Emmanuelle Roque D'Orbcastel

Emmanuelle Roque D'Orbcastel

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URL : https://annuaire.ifremer.fr/cv/17532/en/

ORCID orcid icon : https://orcid.org/0000-0002-0954-0033



Dataset

2024

Kremer Thomas, Rakotovao Rraherimino, Andrianantenaina Liah, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Galgani Francois, Crucitti Tania, Bidault Adeline, Paul-Pont Ika, Bouvier Thierry (2024). Overview of 38 bacterial species identified by MALDI-TOF analysis from macroplastics and seawater samples of the lagoon of Toliara, Madagascar . SEANOE . https://doi.org/10.17882/100813

2023

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Bibliography

2024

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2023

Naudet Jeanne, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bouvier Thierry, Godreuil Sylvain, Dyall Sabrina, Bouvy Simon, Rieuvilleneuve Fabien, Restrepo-Ortiz Claudia Ximena, Bettarel Yvan, Auguet Jean-Christophe (2023). Identifying macroplastic pathobiomes and antibiotic resistance in a subtropical fish farm . Marine Pollution Bulletin , 194(Part B.), 115267 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2023.115267 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00848/95992/
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Gadoin Elsa, Desnues Christelle, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bouvier Thierry, Auguet Jean-Christophe, Boudin Elyse, Bettarel Yvan (2023). The Unseen Microbes in the Gut, Liver and Skin of Tunas . Frontiers for Young Minds , 11, 818373 (9p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/frym.2023.818373 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00818/93036/

2022

Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Lutier Mathieu, Le Floc'h Emilie, Ruelle Francois, Triplet Sebastien, Le Gall Patrik, Hubert Clarisse, Fortune Martine, Laugier Thierry, Geoffroy Thibault, Crottier Anaïs, Gobet Angélique, Fouilland Eric (2022). Marine ecological aquaculture: a successful Mediterranean integrated multi-trophic aquaculture case study of a fish, oyster and algae assemblage . Aquaculture International , 30(6), 3143-3157 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s10499-022-00953-0 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00788/89980/
Gadoin Elsa, Desnues Christelle, Bouvier Thierry, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Auguet Jean-Christophe, Crochemore Sandrine, Adingra Antoinette, Bettarel Yvan (2022). Tracking spoilage bacteria in the tuna microbiome . Fems Microbiology Ecology , 98(10), fiac110 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/femsec/fiac110 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00794/90565/
Sadoul Bastien, Caprioli Jean-Philippe, Barrier-Loiseau Chloe, Cimiterra Nicolas, Laugier Thierry, Lagarde Franck, Chary Killian, Callier Myriam, Guillermard Marine-Oceane, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2022). Is Holothuria tubulosa the golden goose of ecological aquaculture in the Mediterranean Sea? Aquaculture , 554, 738149 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2022.738149 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00756/86842/
Ifremer (2022). Rapportage annuel du LER/LR. 2021 . ODE/Unité LITTORAL/LER-LR .
Lacoste Elise, Bec Beatrice, Le Gall Patrik, Boufahja Fehmi, Raimbault Patrick, Messiaen Gregory, Ouisse Vincent, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Munaron Dominique, Fiandrino Annie, Lagarde Franck, Mas Sébastien, Callier Myriam, Gaertner-Mazouni Nabila, Richard Marion (2022). Benthic-pelagic coupling under juvenile oyster influence in a French Mediterranean coastal lagoon (Thau Lagoon) . Estuarine Coastal And Shelf Science , 267, 107779 (10p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ecss.2022.107779 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00751/86264/

2021

Gadoin Elsa, Desnues Christelle, Monteil-Bouchard Sonia, Bouvier Thierry, Auguet Jean-Christophe, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bettarel Yvan (2021). Fishing for the Virome of Tropical Tuna . Viruses-basel , 13(7), 1291 (8p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/v13071291 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00704/81646/
Gadoin Elsa, Durand Lucile, Guillou Aurelie, Crochemore Sandrine, Bouvier Thierry, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Dagorn Laurent, Auguet Jean-Christophe, Adingra Antoinette, Desnues Christelle, Bettarel Yvan (2021). Does the Composition of the Gut Bacteriome Change during the Growth of Tuna? Microorganisms , 9(6), 1157 (12p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/microorganisms9061157 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00696/80846/
Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bettarel Yvan, Dellinger Marion, Sadoul Bastien, Bouvier Thierry, Monin Amandé Justin, Dagorn Laurent, Geffroy Benjamin (2021). Measuring cortisol in fish scales to study stress in wild tropical tuna . Environmental Biology Of Fishes , 104(6), 725-732 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s10641-021-01107-6 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00703/81509/
Richard Marion, Rolland Jean-Luc, Gueguen Yannick, de Lorgeril Julien, Pouzadoux Juliette, Mostajir Behzad, Bec Beatrice, Mas Sébastien, Parin David, Le Gall Patrik, Mortreux Serge, Fiandrino Annie, Lagarde Franck, Messiaen Gregory, Fortune Martine, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2021). In Situ Characterisation of Pathogen Dynamics during a Pacific Oyster Mortality Syndrome Episode . Marine Environmental Research , 165, 105251 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2020.105251 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00669/78063/

