/cv/17532/

ORCID orcid icon : https://orcid.org/0000-0002-0954-0033

Sites Web

 https://umr-marbec.fr/membre/emmanuelle-roque-dorbcastel/ 



Jeux de données

2023

REPHYTOX - French Monitoring program for Phycotoxins in marine organisms (2023). REPHYTOX dataset. French Monitoring program for Phycotoxins in marine organisms. Data since 1987 . SEANOE . https://doi.org/10.17882/47251
REPHY - French Observation and Monitoring program for Phytoplankton and Hydrology in coastal waters (2023). REPHY dataset - French Observation and Monitoring program for Phytoplankton and Hydrology in coastal waters. Metropolitan data . SEANOE . https://doi.org/10.17882/47248


Bibliographie

2023

Naudet Jeanne, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bouvier Thierry, Godreuil Sylvain, Dyall Sabrina, Bouvy Simon, Rieuvilleneuve Fabien, Restrepo-Ortiz Claudia Ximena, Bettarel Yvan, Auguet Jean-Christophe (2023). Identifying macroplastic pathobiomes and antibiotic resistance in a subtropical fish farm . Marine Pollution Bulletin , 194(Part B.), 115267 (11p.) . https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2023.115267
Gadoin Elsa, Desnues Christelle, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bouvier Thierry, Auguet Jean-Christophe, Dagorn Laurent, Moroh Jean-Luc, Adingra Antoinette, Bettarel Yvan (2023). Fishing for the Microbiome of Tropical Tuna . Microbial Ecology , 86(1), 742-755 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s00248-022-02096-4 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00788/90041/
Gadoin Elsa, Desnues Christelle, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bouvier Thierry, Auguet Jean-Christophe, Boudin Elyse, Bettarel Yvan (2023). The Unseen Microbes in the Gut, Liver and Skin of Tunas . Frontiers for Young Minds , 11, 818373 (9p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/frym.2023.818373 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00818/93036/

2022

Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Lutier Mathieu, Le Floc'h Emilie, Ruelle Francois, Triplet Sebastien, Le Gall Patrik, Hubert Clarisse, Fortune Martine, Laugier Thierry, Geoffroy Thibault, Crottier Anaïs, Gobet Angélique, Fouilland Eric (2022). Marine ecological aquaculture: a successful Mediterranean integrated multi-trophic aquaculture case study of a fish, oyster and algae assemblage . Aquaculture International , 30(6), 3143-3157 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s10499-022-00953-0 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00788/89980/
Gadoin Elsa, Desnues Christelle, Bouvier Thierry, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Auguet Jean-Christophe, Crochemore Sandrine, Adingra Antoinette, Bettarel Yvan (2022). Tracking spoilage bacteria in the tuna microbiome . Fems Microbiology Ecology , 98(10), fiac110 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/femsec/fiac110 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00794/90565/
Sadoul Bastien, Caprioli Jean-Philippe, Barrier-Loiseau Chloe, Cimiterra Nicolas, Laugier Thierry, Lagarde Franck, Chary Killian, Callier Myriam, Guillermard Marine-Oceane, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2022). Is Holothuria tubulosa the golden goose of ecological aquaculture in the Mediterranean Sea? Aquaculture , 554, 738149 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2022.738149 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00756/86842/
Ifremer (2022). Rapportage annuel du LER/LR. 2021 . ODE/Unité LITTORAL/LER-LR .
Lacoste Elise, Bec Beatrice, Le Gall Patrik, Boufahja Fehmi, Raimbault Patrick, Messiaen Gregory, Ouisse Vincent, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Munaron Dominique, Fiandrino Annie, Lagarde Franck, Mas Sébastien, Callier Myriam, Gaertner-Mazouni Nabila, Richard Marion (2022). Benthic-pelagic coupling under juvenile oyster influence in a French Mediterranean coastal lagoon (Thau Lagoon) . Estuarine Coastal And Shelf Science , 267, 107779 (10p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ecss.2022.107779 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00751/86264/

