Jean-Francois Pepin

Jean-Francois Pepin

Contact par courriel

Employeur : Ifremer

Site : La Tremblade

Adresse postale : Station de La Tremblade - Avenue de Mus de Loup - Ronce les Bains - 17390 La Tremblade

URL : https://annuaire.ifremer.fr/cv/16478/


Domaines de recherche

Pathologie des espèces exploitées ; gestion des ressources renouvelables ; fonctionnement durable des écosystèmes marins littoraux


Projets nationaux ou internationaux

Projet européen BIVALIFE


Jeux de données

2024

Normand Julien, Lemesle Stephanie, Grizon James, Louis Wilfried (2024). The Mytilobs network datasets . SEANOE . https://doi.org/10.17882/87816

2019

Pepin Jean-Francois (2019). MORBLEU Metabarcoding 16s-18s biote moule et eau. IFREMER. https://doi.org/10.12770/73605489-bf2b-4136-993f-99ddd23c5f31


Bibliographie

2023

Gourmelon Michele (2023). Microbiomes dans les écosystèmes estuariens en France : ROME, le réseau d’ADN/ARN environnemental . Journées du réseau O-ADN environnemental. 29-30 Novembre 2023, Cestas .
Siano Raffaele, Arzul Isabelle, Gourmelon Michele, Le Guyader Soizick, Durand Patrick, Serghine Joelle, Parnaudeau Sylvain, Quere Julien, Schmitt Sophie, Francoise Sylvaine, Mary Charlotte, Hernandez Farinas Tania, Terre Terrillon Aouregan, Lebrun Luc, Chomerat Nicolas, Seugnet Jean-Luc, Pepin Jean-Francois, Felix Christine, Serais Ophelie, Gobet Angélique, Chevalier Mathieu, Chevignon Germain, Lecadet Cyrielle, Morga Benjamin, Piquet Jean-Come, Lemoine Maud, Leroi Laura, Noel Cyril (2023). Coastal microbiomes in riverine ecosystems of the French coastline: the ROME project . ISEEMPD 2022 - International Symposium on Ecology and Evolution of Marine Parasites and Diseases. 15-18 November 2022 .
Gourmelon Michele (2023). Microbiomes côtiers dans les écosystèmes estuariens en France : le réseau d’ADN/ARN environnemental. ROME . MICROBES 2023 - 18e Congrès National de la SFM ( Société Française de Microbiologie) « Un monde à explorer » . 4-6 octobre 2023, Rennes .
Masse Cecile, Humbert Suzie, Curd Amelia (2023). Compte-rendu de l'atelier national "espèces non indigènes" (ENI), MNHN Paris, le 26 septembre 2023 .
Pepin Jean-Francois (2023). Detecting two marine non-indigenous species from the French coast using eDNA and molecular approaches . ASC 2023 - ICES Annual Science Conference 2023. 11–14 September 2023 Bilbao, Spain .
Siano Raffaele, Arzul Isabelle, Gourmelon Michele, Le Guyader Soizick, Durand Patrick, The Rome Consortium (2023). Coastal microbiomes in estuarine ecosystems of France: the eDNA network ROME . ASC 2023 - ICES Annual Science Conference 2023. 11–14 September 2023 Bilbao, Spain .
Siano Raffaele, Arzul Isabelle, Gourmelon Michele, Le Guyader Soizick, Durand Patrick, Serghine Joelle, Parnaudeau Sylvain, Quere Julien, Schmitt Sophie, Francoise Sylvaine, Mary Charlotte, Hernandez Farinas Tania, Terre Terrillon Aouregan, Lebrun Luc, Chomerat Nicolas, Seugnet Jean-Luc, Pepin Jean-Francois, Felix Christine, Serais Ophelie, Gobet Angélique, Chevalier Mathieu, Chevignon Germain, Lecadet Cyrielle, Morga Benjamin, Piquet Jean-Come, Lemoine Maud, Leroi Laura, Noel Cyril (2023). Coastal microbiomes in estuarine ecosystems of France: the eDNA network ROME . ASLO - Aquatic Sciences Meeting 2023 "Resilience and Recovery in Aquatic Systems". 4-9 June 2023, Palma de Mallorca, Spain.
Pepin Jean-Francois (2023). Detecting two marine non indigenous species from the French coast using eDNA and molecular approaches . EURL Annual Meeting of National Reference Laboratories for Mollusc Diseases. Mai 2023, La Tremblade .
Sauriau Pierre-Guy, de Montaudouin Xavier, Aubert Fabien, Charpentier Patrick, de Casamajor Marie-Noelle, Fichet Denis, Guyot Thierry, Jourde Jérôme, Le Duigou Mathieu, Masse Cécile, Pante Eric, Pepin Jean-Francois, Pigeot Jacques, Roche Emilie, Thirion Jean-Marc, Vollette Julie (2023). Sur quelques curiosités d’histoire naturelle dans les pertuis charentais : faune des invertébrés marins . Annales de la Société des sciences naturelles de la Charente-Maritime , 11(5), 533-548 .
Le Fur Ines, Grizon James, Vallee Pierre, Costes Louis, Pepin Jean-Francois, Bruneau Audrey, Grouhel Anne, Rocq Sophie, Reynaud Yann (2023). Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Charente-Maritime. Période 2020-2022 . RST/ODE/UL/LER.PC/23.004 . https://doi.org/10.13155/94615
Le Fur Ines, Piraud Aude, Bruneau Audrey, Normand Julien (2023). Projet d'extension du champ de filières mytilicoles de la baie d'Yves. Avis sur le projet d'extension au vu de la commission des cultures marines . DDTM 17 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer de Charente-Maritime, La Rochelle , Ref. ODE/LITTORAL/LERPC-23.02, Avis ifremer n° 22-052 - CM/LRAR/2022/41 , 17p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00821/93303/

