Desdouits Marion, Wacrenier Candice, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Le Guyader Soizick (2020). Raw deep-sequencing data of targeted metagenomics to study the diversity of norovirus GII in shellfish. IFREMER. https://doi.org/10.12770/6e0c6687-22fe-47e0-bc67-81dde633d25b

Ollivier Joanna, James Lowther, Desdouits Marion, Schaeffer Julien, Candice Wacrenier, Bas B. Oude Munnink, Alban Besnard, Frederico Mota Batista, Pascal Garry, Tina Stapleton, Anna Charlotte Schultz, Frank Aarestrup, Marion Koopmans, Miranda de Graaf, Le Guyader Soizick (2020). Application of Next Generation Sequencing on Norovirus-contaminated oyster samples. IFREMER. https://doi.org//10.12770/d26e15ea-a389-402b-b421-48e5d73a2776

Boxman Ingeborg L.A., Molin Ramia, Persson Sofia, Juréus Anna, Jansen Claudia C.C., Sosef Nils P., Le Guyader Soizick, Ollivier Joanna, Summa Maija, Hautaniemi Maria, Suffredini Elisabetta, Di Pasquale Simona, Myrmel Mette, Khatri Mamata, Jamnikar-Ciglenecki Urska, Kusar Darja, Moor Dominik, Butticaz Lisa, Lowther James A., Walker David I., Stapleton Tina, Simonsson Magnus, Dirks René A.M. (2024). An international inter-laboratory study to compare digital PCR with ISO standardized qPCR assays for the detection of norovirus GI and GII in oyster tissue . Food Microbiology , 120, 104478 (12p.) . https://doi.org/10.1016/j.fm.2024.104478

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2023). Rapport d’activités 2022. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence Microbiologie des coquillages . RBE/MASAE/LSEM 23-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00831/94264/

Ollivier Joanna, Lowther James, Desdouits Marion, Schaeffer Julien, Wacrenier Candice, Oude Munnink Bas B., Besnard Alban, Mota Batista Frederico, Stapleton Tina, Schultz Anna Charlotte, Aarestrup Frank, Koopmans Marion, de Graaf Miranda, Le Guyader Soizick (2022). Application of Next Generation Sequencing on Norovirus‐contaminated oyster samples . EFSA Supporting Publications , 19(6), EN-7348E (144p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2022.EN-7348 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00776/88826/

Taligrot H., Monnot M., Ollivier Joanna, Cordier C., Jacquet N., Vallade Emilie, Garry Pascal, Stavrakakis Christophe, Le Guyader Soizick, Moulin P. (2022). Retention of the Tulane virus, a norovirus surrogate, by ultrafiltration in seawater and production systems . Aquaculture , 553, 738096 (9p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2022.738096 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00754/86560/

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2022). Rapport d'activités 2021. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence Microbiologie des coquillages . RBE/MASAE/LSEM 22-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00760/87250/

Garry Pascal, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Jousse Sarah, Ccos Obepine , Le Guyader Soizick (2021). Intérêt des essais interlaboratoires dans la validation d’un indicateur national de suivi épidémiologique de l’épidémie de SARS-CoV-2 par les eaux usées (en France) . SFM 2021 - 16e congrès national de la Société Française de Microbiologie « MICROBES ». 22 au 24 septembre 2021, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00727/83882/

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2021). Rapport d'activités 2020. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . RBE/SGMM/LSEM 21-03 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00691/80332/

Teunis Peter Fm, Le Guyader Soizick, Liu Pengbo, Ollivier Joanna, Moe Christine L (2020). Noroviruses are highly infectious but there is strong variation in host susceptibility and virus pathogenicity . Epidemics , 32, 100401 (21p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.epidem.2020.100401 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00641/75265/

Desdouits Marion, Wacrenier Candice, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Le Guyader Soizick (2020). A Targeted Metagenomics Approach to Study the Diversity of Norovirus GII in Shellfish Implicated in Outbreaks . Viruses-basel , 12(9), 978 (17p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/v12090978 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00646/75831/

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2020). Rapport d’activités 2019. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . RBE/SG2M/LSEM . https://archimer.ifremer.fr/doc/00615/72671/