2021

Gadoin Elsa, Desnues Christelle, Monteil-Bouchard Sonia, Bouvier Thierry, Auguet Jean-Christophe, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bettarel Yvan (2021). Fishing for the Virome of Tropical Tuna . Viruses-basel , 13(7), 1291 (8p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/v13071291 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00704/81646/
Gadoin Elsa, Durand Lucile, Guillou Aurelie, Crochemore Sandrine, Bouvier Thierry, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Dagorn Laurent, Auguet Jean-Christophe, Adingra Antoinette, Desnues Christelle, Bettarel Yvan (2021). Does the Composition of the Gut Bacteriome Change during the Growth of Tuna? Microorganisms , 9(6), 1157 (12p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/microorganisms9061157 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00696/80846/
Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bettarel Yvan, Dellinger Marion, Sadoul Bastien, Bouvier Thierry, Monin Amandé Justin, Dagorn Laurent, Geffroy Benjamin (2021). Measuring cortisol in fish scales to study stress in wild tropical tuna . Environmental Biology Of Fishes , 104(6), 725-732 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s10641-021-01107-6 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00703/81509/
Richard Marion, Rolland Jean-Luc, Gueguen Yannick, de Lorgeril Julien, Pouzadoux Juliette, Mostajir Behzad, Bec Beatrice, Mas Sébastien, Parin David, Le Gall Patrik, Mortreux Serge, Fiandrino Annie, Lagarde Franck, Messiaen Gregory, Fortune Martine, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2021). In Situ Characterisation of Pathogen Dynamics during a Pacific Oyster Mortality Syndrome Episode . Marine Environmental Research , 165, 105251 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2020.105251 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00669/78063/

2020

Cheve Julien, Laugier Thierry, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Desroy Nicolas (2020). Avis de l'Ifremer sur les impacts environnementaux et zoosanitaires d'un élevage de truites dans le Jaudy . DDTM 22 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer des Côtes d'Armor, Délégation à la Mer et au Littoral, Service Aménagement Mer et Littoral, Unité Cultures Marines, Saint-Brieuc , Ref. 20-078_3_Ifremer.LERBN.2020. Avis13_DDTM22_Pisciculture Jaudy - courriel du 5 octobre 2020 , 5p., 5p., 4p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00681/79318/
Lacoste Elise, Boufahja Fehmi, Pelaprat Corinne, Le Gall Patrik, Berteaux Tom, Messiaen Gregory, Mortreux Serge, Oheix Jocelyne, Ouisse Vincent, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Gaertner-Mazouni Nabila, Richard Marion (2020). First simultaneous assessment of macro- and meiobenthic community response to juvenile shellfish culture in a Mediterranean coastal lagoon (Thau, France) . Ecological Indicators , 115, 106462 (9p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106462 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00629/74134/
Gales Amandine, Triplet Sebastien, Geoffroy Thibault, Roques Cécile, Carre Claire, Le Floc'h Emilie, Lanfranchi Mélissa, Simier Monique, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Przybyla Cyrille, Fouilland Eric (2020). Control of the pH for marine microalgae polycultures: A key point for CO2 fixation improvement in intensive cultures . Journal Of Co2 Utilization , 38, 187-193 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jcou.2020.01.019 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00612/72403/