2022

ICES (2022). Working Group on Introductions and Transfers of Marine Organisms (WGITMO) . ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM , 4(84), 209p. Publisher's official version : https://doi.org/10.17895/ices.pub.21558855 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00806/91752/
Le Fur Ines, Bruneau Audrey, Deborde Jonathan, Guesdon Stephane, Gueux Aurore, Piraud Aude (2022). Qualité du Milieu Marin Littoral. Bulletin de la surveillance 2021. Départements de Charente-Maritime et de Vendée (sud) . ODE/LITTORAL/LER-PC/22.004 . https://doi.org/10.13155/90555
Le Fur Ines, Gautier Emeric, Grizon James, Geairon Philippe, Pepin Jean-Francois, Bruneau Audrey, Grouhel-Pellouin Anne, Piquet Jean-Come, Rocq Sophie (2022). Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de Charente-Maritime (17). Edition 2022 . RST/ODE/UL/LER.PC22.003 . https://doi.org/10.13155/88087
Gangnery Aline, Fleury Elodie, Soudant Dominique, Richard Marion, Lagarde Franck, Guesdon Stephane, Pepin Jean-Francois, Bruneau Audrey, Derolez Valerie (2022). Les données des réseaux pour étudier les trajectoires des (socio-)écosystèmes côtiers : le projet RETROSCOPE . Journée interne Ifremer ECOSCOPA. 08 Février 2022 .
Hammel Maurine, Simon Alexis, Arbiol Christine, Villalba Antonio, Burioli Erika Av, Pépin Jean-Francois, Lamy Jean-Baptiste, Benabdelmouna Abdellah, Bernard Ismael, Houssin Maryline, Charrière Guillaume, Destoumieux Garzon Delphine, Welch John J., Metzger Michael J, Bierne Nicolas (2022). Prevalence and polymorphism of a mussel transmissible cancer in Europe . Molecular Ecology , 31(3), 736-751 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/mec.16052 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00703/81540/
IFREMER (2022). ROME. Protocoles de prélèvement et filtrations des échantillons d’eaux et d'échantillonnage des huîtres .

2021

UMS Patrimoine Naturel, Ifremer, Université de Bordeaux (2021). Compte rendu de l’atelier national « espèces non indigènes » (ENI), 14.10.2021, MNHN Paris .
Morga Benjamin, Jacquot Maude, Pelletier Camille, Chevignon Germain, Dégremont Lionel, Biétry Antoine, Pepin Jean-Francois, Heurtebise Serge, Escoubas Jean Michel, Bean Tim P., Rosani Umberto, Bai Chang-Ming, Renault Tristan, Lamy Jean-Baptiste (2021). Genomic Diversity of the Ostreid Herpesvirus Type 1 Across Time and Location and Among Host Species . Frontiers In Microbiology , 12, 711377 (13p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.711377 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00706/81762/
Le Fur Ines, Rocq Sophie, Morin Dimitri, Grizon James, Geairon Philippe, Gervais Hugo, Pepin Jean-Francois, Gautier Emeric, Grouhel-Pellouin Anne, Piquet Jean-Come, Bruneau Audrey (2021). Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Charente-Maritime (17). Edition 2021 . RST.ODE/UL/LER/PC21.001 . https://doi.org/10.13155/80788
Le Fur Ines, Rocq Sophie, Morin Dimitri, Grizon James, Geairon Philippe, Gervais Hugo, Pepin Jean-Francois, Gautier Emeric, Grouhel-Pellouin Anne, Piquet Jean-Come, Bruneau Audrey (2021). Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Vendée (85). Edition 2021 . RST.ODE/UL/LER/PC21.002 . https://doi.org/10.13155/80793
Ifremer/ODE/LITTORAL/LERPC/Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais (2021). Qualité du Milieu Marin Littoral. Bulletin de la surveillance 2020. Départements de Charente‐Maritime et de Vendée (sud) . ODE/LITTORAL/LER.PC/21.009 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00747/85927/

2020

Normand Julien, Pepin Jean-Francois, Le Merrer Yoann, Guesdon Stephane, Soletchnik Patrick, Fortune Mireille, Bizzozero Lucie, Souchu Philippe, Cochennec-Laureau Nathalie, Bruneau Audrey (2020). Demande d’analyse des facteurs de l’environnement (paramètres météorologiques et hydrobiologiques) susceptibles d’expliquer les mortalités observées en 2019 et 2020 . DDTM 85 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer de la Vendée, Service Gestion Durable de la Mer et du Littoral, Unité Cultures Marines, Les Sables-d'Olonne , Ref. ODE/LITTORAL/LER/PC-20.007 Expertise lfremer N° 20-086 - votre mail du 6 mai 2020 , 18p., 1p., 18p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00677/78950/
Ifremer/ODE/LITTORAL/LERPC/20.005/Laboratoire Environnement Ressources (2020). Qualité du milieu marin littoral. Bulletin de la surveillance 2019. Départements de Charente-Maritime et de Vendée (Sud) . ODE/LITTORAL/LER‐PC/20.005 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00658/77046/
Pepin Jean-Francois (2020). Diversité microbienne dans le contexte d’épisodes de mortalité de moules Mytilus edulis en milieu côtier : étude de taxons bactériens du microbiome des moules et de leur environnement / Microbial diversity in the context of mussels mass-mortality episodes, Mytilus edulis, in coastal environments: study of bacterial taxa from mussels microbiome and their environment . Rapport de stage Master 2. Mention : Sciences Pour l’Environnement (SPE), Parcours : Gestion de l’Environnement et Ecologie Littorale (GEEL) Année 2019-2020. , Université de la Rochelle, France / MSc dissertation, Environmental Sciences programme Environmental Management and Coastal Ecology. University of La Rochelle, France .
Pepin Jean-Francois (2020). Etude préliminaire pour la recherche du taxon Francisella halioticida (Brevik et al., 2011) et autres taxons bactériens non répertoriés en France dans les séquences du gène de l’ARNr 16S produites par NGS à partir du microbiome de moules et de la colonne d’eau dans le cadre du projet MORBLEU. Analyse de données de metabarcoding des communautés bactériennes marines pour la détection de taxons cibles . ODE/UL/LERPC/JFP .
Pepin Jean-Francois (2020). Rapport de synthèse sur la communication et la valorisation des données liées à l’étude MORBLEU et aux mortalités de moules bleues en France . R.INT./ODE/UL/LERPC-2020 . https://doi.org/10.13155/77962
Pepin Jean-Francois, Soletchnik Patrick, Le Moine Olivier, Polsenaere Pierre, Genauzeau Sylvie, Robert Stephane, Grizon James, Seugnet Jean-Luc, Schmitt Anne, Chabirand Jean-Michel, Tourbiez Delphine, Travers Marie-Agnes, Guesdon Stephane (2020). Does Global Warming Favor the Occurrence of Recent Blue Mussel Mortality Events in France? In Ceccaldi HJ., Hénocque Y., Komatsu T., Prouzet P., Sautour B., Yoshida J. (eds) Evolution of Marine Coastal Ecosystems under the Pressure of Global Changes. Springer, Cham. Print ISBN 978-3-030-43483-0 Online ISBN 978-3-030-43484-7. Chap.17, pp 243-251 (Springer Science and Business Media LLC) .

