Battistel Clémentine, Mouren Jean-Christophe, Morga Benjamin, Pelletier Camille, Canier Lydie, Garcia Celine, Arzul Isabelle, Auffret Pauline, Leroi Laura, Chevignon Germain, Durand Patrick, Jacquot Maude (2023). MoPSeq-DB: Mollusc Pathogen Sequence DataBase. IFREMER. https://doi.org//10.12770/52134702-4bbd-4c63-af34-9a2cde28e0cc

Carrier Gregory, Berthelier Jérémy, Maupetit Agathe, Nicolau Elodie, Marbouty Martial, Schreiber Nathalie, Charrier Aurelie, Carcopino Clemence, Leroi Laura, Saint-Jean Bruno (2024). Genetic and phenotypic intra-species diversity of alga Tisochrysis lutea reveals original genetic structure and domestication potential . European Journal of Phycology , 59(1), 94-111 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1080/09670262.2023.2249073 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00855/96704/

Gourmelon Michele (2023). Microbiomes dans les écosystèmes estuariens en France : ROME, le réseau d’ADN/ARN environnemental . Journées du réseau O-ADN environnemental. 29-30 Novembre 2023, Cestas .

Siano Raffaele, Arzul Isabelle, Gourmelon Michele, Le Guyader Soizick, Durand Patrick, Serghine Joelle, Parnaudeau Sylvain, Quere Julien, Schmitt Sophie, Francoise Sylvaine, Mary Charlotte, Hernandez Farinas Tania, Terre Terrillon Aouregan, Lebrun Luc, Chomerat Nicolas, Seugnet Jean-Luc, Pepin Jean-Francois, Felix Christine, Serais Ophelie, Gobet Angélique, Chevalier Mathieu, Chevignon Germain, Lecadet Cyrielle, Morga Benjamin, Piquet Jean-Come, Lemoine Maud, Leroi Laura, Noel Cyril (2023). Coastal microbiomes in riverine ecosystems of the French coastline: the ROME project . ISEEMPD 2022 - International Symposium on Ecology and Evolution of Marine Parasites and Diseases. 15-18 November 2022 .

Gourmelon Michele (2023). Microbiomes côtiers dans les écosystèmes estuariens en France : le réseau d’ADN/ARN environnemental. ROME . MICROBES 2023 - 18e Congrès National de la SFM ( Société Française de Microbiologie) « Un monde à explorer » . 4-6 octobre 2023, Rennes .

Battistel Clementine, Mouren Jean Christophe, Morga Benjamin, Pelletier Camille, Canier Lydie, Garcia Celine, Arzul Isabelle, Leroi Laura, Durand Patrick, Chevignon Germain, Jacquot Maude (2023). MoPSeq-DB. Molluscs Pathogen Sequences DataBase . JOBIM 2023 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques. 27 au 30 juin 2023, Nancy .

Siano Raffaele, Arzul Isabelle, Gourmelon Michele, Le Guyader Soizick, Durand Patrick, Serghine Joelle, Parnaudeau Sylvain, Quere Julien, Schmitt Sophie, Francoise Sylvaine, Mary Charlotte, Hernandez Farinas Tania, Terre Terrillon Aouregan, Lebrun Luc, Chomerat Nicolas, Seugnet Jean-Luc, Pepin Jean-Francois, Felix Christine, Serais Ophelie, Gobet Angélique, Chevalier Mathieu, Chevignon Germain, Lecadet Cyrielle, Morga Benjamin, Piquet Jean-Come, Lemoine Maud, Leroi Laura, Noel Cyril (2023). Coastal microbiomes in estuarine ecosystems of France: the eDNA network ROME . ASLO - Aquatic Sciences Meeting 2023 "Resilience and Recovery in Aquatic Systems". 4-9 June 2023, Palma de Mallorca, Spain.

Jacquot Maude, Mouren Jean Christophe, Battistel Clementine, Morga Benjamin, Pelletier Camille, Canier Lydie, Garcia Celine, Arzul Isabelle, Leroi Laura, Durand Patrick, Chevignon Germain (2022). MoPSeq-DB: a web platform to share, visualise and analyse sequence data of mollusc pathogens . ISEEMPD 2022 - International Symposium on Ecology and Evolution of Marine Parasites and Diseases. 15-18 November 2022, La Rochelle, France . https://archimer.ifremer.fr/doc/00827/93932/

Tilloy Valentin, Cuzin Pierre, Leroi Laura, Guérin Emilie, Durand Patrick, Alain Sophie (2022). ASPICov: An automated pipeline for identification of SARS-Cov2 nucleotidic variants . Plos One , 17(1), e0262953 (5p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1371/journal.pone.0262953 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00747/85930/

Mouren Jean Christophe (2022). MoPSeq-DB: une plateforme web pour partager, visualiser et analyser des données de séquences d'agents pathogènes de mollusques . Rapport d'alternance de Master 2, parcours Ingénierie Bioinformatique. Université de Nantes .

Guesdon Stephane, Travers Marie-Agnes, Hervio Heath Dominique, Derrien Annick, Genauzeau Sylvie, Schmitt Anne, Quintric Laure, Leroi Laura, Pepin Jean-Francois (2017). Microbial balance, and triggering of recent mussel mortality events in France: Is there a link? AMMR 2017 - 2nd International Symposium on the Advances in Marine Mussel Research. 7th to the 8th of September 2017, Sète, France. https://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52696/

Guesdon Stephane, Travers Marie-Agnes, Hervio Heath Dominique, Derrien Annick, Genauzeau Sylvie, Schmitt Anne, Leroi Laura, Pepin Jean-Francois (2016). Equilibre microbien et initiation des épisodes de mortalité de moules. Y aurait-il un lien? Journées ODE. 8-9 novembre 2016. Logonna Daoulas, France .