2020

Cheve Julien, Laugier Thierry, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Desroy Nicolas (2020). Avis de l'Ifremer sur les impacts environnementaux et zoosanitaires d'un élevage de truites dans le Jaudy . DDTM 22 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer des Côtes d'Armor, Délégation à la Mer et au Littoral, Service Aménagement Mer et Littoral, Unité Cultures Marines, Saint-Brieuc , Ref. 20-078_3_Ifremer.LERBN.2020. Avis13_DDTM22_Pisciculture Jaudy - courriel du 5 octobre 2020 , 5p., 5p., 4p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00681/79318/
Lacoste Elise, Boufahja Fehmi, Pelaprat Corinne, Le Gall Patrik, Berteaux Tom, Messiaen Gregory, Mortreux Serge, Oheix Jocelyne, Ouisse Vincent, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Gaertner-Mazouni Nabila, Richard Marion (2020). First simultaneous assessment of macro- and meiobenthic community response to juvenile shellfish culture in a Mediterranean coastal lagoon (Thau, France) . Ecological Indicators , 115, 106462 (9p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106462 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00629/74134/
Gales Amandine, Triplet Sebastien, Geoffroy Thibault, Roques Cécile, Carre Claire, Le Floc'h Emilie, Lanfranchi Mélissa, Simier Monique, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Przybyla Cyrille, Fouilland Eric (2020). Control of the pH for marine microalgae polycultures: A key point for CO2 fixation improvement in intensive cultures . Journal Of Co2 Utilization , 38, 187-193 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jcou.2020.01.019 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00612/72403/

2019

Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Ubertini Martin, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Mortreux Serge, Chiantella Claude, Bec Beatrice, Bonnet Delphine, Roques Cécile, Bernard Ismael, Richard Marion, Guyondet Thomas, Pouvreau Stephane, Lett Christophe (2019). Duality of trophic supply and hydrodynamic connectivity drives spatial patterns of Pacific oyster recruitment . Marine Ecology Progress Series , 632, 81-100 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/meps13151 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00598/70981/
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Richard Marion, Bec Beatrice, Vanhuysse Charles, Mas Sébastien, Parin David, Chantalat Camila, Le Gall Patrik, Fiandrino Annie, Lagarde Franck, Mortreux Serge, Ouisse Vincent, Rolland Jean-Luc, Degut Anaïs, Hatey Elise, Fortune Martine, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Messiaen Gregory, Munaron Dominique, Callier Myriam, Oheix Jocelyne, Derolez Valerie, Mostajir Behzad (2019). Changes in planktonic microbial components in interaction with juvenile oysters during a mortality episode in the Thau lagoon (France) . Aquaculture , 503, 231-241 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2018.12.082 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00474/58559/
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Lagarde Franck, Ubertini Martin, Mortreux Serge, Perignon Adeline, Leurion Axel, Le Gall Patrik, Chiantella Claude, Meddah Slem, Guillou Jean-Louis, Messiaen Gregory, Bec Beatrice, Roques Cecile, Bonnet Delphine, Cochet Hélène, Bernard Ismael, Gervasoni Erika, Richard Marion, Miron Gilles, Fiandrino Annie, Pouvreau Stephane, Roque D'Orbcastel Emmanuelle (2019). Heterogeneity of Japanese Oyster (Crassostrea Gigas) Spat Collection in a Shellfish Farmed Mediterranean Lagoon . In Komatsu T., Ceccaldi HJ., Yoshida J., Prouzet P., Henocque Y. (eds) Oceanography Challenges to Future Earth. Springer, Cham. ISBN 978-3-030-00137-7 ISBN 978-3-030-00138-4 (eBook) https://doi.org/10.1007/978-3-030-00138-4. Chap.27, pp.341-350 (Springer Nature) .
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2018