2019

Pepin Jean-Francois, Benabdelmouna Abdellah, Bierne Nicolas, Chasselin Leo, Degremont Lionel, Guesdon Stephane, Lamy Jean-Baptiste, Le Moine Olivier, Normand Julien, Robert Stephane, Soletchnik Patrick (2019). Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et étude des facteurs liés, action – MORBLEU-2018 . RBE/SG2M-LGPMM-2019 . https://doi.org/10.13155/70056
Pepin Jean-Francois (2019). Mortalités massives de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et facteurs liés . Fiche d’information synthétique. Etude MORBLEU, année 2017, cofinancée par la DPMA . https://archimer.ifremer.fr/doc/00503/61504/
Pepin Jean-Francois, Bouget Jean-Francois, Chabirand Jean-Michel, Chasselin Leo, Costes Louis, Grizon James, Lejolivet Aurore, Le Noc Sandrine, Palvadeau Hubert, Schmitt Anne, Seugnet Jean-Luc, Soletchnik Patrick, Travers Marie-Agnes, Tourbiez Delphine, Guesdon Stephane (2019). Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental . Journées scientifiques et techniques Mer " (JST) : Journées de partage entre les experts de la biodiversité marine, AFB - Agence Française pour la Biodiversité. 11-12 juin 2019, Océanopolis Brest, France . https://archimer.ifremer.fr/doc/00505/61664/

2018

Pepin Jean-Francois, Robert Stephane, Soletchnik Patrick, Seugnet Jean-Luc, Morin Dimitri, Chabirand Jean-Michel, Costes Louis, Geairon Philippe, Grizon James (2018). Evaluation of mussels seed survival Mytilus edulis during early period of collection, development of a new tool and method . AQUA 2018 - World Aquaculture Society Meetings. August 25-29 2018, Montpellier, France . https://archimer.ifremer.fr/doc/00455/56620/
Fleury Elodie (2018). Bilan 2017 RESCO 2 . Réunion restitution conventions DGAl DPMA Ifremer. Mai 2018 .
Garcia Celine, Fleury Elodie, Normand Julien, Lupo Coralie, Canier Lydie (2018). Epidemiological report. France - 2017 . Annual Meeting of the National Reference Laboratories for Mollusc Diseases, La Rochelle 14-15 March 2018, France .
Pepin Jean-Francois, Benabdelmouna Abdellah, Bierne Nicolas, Costes Louis, Degremont Lionel, Garcia Celine, Guesdon Stephane, Lamy Jean-Baptiste, Le Moine Olivier, Morga Benjamin, Normand Julien, Robert Stephane, Saunier Alice, Soletchnik Patrick, Travers Marie-Agnes (2018). Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et étude des facteurs liés, action –MORBLEU-2017 . R.INT.RBE/SG2M-LGPMM-2018 . https://doi.org/10.13155/61503
Canier Lydie, Fleury Elodie, Normand Julien (2018). Bilan 2017 du dispositif national de surveillance de la santé des mollusques marins . Convention relative aux actions de surveillance de la santé des mollusques marins Ifremer-DGAL 16/1212709. RBE/SG2M/LGPMM .

2017

Lamy Jean-Baptiste, Renault Tristan, Bietry Antoine, Faury Nicole, Webb Steeve, Pepin Jean-Francois, Morga Benjamin (2017). Unsuspected OsHV-1 genomic diversity at inter and intra-host level . Journées internes du projet européen Vivaldi. 6-7 décembre 2017, Ifremer Bouin, France .
Pepin Jean-Francois, Soletchnik Patrick, Le Moine Olivier, Polsenaere Pierre, Genauzeau Sylvie, Robert Stephane, Grizon James, Seugnet Jean-Luc, Schmitt Anne, Chabirand Jean-Michel, Tourbiez Delphine, Travers Marie-Agnes, Guesdon Stephane (2017). Does global warming favour the occurrence of recent blue mussel mortality events in France? COAST Bordeaux 2017 "Evolution systémique et de la biodiversité des environnements côtiers et littoraux sous la pression du changement climatique, des facteurs naturels et anthropiques locaux". Du 7 au 10 novembre 2017, Bordeaux . https://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52697/
Guesdon Stephane, Travers Marie-Agnes, Hervio Heath Dominique, Derrien Annick, Genauzeau Sylvie, Schmitt Anne, Quintric Laure, Leroi Laura, Pepin Jean-Francois (2017). Microbial balance, and triggering of recent mussel mortality events in France: Is there a link? AMMR 2017 - 2nd International Symposium on the Advances in Marine Mussel Research. 7th to the 8th of September 2017, Sète, France. https://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52696/
Polsenaere Pierre, Soletchnik Patrick, Le Moine Olivier, Gohin Francis, Robert Stephane, Pepin Jean-Francois, Stanisiere Jean-Yves, Dumas Franck, Bechemin Christian, Goulletquer Philippe (2017). Potential environmental drivers of a regional blue mussel mass mortality event (winter 2014, Breton Sound, France) . Journal Of Sea Research , 123, 39-50 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.seares.2017.03.005 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00376/48708/
Pepin Jean-Francois, Benabdelmouna Abdellah, Degremont Lionel, Guesdon Stephane, Le Moine Olivier, Morga Benjamin, Bierne Nicolas, Travers Marie-Agnes, Robert Stephane, Soletchnik Patrick (2017). Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles charentais et vendéens : description et facteurs liés – MORBLEU . R.INT.RBE/SG2M-LGPMM . https://doi.org/10.13155/50288
Lupo Coralie, Fleury Elodie, Normand Julien, Osta Amigo Axel, Robert Stephane, Canier Lydie, Francois Cyrille, Garcia Celine (2017). Bilan 2016 du dispositif national de surveillance de la santé des mollusques marins . Convention DGAL/IFREMER 16/1212709 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00386/49781/
Normand Julien (2017). MYTILOBS1 Campagne 2015-2016 : Réseau d’observation des moules d’élevage sur la côte atlantique et dans la Manche . RST LERN 17-05 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00411/52247/