Desdouits Marion, Garry Pascal, Gourmelon Michele, Hervio Heath Dominique, Hubert Francoise, Kaelin Gaelle, Kergaravat Cedric, Le Mennec Cecile, Le Guyader Soizick, Loiseau Veronique, Lozach Solen, Maillot Jessica, Ollivier Joanna, Parnaudeau Sylvain, Piquet Jean-Come, Quenot Emmanuelle, Rocq Sophie, Schaeffer Julien, Serghine Joelle, Vallade Emilie, Veron Antoine, Wacrenier Candice (2019). Rapport d’activités 2018 – Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. RBE/SG2M/LSEM 18-1 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00491/60218/

Lowther J. A., Bosch A., Butot S., Ollivier Joanna, Maede D., Rutjes S. A., Hardouin G., Lombard B., In'T Veld P., Leclercq A. (2019). Validation of EN ISO method 15216-Part 1-Quantification of hepatitis A virus and norovirus in food matrices . International Journal Of Food Microbiology , 288, 82-90 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2017.11.014 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00476/58776/

Le Guyader Soizick, Garry Pascal, Ollivier Joanna, Piquet Jean-Come (2019). Microbiologie et coquillages : des enjeux et des développements futurs / Microbiology and shellfish : issues and future developments . Bulletin de l'Académie vétérinaire de france , (172), 6pp. Publisher's official version : https://doi.org/10.4267/2042/70602 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00599/71141/

Lapegue Sylvie, Bechemin Christian, Le Guyader Soizick, Stavrakakis Christophe, Rivet Florence (2018). Rapport d’activités 2017 de l’unité SG2M, Santé Génétique et Microbiologie des Mollusques . R.RBE/SG2M/2018-01 .

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2018). Rapport d’activités 2017. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00465/57686/

Randazzo Walter, Khezri Mohammad, Ollivier Joanna, Le Guyader Soizick, Rodriguez-Diaz Jesus, Aznar Rosa, Sanchez Gloria (2018). Optimization of PMAxx pretreatment to distinguish between human norovirus with intact and altered capsids in shellfish and sewage samples . International Journal Of Food Microbiology , 266, 1-7 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2017.11.011 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00411/52208/

Garry Pascal, Hervio Heath Dominique, Le Guyader Soizick (2017). Rapport d’activités 2016. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00433/54493/

Garry Pascal, Le Saux Jean-Claude, Hervio Heath Dominique, Le Guyader Soizick (2016). Rapport d’activités 2015. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00380/49138/

Lapegue Sylvie, Renault Tristan, Bechemin Christian, Le Guyader Soizick, Stavrakakis Christophe, Rivet Florence (2016). Rapport d'activités 2015 de l'Unité SG2M : Santé, Génétique et Microbiologie des Mollusques . https://archimer.ifremer.fr/doc/00319/43055/

Renault Tristan, Lapegue Sylvie, Le Guyader Soizick, Hatt Philippe-Jacques, Rivet Florence (2015). Rapport d'activités 2014 de l'Unité SG2M. Santé, Génétique et Microbiologie des mollusques . https://archimer.ifremer.fr/doc/00283/39455/

Grodzki Marco, Schaeffer Julien, Piquet Jean-Come, Le Saux Jean-Claude, Cheve Julien, Ollivier Joanna, Le Pendu Jacques, Le Guyader Soizick (2014). Bioaccumulation Efficiency, Tissue Distribution, and Environmental Occurrence of Hepatitis E Virus in Bivalve Shellfish from France . Applied And Environmental Microbiology , 80(14), 4269-4276 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.00978-14 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31501/

Le Guyader Soizick, Ollivier Joanna, Le Saux Jean-Claude, Garry Pascal (2014). Les virus entériques humains et l’eau . Revue Francophone des Laboratoires , 2014(459), 41-49 . https://doi.org/10.1016/S1773-035X(14)72363-9

Ventrone Iole, Schaeffer Julien, Ollivier Joanna, Parnaudeau Sylvain, Pepe Tiziana, Le Pendu Jacques, Le Guyader Soizick (2013). Chronic or accidental exposure of oysters to Norovirus: is there any difference in contamination? Journal Of Food Protection , 76(3), 505-509 . https://doi.org/10.4315/0362-028X.JFP-12-296

Benabbes Laila, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Parnaudeau Sylvain, Rhaissi Houria, Nourlil Jalal, Le Guyader Soizick (2013). Norovirus and Other Human Enteric Viruses in Moroccan Shellfish . Food And Environmental Virology , 5(1), 35-40 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s12560-012-9095-8 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00130/24102/