2019

Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Ubertini Martin, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Mortreux Serge, Chiantella Claude, Bec Beatrice, Bonnet Delphine, Roques Cécile, Bernard Ismael, Richard Marion, Guyondet Thomas, Pouvreau Stephane, Lett Christophe (2019). Duality of trophic supply and hydrodynamic connectivity drives spatial patterns of Pacific oyster recruitment . Marine Ecology Progress Series , 632, 81-100 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/meps13151 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00598/70981/
Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Boudin Elyse, Li Meng, Carcaillet Frédérique, Fouilland Eric (2019). Fish, Algae, and Oysters: The Winning Trio in Aquaculture . Frontiers for Young Minds , 7(131), 7p. Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/frym.2019.00131 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00595/70702/
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Li Meng, Callier Myriam, Blancheton Jean-Paul, Galès Amandine, Nahon Sarah, Triplet Sebastien, Geoffroy Thibault, Menniti Christophe, Fouilland Eric, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2019). Bioremediation of fishpond effluent and production of microalgae for an oyster farm in an innovative recirculating integrated multi-trophic aquaculture system . Aquaculture , 504, 314-325 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2019.02.013 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00480/59207/
Richard Marion, Bec Beatrice, Vanhuysse Charles, Mas Sébastien, Parin David, Chantalat Camila, Le Gall Patrik, Fiandrino Annie, Lagarde Franck, Mortreux Serge, Ouisse Vincent, Rolland Jean-Luc, Degut Anaïs, Hatey Elise, Fortune Martine, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Messiaen Gregory, Munaron Dominique, Callier Myriam, Oheix Jocelyne, Derolez Valerie, Mostajir Behzad (2019). Changes in planktonic microbial components in interaction with juvenile oysters during a mortality episode in the Thau lagoon (France) . Aquaculture , 503, 231-241 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2018.12.082 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00474/58559/
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Lagarde Franck, Ubertini Martin, Mortreux Serge, Perignon Adeline, Leurion Axel, Le Gall Patrik, Chiantella Claude, Meddah Slem, Guillou Jean-Louis, Messiaen Gregory, Bec Beatrice, Roques Cecile, Bonnet Delphine, Cochet Hélène, Bernard Ismael, Gervasoni Erika, Richard Marion, Miron Gilles, Fiandrino Annie, Pouvreau Stephane, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2019). Heterogeneity of Japanese Oyster (Crassostrea Gigas) Spat Collection in a Shellfish Farmed Mediterranean Lagoon . In Komatsu T., Ceccaldi HJ., Yoshida J., Prouzet P., Henocque Y. (eds) Oceanography Challenges to Future Earth. Springer, Cham. ISBN 978-3-030-00137-7 ISBN 978-3-030-00138-4 (eBook) https://doi.org/10.1007/978-3-030-00138-4. Chap.27, pp.341-350 (Springer Nature) .
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2018

Li Meng, Liang Zhenlin, Callier Myriam, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Ma Xiaona, Sun Linlin, Li Xian, Wang Shunkui, Song Xiefa, Liu Ying (2018). Nitrogen and organic matter removal and enzyme activities in constructed wetlands operated under different hydraulic operating regimes . Aquaculture , 496, 247-254 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2018.06.016 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55632/
Richard Marion, Le Gall Patrik, Mortreux Serge, Ouisse Vincent, Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Fortune Martine, Munaron Dominique, Messiaen Gregory, Oheix Jocelyne, Derolez Valerie, Bellamy Elise, Foucault Elodie, Devique Gabriel, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bec B, Mostajir B, Hatey E, McKenzie , Callier Myriam, Montagnani Caroline, Rolland Jean-Luc, Mas S, Parin D, Keck , Dedet , Singevin , Bourreau Juliette, Vanhuysse Charles, Chantalat C, Degut A, Neveu , Bourguoin , Fournier , Navarro , Zecchinon , Trabouriech , Galavielle , Avila , Chastel , Anthony (2018). Consequences of oyster mortality episodes on benthic-pelagic coupling in Thau lagoon (France) . AQUA 2018 - World Aquaculture Society Meetings. August 25-29 2018, Montpellier, France .
Richard Marion, Bec Béatrice, Vanhuysse Charles, Mas Sébastien, Parin David, Chantala Camila, Le Gall Patrik, Fiandrino Annie, Lagarde Franck, Mortreux Serge, Ouisse Vincent, Rolland Jean-Luc, Degut Anaïs, Hatey Elise, Fortune Martine, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Messiaen Gregory, Munaron Dominique, Callier Myriam, Oheix Jocelyne, Derolez Valerie, Mostajir Behzad (2018). Changes on planktonic microbial components in interaction with oyster juveniles during a mortality episode in the Thau Lagoon (FRANCE) . AQUA 2018 - World Aquaculture Society Meetings. August 25-29 2018, Montpellier, France .
Lagarde Franck, Richard Marion, Bec Beatrice, Roques Cecile, Mortreux Serge, Bernard Ismael, Chiantella Claude, Messiaen Gregory, Nadalini Jean-Bruno, Hori Masakazu, Hamaguchi Masami, Pouvreau Stephane, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Tremblay Rejean (2018). Trophic environments influence size at metamorphosis and recruitment performance of Pacific oysters . Marine Ecology Progress Series , 602, 135-153 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/meps12666 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00454/56613/
Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Ubertini Martin, Tremblay R, Mortreux Serge, Chiantella Claude, Bec Beatrice, Roques Cécile, Bonnet Delphine, Bernard Ismaël, Cochet H, Messiaen Gregory, Richard Marion, Guyondet Thomas, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Pouvreau Stephane, Lett Christophe (2018). Trophic interactions and connectivity influence spatial patterns of Pacific oyster recruitment in heavily shellfish farmed mediterranean lagoon . AQUA 2018 - World Aquaculture Society Meetings. August 25-29 2018, Montpellier, France .
Marzin Anahita, Crottier Anais, Piquet Jean-Come, Abadie Eric, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Fiandrino Annie (2018). Etude sanitaire de la zone n° 34.39 "Lotissements conchylicoles de la lagune de Thau" Groupe III. Département de l'Hérault . ODE/UL/LER/LR/18.14 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00459/57056/
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Li Meng, Liang Zhenlin, Callier Myriam, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Sun Guoxiang, Ma Xiaona, Li Xian, Wang Shunkui, Liu Ying, Song Xiefa (2018). Nutrients removal and substrate enzyme activities in vertical subsurface flow constructed wetlands for mariculture wastewater treatment: Effects of ammonia nitrogen loading rates and salinity levels . Marine Pollution Bulletin , 131(Part.A), 142-150 . https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2018.04.013
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2017