2016

Guesdon Stephane, Travers Marie-Agnes, Hervio Heath Dominique, Derrien Annick, Genauzeau Sylvie, Schmitt Anne, Leroi Laura, Pepin Jean-Francois (2016). Equilibre microbien et initiation des épisodes de mortalité de moules. Y aurait-il un lien? Journées ODE. 8-9 novembre 2016. Logonna Daoulas, France .
Pepin Jean-Francois, Travers Marie-Agnes (2016). Projet de recherche "MORBLEU". Environnement des écosystèmes mytilicoles et crises de mortalité récentes, quelles interactions? Etude des facteurs pouvant favoriser les surmortalités de moules bleues (Mytilus edulis) dans les pertuis charentais et en Vendée (2014-2016) . Journées ODE. 8-9 novembre 2016. Logonna Daoulas, France . https://archimer.ifremer.fr/doc/00361/47174/
Robert Stephane, Soletchnik Patrick, Pepin Jean-Francois, Le Moine Olivier, Guesdon Stephane, Travers Marie-Agnes, Garcia Celine, Degremont Lionel, Benabdelmouna Abdellah, Osta Amigo Axel, Bierne Nicolas (2016). Mortalités massives de moules bleues (Mytilus edulis) sur les côtes françaises (2014-2016) : Eléments de connaissances (mai 2016). Rencontre avec des professionnels de la mytiliculture à Ifremer la Rochelle, le 20 mai 2016 . Rencontre avec des professionnels de la mytiliculture. 20 mai 2016, Ifremer La Rochelle .
Fleury Elodie (2016). ECOSCOPA. Evaluer la qualité des écosystèmes conchylicoles en lien avec les pressions climatiques et anthropiques. Rapport annuel campagne 2015 . Convention DPMA ‐ IFREMER 14/1211577/F . https://archimer.ifremer.fr/doc/00334/44511/
Pouvreau Stephane (2016). Observer, Analyser et Gérer la variabilité de la reproduction et du recrutement de l’huître creuse en France : Le Réseau Velyger. Rapport annuel 2015 . R.INT.BREST RBE/PFOM/PI 2016-1 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00334/44533/
Lapegue Sylvie, Bechemin Christian, Osta Amigo Axel, Pepin Jean-Francois, Prou Jean, Robert Stephane, Soletchnik Patrick, Renault Tristan (2016). Réponse à la demande. Rapport technique sur les mortalités de moules constatées en 2015 . DPMA - Direction des Pêches Maritime et de l'Aquaculture, Tour Séquoïa, La Défense , Ref. Ifremer DGD/SL/16-032 - DPMA 9537 , 5p., 1p., 8p., 4p., 1p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00334/44522/
Travers Marie-Agnes, Pepin Jean-Francois, Soletchnik Patrick, Guesdon Stephane, Le Moine Olivier (2016). Mortalités de moules bleues dans les Pertuis Charentais: description et facteurs liés – MORBLEU . R.INT.RBE/SG2M-LGPMM . https://doi.org/10.13155/43539
Robert Stephane, Soletchnik Patrick (2016). Réseau national d’observation de la moule bleue Mytilus edulis, MYTILOBS / Campagne 2015 . Convention DPMA 2015/ n° 14/1211577/F . https://archimer.ifremer.fr/doc/00334/44494/
Pepin Jean-Francois, Travers Marie-Agnes, Bechemin Christian, Soletchnik Patrick, Le Moine Olivier, Guesdon Stephane, Lapegue Sylvie, Benabdelmouna Abdellah, Hervio Heath Dominique, Bierne Nicolas (2016). Projet MORBLEU. Mortalités des moules bleues dans les Pertuis Charentais et Vendée 2014-2015 : de l’expertise aux actions de recherche. Description des conditions associées aux épisodes de mortalité. Point d'information sur l'étude en cours. Journée de la Santé des mollusques marins et Journées de l'Observation conchylicole. 02 au 04 février 2016, Ifremer, Nantes, France .
Dégremont Lionel, Morga Benjamin, Trancart Suzanne, Pépin Jean-Francois (2016). Resistance to OsHV-1 Infection in Crassostrea gigas Larvae . Frontiers in Marine Science , 3(15), 12p. Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmars.2016.00015 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00313/42441/
Pepin Jean-Francois, Travers Marie-Agnes (2016). Projet «MORBLEU» année 2015. Mortalités de moules bleues dans les Pertuis Charentais : de l’expertise aux actions de recherche, description et étude des conditions associées aux épisodes de mortalité ou susceptibles de les favoriser . Colloque LITEAU "Observation et recherche en appui aux politiques du littoral et de la mer". 14 et 15 janvier 2016, Brest, France .

2015

Thomas Gerard, Piquet Jean-Come, Ryckaert Mireille, Masson Daniel, Pepin Jean-Francois, Polsenaere Pierre, Fillon Alain (2015). Qualité microbiologique des zones conchylicoles dans les Pertuis Charentais . ODE/UL/LERPC/15-2 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00302/41299/
Degremont Lionel, Lamy Jean-Baptiste, Pepin Jean-Francois, Travers Marie-Agnes, Renault Tristan (2015). New Insight for the Genetic Evaluation of Resistance to Ostreid Herpesvirus Infection, a Worldwide Disease, in Crassostrea gigas . Plos One , 10(6), - . Publisher's official version : https://doi.org/10.1371/journal.pone.0127917 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00269/38066/
Ifremer/ODE/LITTORAL/LERPC/15.01/Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais (2015). Qualité du Milieu Marin Littoral. Bulletin de la surveillance 2014. Départements de Charente-Maritime et de Vendée (Sud) . ODE/LITTORAL/LERPC/15-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00285/39628/
Fleury Elodie (2015). RESCO - Réseau d'observations Conchylicoles : Rapport annuel Campagne 2014. RST/LER/MPL/15.09 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00287/39794/
Pouvreau Stephane, Petton Sebastien, Queau Isabelle, Haurie Axel, Le Souchu Pierrick, Alunno-Bruscia Marianne, Palvadeau Hubert, Auby Isabelle, Maurer Daniele, D'Amico Florence, Passoni Sarah, Barbier Claire, Tournaire Marie-Pierre, Rigouin Loic, Rumebe Myriam, Fleury Elodie, Fouillaron Pierre, Bouget Jean-Francois, Pepin Jean-Francois, Robert Stephane, Grizon James, Seugnet Jean-Luc, Chabirand Jean-Michel, Le Moine Olivier, Guesdon Stephane, Lagarde Franck, Mortreux Serge, Le Gall Patrik, Messiaen Gregory, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Quemener Loic, Repecaud Michel, Mille Dominique, Geay Amelie, Bouquet Anne-Lise (2015). Observer, Analyser et Gérer la variabilité de la reproduction et du recrutement de l’huître creuse en France : Le Réseau Velyger. Rapport annuel 2014 . R.INT.BREST RBE/PFOM/PI 2015-­1 . https://doi.org/10.13155/38990