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Richard Marion, Le Gall Patrik, Mortreux Serge, Ouisse Vincent, Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Fortune Martine, Munaron Dominique, Messiaen Gregory, Oheix Jocelyne, Derolez Valerie, Bellamy Elise, Foucault Elodie, Devique Gabriel, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Bec B, Mostajir B, Hatey E, McKenzie , Callier Myriam, Montagnani Caroline, Rolland Jean-Luc, Mas S, Parin D, Keck , Dedet , Singevin , Bourreau Juliette, Vanhuysse Charles, Chantalat C, Degut A, Neveu , Bourguoin , Fournier , Navarro , Zecchinon , Trabouriech , Galavielle , Avila , Chastel , Anthony (2018). Consequences of oyster mortality episodes on benthic-pelagic coupling in Thau lagoon (France) . AQUA 2018 - World Aquaculture Society Meetings. August 25-29 2018, Montpellier, France .
Richard Marion, Bec Béatrice, Vanhuysse Charles, Mas Sébastien, Parin David, Chantala Camila, Le Gall Patrik, Fiandrino Annie, Lagarde Franck, Mortreux Serge, Ouisse Vincent, Rolland Jean-Luc, Degut Anaïs, Hatey Elise, Fortune Martine, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Messiaen Gregory, Munaron Dominique, Callier Myriam, Oheix Jocelyne, Derolez Valerie, Mostajir Behzad (2018). Changes on planktonic microbial components in interaction with oyster juveniles during a mortality episode in the Thau Lagoon (FRANCE) . AQUA 2018 - World Aquaculture Society Meetings. August 25-29 2018, Montpellier, France .
Lagarde Franck, Richard Marion, Bec Beatrice, Roques Cecile, Mortreux Serge, Bernard Ismael, Chiantella Claude, Messiaen Gregory, Nadalini Jean-Bruno, Hori Masakazu, Hamaguchi Masami, Pouvreau Stephane, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Tremblay Rejean (2018). Trophic environments influence size at metamorphosis and recruitment performance of Pacific oysters . Marine Ecology Progress Series , 602, 135-153 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/meps12666 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00454/56613/
Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Ubertini Martin, Tremblay R, Mortreux Serge, Chiantella Claude, Bec Beatrice, Roques Cécile, Bonnet Delphine, Bernard Ismaël, Cochet H, Messiaen Gregory, Richard Marion, Guyondet Thomas, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Pouvreau Stephane, Lett Christophe (2018). Trophic interactions and connectivity influence spatial patterns of Pacific oyster recruitment in heavily shellfish farmed mediterranean lagoon . AQUA 2018 - World Aquaculture Society Meetings. August 25-29 2018, Montpellier, France .
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2017

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Lagarde Franck, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Ubertini Martin, Mortreux Serge, Bernard Ismael, Fiandrino Annie, Chiantella Claude, Bec Beatrice, Roques Cecile, Bonnet Delphine, Miron Gilles, Richard Marion, Pouvreau Stephane, Lett Christophe (2017). Recruitment of the Pacific oyster Crassostrea gigas in a shellfish-exploited Mediterranean lagoon: discovery, driving factors and a favorable environmental window . Marine Ecology Progress Series , 578, 1-17 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/meps12265 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00398/50899/
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2016

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Lagarde Franck, Fiandrino Annie, Richard Marion, Bernard Ismael, Mortreux Serge, Ubertini Martin, Chiantella Claude, Boj Marie, Meddah Slem, Leurion Axel, Soriano Solenn, Fuhrmann Marine, Le Gall Patrik, Chiera Caroline, Berteaux Tom, Guillou Jean-Louis, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Perignon Adeline, Bonnet Delphine, Roques Cecile, Bec Beatrice, Cochet Helene, Gervasoni Erika, Miron Gilles, Pouvreau Stephane (2015). Déterminisme du recrutement larvaire de l’huître creuse (Crassostrea gigas) dans la lagune de Thau. ODE/UL/LERLR 2015-26 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00279/39054/
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Lagarde Franck, Roque D'Orbcastel Emmanuelle, Perignon Adeline, Mortreux Serge, Fuhrmann Marine, Le Gall Patrik, Leurion Axel, Chiantella Claude, Bec Beatrice, Roques Cecile, Bonnet Delphine, Cochet Helene, Boj Marie, Gervasoni Erika, Miron Gilles, Fiandrino Annie, Pouvreau Stephane, Pernet Fabrice (2013). Larval recruitement of Crassostrea gigas in a french Mediterranean lagoon . 40th CIESM Congress, 28 October - 1 November 2013, Marseille . https://archimer.ifremer.fr/doc/00165/27653/
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