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Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Gales Amandine, Fouilland Eric, Li Meng, Blancheton Jean-Paul, Triplet Sebastien, Geoffroy Thibault (2017). Innovation on landbased IMTA under mediterranean climate: state of the art and challenges of microalgae-based system . AE2017 - Aquaculture Europe 17 "Cooperation for growth". October 17-20 2017, Dubrovnik, Croatia .
Aubin J, Lefebvre S, Callier Myriam, Wilfart A, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Cunha Me, Ferreira H, Gamito S, Mortillaro Jm, Caruso D, Cotou E, Fountoulaki E, Nahon S, Metaxa I, Miliou H (2017). Efficiency and environmental performance of IMTA in marine and freshwater systems . Aquaculture Europe 2017 (AE2017). 17 Octobre 2017/20 Octobre 2017, Dubrovnik, Croatie .
Lagarde Franck, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Mortreux Serge, Bernard Ismael, Chiantella Claude, Bec Béatrice, Roques Cécile, Correia-Martins Alana, Nadalini Jean-Bruno, Pouvreau Stephane, Tremblay Réjean (2017). Unexpected in situ relationship between metamorphosis size and recruitment success of Crassostrea gigas. Physiomar 2017 - The physiology of aquatic invertebrates in a changing world. 18-21 September 2017, Cambridge, UK .
Le Gouvello Raphaela, Hochart Laure-Elise, Laffoley Dan, Simard Francois, Andrade Carlos, Angel Dror, Callier Myriam, de Monbrison David, Fezzardi Davide, Haroun Ricardo, Harris Alasdair, Hughes Adam, Massa Fabio, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Soto Doris, Stead Selina, Marino Giovanna (2017). Aquaculture and marine protected areas: Potential opportunities and synergies . Aquatic Conservation-marine And Freshwater Ecosystems , 27(S1), 138-150 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/aqc.2821 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00398/50969/
Lagarde Franck, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Ubertini Martin, Mortreux Serge, Bernard Ismael, Fiandrino Annie, Chiantella Claude, Bec Beatrice, Roques Cecile, Bonnet Delphine, Miron Gilles, Richard Marion, Pouvreau Stephane, Lett Christophe (2017). Recruitment of the Pacific oyster Crassostrea gigas in a shellfish-exploited Mediterranean lagoon: discovery, driving factors and a favorable environmental window . Marine Ecology Progress Series , 578, 1-17 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/meps12265 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00398/50899/
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Ubertini Martin, Lagarde Franck, Mortreux Serge, Le Gall Patrik, Chiantella Claude, Fiandrino Annie, Bernard Ismael, Pouvreau Stephane, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2017). Gametogenesis, spawning behavior and larval abundance of the Pacific oyster Crassostrea gigas in the Thau lagoon: Evidence of an environment-dependent strategy . Aquaculture , 473, 51-61 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2017.01.025 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00369/48032/
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2016