2014

Soletchnik Patrick, Polsenaere Pierre, Le Moine Olivier, Guesdon Stephane, Bechemin Christian (2014). Relations entre apports terrigènes et conchyliculture dans les Pertuis Charentais . ODE / LER-PC / 2014 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00248/35964/
Pepin Jean-Francois, Soletchnik Patrick, Robert Stéphane (2014). Mortalités massives de l’Huître creuse. Synthèse - Rapport final des études menées sur les mortalités de naissains d’huîtres creuses C. gigas sur le littoral charentais pour la période de 2007 à 2012 . ODE/LER-PC/ 14-05 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00217/32856/
Segarra Amelie, Mauduit Florian, Faury Nicole, Trancart Suzanne, Degremont Lionel, Tourbiez Delphine, Haffner Philippe, Barbosa-Solomieu Valerie, Pepin Jean-Francois, Travers Marie-Agnes, Renault Tristan (2014). Dual transcriptomics of virus-host interactions: comparing two Pacific oyster families presenting contrasted susceptibility to ostreid herpesvirus 1 . Bmc Genomics , 15(580), 1-13 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1186/1471-2164-15-580 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31029/
Segarra Amelie, Faury Nicole, Pepin Jean-Francois, Renault Tristan (2014). Transcriptomic study of 39 ostreid herpesvirus 1 genes during an experimental infection . Journal Of Invertebrate Pathology , 119, 5-11 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jip.2014.03.002 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00184/29549/
Fleury Elodie (2014). RESCO - Réseau d'observations Conchylicoles : Campagne 2013 . RST/LER/MPL-2014-06 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00197/30851/
Pouvreau Stephane, Petton Sebastien, Queau Isabelle, Bellec Gwenael, Talarmain Eric, Le Souchu Pierrick, Alunno-Bruscia Marianne, Auby Isabelle, Maurer Daniele, D'Amico Florence, Passoni Sarah, Barbier Claire, Tournaire Marie-Pierre, Rigouin Loic, Rumebe Myriam, Fleury Elodie, Langlade Aime, Bouget Jean-Francois, Collin Karine, Fortune Mireille, Palvadeau Hubert, Bedier Edouard, Robert Stephane, Pepin Jean-Francois, Grizon James, Seugnet Jean-Luc, Chabirand Jean-Michel, Le Moine Olivier, Guesdon Stephane, Lagarde Franck, Mortreux Serge, Le Gall Patrik, Messiaen Gregory, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Quemener Loic, Repecaud Michel, Bucas Karenn, Barbot Stephane, Guillemot Anne, Nonnotte Lidwine, Duros Wenceslas, Bonnat Armel, Tarot Stephane, Mille Dominique, Geay Amelie, Bouquet Anne-Lise (2014). Observer, Analyser et Gérer la variabilité de la reproduction et du recrutement de l’huître creuse en France : Le Réseau Velyger. Rapport annuel 2013 . R.INT.BREST RBE/PFOM/PI 2014-1 . https://doi.org/10.13155/31091

2013

Degremont Lionel, Guyader Tanguy, Tourbiez Delphine, Pepin Jean-Francois (2013). Is horizontal transmission of the Ostreid herpesvirus OsHV-1 in Crassostrea gigas affected by unselected or selected survival status in adults to juveniles? Aquaculture , 408, 51-57 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2013.05.025 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00142/25310/
Piquet Jean-Come, Pepin Jean-Francois (2013). SANICLAIRE : Rôle des pratiques d'affinage en claire pour la qualité microbiologique des coquillages . RST/ODE/LER/PC/13.04 .
Pepin Jean-Francois (2013). Short Technical Report for OsHV-1 detection and quantification by Real Time Polynerase Chain Reaction using OsHV-1 DNA polymerase sequence . RST/LER-PC/13-04 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00137/24814/

2012

Pernet Fabrice, Barret Jean, Le Gall Patrik, Corporeau Charlotte, Degremont Lionel, Lagarde Franck, Pepin Jean-Francois, Keck Nicolas (2012). Mass mortalities of Pacific oysters Crassostrea gigas reflect infectious diseases and vary with farming practices in the Mediterranean Thau lagoon, France . Aquaculture Environment Interactions , 2(3), 215-237 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/aei00041 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19739/
Renault Tristan, Moreau Pierrick, Faury Nicole, Pepin Jean-Francois, Segarra Amelie, Webb Stephen (2012). Analysis of Clinical Ostreid Herpesvirus 1 (Malacoherpesviridae) Specimens by Sequencing Amplified Fragments from Three Virus Genome Areas . Journal Of Virology , 86(10), 5942-5947 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/JVI.06534-11 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19445/
IFREMER. Laboratoire Environnement-Ressources des Pertuis Charentais (2012). Projet DDPC « Développement Durable de la Pêche et de la Conchyliculture dans les Pertuis Charentais» - Rapport d'avancement général des travaux 2011 . Contrat de projets Etat-Région Poitou-Charentes 2007-2013 - Convention n° 08/RPC-A-29 du 19 mai 2008 .
Segarra Amelie, Faury Nicole, Haffner Philippe, Pepin Jean-Francois, Tourbiez Delphine, Trancart Suzanne, Travers Marie-Agnes, Renault Tristan (2012). Expression de gènes viraux de l'herpès virus OsHV-1 sous sa forme µVar chez l'huître creuse, Crassostrea gigas . XIVèmes Journées. Francophones de Virologie, Institut Pasteur, 29-30 mars 2012, Paris . https://archimer.ifremer.fr/doc/00195/30627/

2011

Saulnier Denis, Pepin Jean-Francois, Guesdon Stephane, Degremont Lionel, Faury Nicole, Haffner Philippe, Renault Tristan, Travers Marie-Agnes, Tourbiez Delphine, Geairon Philippe, Le Moine Olivier, Seugnet Jean-Luc, Soletchnik Patrick (2011). Mortalités massives de l'huître creuse - Rapport final du programme de recherche sur l'étude de la cinétique de détection d'agents infectieux associés à des épisodes de mortalités de naissains d'huîtres creuses Crassostrea gigas sur un site ostréicole de Marennes-Oléron (CIDAGINF 2009-2010) . https://archimer.ifremer.fr/doc/00058/16920/
Pepin Jean-Francois, Soletchnik Patrick, Lupo Coralie, Geairon Philippe, Seugnet Jean-Luc, Robert Stephane, Bernard Ismal, Le Moine Olivier (2011). Situation of wild beds of Crassostrea gigas regarding OsHV-1 µvar: spatiotemporal description of contamination in Pacific oyster wild beds in Marennes Oleron Bay . 15th International European Association of Fish Pathologists conference, Split, Croatia, 12-16th September 2011 .
Pernet Fabrice, Barret Jean, Le Gall Patrik, Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Huvet Arnaud, Corporeau Charlotte, Boudry Pierre, Quere Claudie, Degremont Lionel, Pepin Jean-Francois, Saulnier Denis, Boulet Hélène, Keck Nicolas (2011). Mortalités massives de l’Huître creuse: causes et perspectives . RST/LER/LR 11-013 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15404/
Pepin Jean-Francois (2011). Essais in vitro et in vivo pour tester l’inactivation du pouvoir infectieux d’OsHV-1 par les UV, via un modèle Larves d'huître-virus en pathologie expérimentale et test de la photo-réactivation du virus par la lumière solaire . RBE/SG2M/LGPMM/PEPIN-JF/Bivalife-2011 .
Cochennec-Laureau Nathalie, Baud Jean-Pierre, Pepin Jean-Francois, Benabdelmouna Abdellah, Soletchnik Patrick, Lupo Coralie, Garcia Celine, Arzul Isabelle, Boudry Pierre, Huvet Arnaud, Pernet Fabrice, Bachere Evelyne, Bedier Edouard, Petton Bruno, Gaussem Florian, Stanisiere Jean-Yves, Degremont Lionel (2011). Les surmortalités des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas : acquis des recherches en 2010 . RST/LER/MPL/11.07 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14423/
Schikorski David, Renault Tristan, Saulnier Denis, Faury Nicole, Moreau Pierrick, Pepin Jean-Francois (2011). Experimental infection of Pacific oyster Crassostrea gigas spat by ostreid herpesvirus 1: demonstration of oyster spat susceptibility . Veterinary Research , 42, 1-13 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1186/1297-9716-42-27 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00037/14795/
Bechemin Christian, Soletchnik Patrick, Le Moine Olivier, Thomas Gerard, Biais Gerard, Girard Sophie (2011). Projet « Développement durable des Pertuis charentais». Rapport d'avancement général des travaux 2010 . Contrat de projets Etat-Région Poitou-Charentes 2007-2013 - Convention n° 08/RPC-A-29 du 19 mai 2008 .
Schikorski David, Faury Nicole, Pepin Jean-Francois, Saulnier Denis, Tourbiez Delphine, Renault Tristan (2011). Experimental ostreid herpesvirus 1 infection of the Pacific oyster Crassostrea gigas: Kinetics of virus DNA detection by q-PCR in seawater and in oyster samples . Virus Research , 155(1), 28-34 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.virusres.2010.07.031 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00025/13607/
Soletchnik Patrick, Le Moine Olivier, Lupo Coralie, Robert Stephane, Geairon Philippe, Bernard Ismael, Pepin Jean-Francois (2011). Les huîtres sauvages sont-elles contaminées par le virus de l’herpes (OsHV-1 microvar) dans les pertuis charentais ? 39ème édition du Salon National du matériel ostréicole, mytilicole, cultures marines et pêches. La Tremblade, France . https://archimer.ifremer.fr/doc/00442/55354/
Soletchnik Patrick, Le Moine Olivier, Lupo Coralie, Robert Stephane, Geairon Philippe, Seugnet Jean-Luc, Bernard Ismael, Pepin Jean-Francois (2011). Etat de la contamination des stocks sauvages d'huîtres C. gigas par le virus herpes OsHV-1 µvar dans les pertuis charentais (2010) . Journées REPAMO. 12-13 avril 2011, La Tremblade, France .
Guichard Benjamin, Francois Cyrille, Joly Jean-Pierre, Garcia Celine, Saulnier Denis, Pepin Jean-Francois, Arzul Isabelle, Omnes Emmanuelle, Tourbiez Delphine, Faury Nicole, Haffner Philippe, Chollet Bruno, Robert Maeva, Renault Tristan, Rauflet Fabienne, Le Gagneur Eric, Ropert Michel, Mouillard Gilbert, Gerla Daniel, Annezo Jean-Pierre, Le Gal Dominique, Langlade Aime, Bedier Edouard, Brerette Stéphane, Chabirand Jean-Michel, Grizon James, Robert Stephane, Courtois Olivier, Rumebe Myriam, Cantin Christian (2011). Bilan 2010 du réseau Repamo - Réseau national de surveillance de la santé des mollusques marins . https://archimer.ifremer.fr/doc/00059/17050/

2010

Segarra Amelie, Pepin Jean-Francois, Arzul Isabelle, Morga Benjamin, Faury Nicole, Renault Tristan (2010). Detection and description of a particular Ostreid herpesvirus 1 genotype associated with massive mortality outbreaks of Pacific oysters, Crassostrea gigas, in France in 2008 . Virus Research , 153(1), 92-99 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.virusres.2010.07.011 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00011/12260/
Pernet Fabrice, Barret Jean, Le Gall Patrik, Malet Nathalie, Pastoureaud Annie, Munaron Dominique, de Lorgeril Julien, Bachere Evelyne, Vaquer Andre, Huvet Arnaud, Corporeau Charlotte, Normand Julien, Boudry Pierre, Moal Jeanne, Quere Claudie, Quilien Virgile, Daniel Jean-Yves, Pepin Jean-Francois, Saulnier Denis, Gonzalez Jean-Louis (2010). Mortalité du naissain d’Huître creuse Crassostrea gigas dans l’étang de Thau en 2009 . RST.DOP/LER/LR 10-008 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11354/
Cochennec-Laureau Nathalie, Baud Jean-Pierre, Bedier Edouard, Boudry Pierre, Huvet Arnaud, Nicolas Jean-Louis, Pepin Jean-Francois, Petton Bruno (2010). Bilan des « Journées Surmortalité des huîtres creuses, Crassostrea gigas » du Programme P7 « Aquaculture Durable » des 8 et 9 décembre 2009 . Bilan des « Journées Surmortalité des huîtres creuses du Programme P7 » 2009 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/7393/
Francois Cyrille, Joly Jean-Pierre, Garcia Celine, Miossec Laurence, Saulnier Denis, Pepin Jean-Francois, Arzul Isabelle, Omnes Emmanuelle, Tourbiez Delphine, Faury Nicole, Haffner Philippe, Chollet Bruno, Robert Maeva, Cobret Laetitia, Renault Tristan, Rauflet Fabienne, Le Gagneur Eric, Ropert Michel, Mouillard Gilbert, Gerla Daniel, Annezo Jean-Pierre, Le Gal Dominique, Langlade Aime, Bedier Edouard, Breerette Stephane, Chabirand Jean-Michel, Grizon James, Robert Stephane, Courtois Olivier, Rumebe Myriam (2010). Bilan 2009 du réseau REPAMO - Réseau national de surveillace de la santé des mollusques marins . https://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19711/