Lagarde Franck, Mortreux Serge, Ubertini Martin, Chiantella Claude, Bec Béatrice, Roques Cécile, Bonnet Delphine, Bernard Ismael, Cochet Hélène, Messiaen Gregory, Le Gall Patrik, Richard Marion, Fiandrino Annie, Pouvreau Stephane, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2016). How oyster (crassostrea gigas) benthic larval supply and metamorphosis stage condition recruitment in a mediterranean shellfish farmed ecosystem? AE2016 - Aquaculture Europe 2016, "Mollusc production and health" session, September 23 2016, Edinburgh, Scotland (UK) .
Vanhuysse Charles, Richard Marion, Bec B, Mostajir B, Hatey E, Mas S, Chiantella Claude, Parin D, Lagarde Franck, Le Gall Patrik, Mortreux Serge, Messiaen Gregory, Ouisse Vincent, Fiandrino Annie, Chantalat C, Degut A, Callier Myriam-Dominique, McKenzie David, Derolez Valerie, Oheix Jocelyne, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2016). Influence of infection and mortality of oyster spats on planktonic communities: an in situ experiment in the Thau lagoon (France) . AE2016 - Aquaculture Europe 16 "Food for thought". 20-23 September 2016, Edinburgh, Scotland (UK) .
Richard Marion, Bourreau Juliette, Montagnani Caroline, Ouisse Vincent, Le Gall Patrik, Fortune Martine, Messiaen Gregory, Munaron Dominique, Callier Myriam-Dominique, McKenzie D, Mortreux Serge, Lagarde Franck, Parin D, Mas S, Mostajir B, Bec B, Rolland Jean-Luc, Chiantella Claude, Fiandrino Annie, Derolez Valerie, Oheix Jocelyne, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2016). Dissolved fluxes: an ex situ experiment at individual scale . AE2016 - Aquaculture Europe 16 "Food for thought". 20-23 September 2016, Edinburgh, Scotland (UK) .
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Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Richard Marion, Bernard Ismael, Mortreux Serge, Ubertini Martin, Chiantella Claude, Boj Marie, Meddah Slem, Leurion Axel, Soriano Solenn, Fuhrmann Marine, Le Gall Patrik, Chiera Caroline, Berteaux Tom, Guillou Jean-Louis, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Perignon Adeline, Bonnet Delphine, Roques Cecile, Bec Beatrice, Cochet Helene, Gervasoni Erika, Miron Gilles, Pouvreau Stephane (2015). Déterminisme du recrutement larvaire de l’huître creuse (Crassostrea gigas) dans la lagune de Thau. ODE/UL/LERLR 2015-26 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00279/39054/
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Lagarde Franck, Perignon Adeline, Gervasoni Erika, Mortreux Serge, Meddah Slem, Leurion Axel, Le Gall Patrik, Guillou Jean-Louis, Boj Marie, Fuhrmann Marine, Richard Marion, Ubertini Martin, Fiandrino Annie, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Pouvreau Stephane (2015). Recherche de gisements de captage naturel de Crassostrea gigas en lagune de Thau.Répartition spatiotemporelle du naissain, aspects culturaux et économiques. ODE/UL/LERLR 2015-13 . https://doi.org/10.13155/37103
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