2009

Renault Tristan, Allain Gwenhael, Arzul Isabelle, Chollet Bruno, Cobret Laetitia, de Decker Sophie, Faury Nicole, Ferrand Sylvie, Francois Cyrille, Garcia Celine, Haffner Philippe, Joly Jean-Pierre, Miossec Laurence, Morga Benjamin, Nicolas Jean-Louis, Omnes Emmanuelle, Pepin Jean-Francois, Saulnier Denis, Schikorski David, Segarra Amelie (2009). Summer mortality outbreaks of French Pacific oysters Crassostrea gigas in 2008 and 2009 . 14th EAFP International Conference, Diseases of Fish and Shellfish, 14th to 17th September 2009, Prague, Czech Republic .
Pepin Jean-Francois, Segarra Amelie, Faury Nicole, Morga Benjamin, Tourbiez Delphine, Aubert Magalie, Renault Tristan (2009). Summer oyster mortalities in 2008 in France and characterization of a new genotype in isolates of Ostreid Herpesvirus . 14th International EAFP Conference on Diseases of Fish and Shellfish (EAFP 2009), 14 - 19 September 2009, Prague, Czech Republic .
Sauvage Christopher, Pepin Jean-Francois, Lapegue Sylvie, Boudry Pierre, Renault Tristan (2009). Ostreid herpes virus 1 infection in families of the Pacific oyster, Crassostrea gigas, during a summer mortality outbreak: Differences in viral DNA detection and quantification using real-time PCR . Virus Research , 142(1-2), 181-187 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.virusres.2009.02.013 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6265/
Francois Cyrille, Garcia Celine, Arzul Isabelle, Joly Jean-Pierre, Miossec Laurence, Chollet Bruno, Ferrand Sylvie, Robert Maeva, Tourbiez Delphine, Omnes Emmanuelle, Cobret Laetitia, Faury Nicole, Haffner Philippe, Saulnier Denis, Pepin Jean-Francois, Renault Tristan, Antajan Elvire, Rauflet Fabienne, Ropert Michel, Mouillard Gilbert, Gerla Daniel, Annezo Jean-Pierre, Le Gal Dominique, Langlade Aime, Bedier Edouard, Nourry Max, Chabirand Jean-Michel, Fillon Alain, Robert Stephane, Courtois Olivier (2009). Bilan 2008 du réseau REPAMO - Réseau national de surveillance de la santé des mollusques marins . https://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19709/

2008

Renault Tristan, Faury Nicole, Barbosa Valerie, Moreau Kevin, Haffner Philippe, Pepin Jean-Francois (2008). Antiviral immunity in the Pacific oyster, Crassostrea gigas: last development and perspective . WAS - World Aquaculture Society . https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4035/
Pepin Jean-Francois, Riou Antoine, Renault Tristan (2008). Rapid and sensitive detection of ostreid herpesvirus 1 in oyster samples by real-time PCR . Journal of Virological Methods , 149(2), 269-276 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2008.01.022 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3951/
Pepin Jean-Francois, Solliec Gaelle, Vigneron Vassilia, Thebault Anne, Lamothe Julien, Renault Tristan (2008). Recherches d'ADN d'hepès virus infectant les mollusques dans les populations d'huîtres en milieu naturel et dans leur environnement . Présentation - Colloque ASPS Impact des organismes pathogènes et des micropolluants sur l'état de santé des poissons, mollusques et crustacés des milieux naturesl : de l'individu au peuplement, Ifremer, Nantes, 11-12 mars 2008 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3716/
Renault Tristan, Francois Cyrille, Pepin Jean-Francois, Saulnier Denis, Nicolas Jean-Louis, Garcia Celine, Joly Jean-Pierre, Arzul Isabelle, Miossec Laurence, Ferrand Sylvie, Robert Maeva, Chollet Bruno, Faury Nicole, Haffner Philippe (2008). Mortalités anormales en écloseries/nurseries . Journée REPAMO, 30-31 Janvier 2008, Nantes, France .
Joly Jean-Pierre, Francois Cyrille, Garcia Celine, Arzul Isabelle, Miossec Laurence, Robert Maeva, Ferrand Sylvie, Chollet Bruno, Saulnier Denis, Pepin Jean-Francois, Haffner Philippe, de Decker Sophie (2008). Mortalités anormales en 2007 . Journée REPAMO, 30-31 Janvier 2008, Nantes, France .

2007

Varsamos S., Pepin Jean-Francois, Sauvage Christopher, Renault Tristan (2007). Development of a new diagnostic tool (Mini-Array) for ostreid Herpesvrus 1 (OsHV-1) detection in the Pacific oyster Crassostre gigas . 13th EAFP International Conference on 'Diseases of Fish and Shellfish' . https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3652/
Pepin Jean-Francois, Riou Antoine, Renault Tristan (2007). Rapid and sensitive detection of ostreid Herpesvirus 1 in oyster samples by real-time PCR (Poster) . 13th EAFP International Conference on 'Diseases of Fish and Shellfish' . https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3653/
Suquet Marc, Agogue Julie, Brizard Raphael, Haffray Pierrick, Labbe Catherine, Le Coz Jean-Rene, Pepin Jean-Francois, Rault Paul, Saulnier Denis (2007). Compte rendu final du projet Triplofimer : Fiabilité et qualité de la production de naissains triploïdes d'huître creuse (Crassostrea gigas) . Convention Ofimer 052/05/C . https://archimer.ifremer.fr/doc/00304/41554/
Batista Frederico, Arzul Isabelle, Pepin Jean-Francois, Ruano Francisco, Friedman Carolyn S., Boudry Pierre, Renault Tristan (2007). Detection of ostreid herpesvirus 1 DNA by PCR in bivalve molluscs: A critical review . Journal of Virological Methods , 139(1), 1-11 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2006.09.005 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2322/

2006

Brizard Raphael, Boudry Pierre, Haffray Patrick, Labbe C., Suquet Marc, Robert Rene, Masse G., Pepin Jean-Francois, Saulnier Denis (2006). Mise au point d'outils de gestion des gamètes mâles d'huîtres creuses Crassostrea gigas diploïdes et tétraploïdes à des fins de conservation et de diffusion . 6ème Colloque BRG (Bureau Ressources Génétique) . https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3339/
Nicolas Jean-Louis, Renault Tristan, Gagnaire Beatrice, Garcia Celine, Le Roux F, Miossec Laurence, Pepin Jean-Francois, Saulnier Denis (2006). Défi MOREST - Mortalités estivales de l'huître creuse Crassostrea gigas - Caractérisation des facteurs de risques associés aux mortalités estivales - Synthèse du thème 5 - Risque associé aux pathogènes. (La Rochelle 14-15 mars 2006) . https://archimer.ifremer.fr/doc/00304/41535/
Varsamos S, Flik G, Pepin Jean-Francois, Bonga S, Breuil Gilles (2006). Husbandry stress during early life stages affects the stress response and health status of juvenile sea bass, Dicentrarchus labrax . Fish & Shellfish Immunology , 20(1), 83-96 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.fsi.2005.04.005 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/2395/

2005

Francois Cyrille, Pepin Jean-Francois (2005). Disinfectants and antiseptics used in mollusc hatcheries and nurseries . Actes International Coneference on Shellifsh Restoration, Brest, France 2-5 Octobre 2005, 17 p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/3312/

2003

Coeurdacier Jean-Luc, Laporte F, Pepin Jean-Francois (2003). Preliminary approach to find synthetic peptides from nodavirus capsid potentially protective against sea bass viral encephalopathy and retinopathy . Fish And Shellfish Immunology , 14(5), 435-447 . https://doi.org/10.1006/fsim.2002.0449

2002

Breuil Gilles, Pepin Jean-Francois, Boscher S, Thiery R (2002). Experimental vertical transmission of nodavirus from broodfish to eggs and larvae of the sea bass, Dicentrarchus labrax (L.) . Journal Of Fish Diseases , 25(12), 697-702 . https://doi.org/10.1046/j.1365-2761.2002.00406.x
Coeurdacier Jean-Luc, Breuil Gilles, Pepin Jean-Francois, Mouchel Olivier, Fauvel Christian, Laporte Florent, Thiery Richard, Castric J, Raymond Jean-Christophe, Baudin Laurencin Félix (2002). Recherche de moyens de dépistage et de prévention de la nodavirose du bar . ANVAR A9804041J 1998-2002 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27874/

2001

Breuil Gilles, Thiery R, Pepin Jean-Francois, Blancheton Jean-Paul (2001). The control of nodavirus disease in sea bass, Dicentrarchus labrax, from breeder to commercial size: toward a new approach of organic aquaculture . Aquaculture Production Systems: Exclusion of Pathogens and Other Undesirables. C.-S. Lee and P.J. O’Bryen, Editors. Biosecurity inThe World Aquaculture Society, Baton Rouge, Louisiana, USA. pp.65-79 .
Breuil Gilles, Mouchel Olivier, Fauvel Christian, Pepin Jean-Francois (2001). Sea bass Dicentrarchus labrax nervous necrosis virus isolates with distinct pathogenicity to sea bass larvae . Diseases of aquatic organisms , 45(1), 25-31 . Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/814/

2000

Breuil Gilles, Pepin Jean-Francois, Castric J, Fauvel Christian, Thiery R (2000). Detection of serum antibodies against nodavirus in wild and farmed adult sea bass: Application to the screening of broodstock in sea bass hatcheries . Bulletin Of The European Association Of Fish Pathologists , 20(3), 95-100 .

1999

Coeurdacier Jean-Luc, Laporte Florent, Pepin Jean-Francois (1999). Preliminary study of immunogenicity and protection against nodavirus following injection of synthetic peptides from its capsid protein. EAFP 1999 - European Association of Fish patologist : IXth International Conference on Diseases of Fish and Shellfish. 20-24 septembre, Rhodes, Grèce .

1997

Coeurdacier Jean-Luc, Pepin Jean-Francois, Fauvel Christian, Legall P, Bourmaud Alain, Romestand Bernard (1997). Alterations in total protein, IgM and specific antibody activity of male and female sea bass (Dicentrarchus labrax L, 1758) sera following injection with killed Vibrio anguillarum . Fish & Shellfish Immunology , 7(3), 151-160 . https://doi.org/10.1006/fsim.1996.0071
Breuil Gilles, Vassiloglou Barbara, Pepin Jean-Francois, Romestand Bernard (1997). Ontogeny of IgM-bearing cells and changes in the immunoglobulin M-like protein level (IgM) during larval stages in sea bass (Dicentrarchus labrax) . Fish & Shellfish Immunology , 7(1), 29-43 . https://doi.org/10.1006/fsim.1996.0061
Pepin Jean-Francois, Breuil Gilles, Rigobert P, Romestand Bernard (1997). Recherche et caractérisation d'immunoglobulines dans les oeufs du loup (Dicentrarchus labrax) . Ichtyophysiologica Acta , 20, 77-85 . Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00272/38275/
Pepin Jean-Francois, Le Gall Patrik, Fauvel Christian (1997). Etude de la cinétique des immunoglobulines et des anticorps de l'ovocyte jusqu'à la larve, chez le loup (Dicentrarchus labrax) . Ichtyophysiologica Acta , 20, 87-101 .

1994

Comps Michel, Pepin Jean-Francois, Bonami Jr (1994). Purification and characterization of two fish encephalitis viruses (FEV) infecting Lates calcarifer and Dicentrarchus labrax . Aquaculture , 123(1-2), 1-10 . https://doi.org/10.1016/0044-8486(94)90114-7

1993

Pepin Jean-Francois, Emery Eric (1993). Marine cytophaga-like bacteria (CLB) isolated from diseased reared sea bass (Dicentrarchus labrax L.) from French mediterranean coast . Bulletin of the European Association of Fish Pathologists , 13(5), 165-167 . Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00271/38252/

1992

Bourmaud A. F., Romestand B, Breuil Gilles, Pepin Jean-Francois, Coeurdacier Jean-Luc, Laprade M, Doutre P, Bouix G (1992). Purification et caractérisation biochimique des immunoglobulines like du loup Dicentrarchus labrax . PAMAQ 5, Fifth International colloquium on PAthology in Marine AQuaculture, 2-4 avril 1992, Montpellier, France .


Haut de page