Grodzki Marco, Ollivier Joanna, Le Saux Jean-Claude, Piquet Jean-Come, Noyer Mathilde, Le Guyader Soizick (2012). Impact of Xynthia Tempest on Viral Contamination of Shellfish . Applied And Environmental Microbiology , 78(9), 3508-3511 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.07604-11 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00079/18992/

Le Guyader Soizick, Ollivier Joanna, Le Saux Jean-Claude, Haugarreau Larissa, Pommepuy Monique (2012). Les Norovirus humains et animaux. Intérêt pour la discrimination de l’origine de la contamination dans les eaux et les coquillages / Interest of human and animal norovirus for source tracking . Techniques Sciences Méthodes , (3), 36-42 . https://doi.org/10.1051/tsm/201203036

Thomas Adeline, Le Saux Jean-Claude, Ollivier Joanna, Maalouf Haifa, Pommepuy Monique, Le Guyader Soizick (2011). Norovirus et huîtres : de la terre à la mer ! Virologie , 15(6), 353-360 . Publisher's official version : https://doi.org/10.2903/j.efsa.2011.2190 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00060/17118/

Le Saux Jean-Claude, Mouillard Gilbert, Ollivier Joanna, Lora Monica, Parnaudeau Sylvain, Bougeard Morgane, Pommepuy Monique, Le Guyader Soizick (2011). Contamination des coquillages par le virus de l’hépatite A en baie de Paimpol : identification des voies de transfert (Décembre 2009-Décembre 2010) . Convention 11/1219213/BF .

Butot Sophie, Le Guyader Soizick, Krol Joanna, Putallaz Thierry, Amoroso Richard, Sanchez Gloria (2010). Evaluation of various real-time RT-PCR assays for the detection and quantitation of human norovirus . Journal Of Virological Methods , 167(1), 90-94 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2010.03.018 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00006/11760/

Le Guyader Soizick, Krol Joanna, Ambert-Balay Katia, Ruvoen-Clouet Nathalie, Desaubliaux Benedicte, Parnaudeau Sylvain, Le Saux Jean-Claude, Ponge Agnes, Pothier Pierre, Atmar Robert L., Le Pendu Jacques (2010). Comprehensive Analysis of a Norovirus-Associated Gastroenteritis Outbreak, from the Environment to the Consumer . Journal Of Clinical Microbiology , 48(3), 915-920 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/JCM.01664-09 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11309/

Le Guyader Soizick, Le Saux Jean-Claude, Delmas Guy, Krol Joanna, Ambert-Balay Katia (2009). Virus Aichi, norovirus, astrovirus, entérovirus et rotavirus impliqués dans des cas de gastroentérites suite à la consommation d’huîtres . Virologie , 13(6), 327-329 . Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11301/

Luz Vilarino M., Le Guyader Soizick, Polo David, Schaeffer Julien, Krol Joanna, Romalde Jesus L. (2009). Assessment of human enteric viruses in cultured and wild bivalve molluscs . International Microbiology , 12(3), 145-151 . Publisher's official version : https://doi.org/10.2436/20.1501.01.92 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6957/

Le Saux Jean-Claude, Serais Ophelie, Krol Joanna, Parnaudeau Sylvain, Salvagnac P., Delmas G., Cicchelero V., Claudet J., Pothier P., Balay K., Fiandrino Annie, Pommepuy Monique, Le Guyader Soizick (2009). Evidence of the presence of viral shellfish contamination in shellfish after short rainfall events . Journal of Shellfish Research Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17736/

Le Guyader Soizick, Le Saux Jean-Claude, Ambert-Balay Katia, Krol Joanna, Serais Ophelie, Parnaudeau Sylvain, Giraudon Helene, Delmas Gilles, Pommepuy Monique, Pothier Pierre, Atmar Robert L. (2008). Aichi Virus, Norovirus, Astrovirus, Enterovirus, and Rotavirus Involved in Clinical Cases from a French Oyster-Related Gastroenteritis Outbreak . Journal of Clinical Microbiology , 46(12), 4011-4017 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/JCM.01044-08 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6099/

Le Saux Jean-Claude, Hervio Heath Dominique, Pommepuy Monique, Le Guyader Soizick (2007). Toxi-infections alimentaires collectives à coquillages et expertise crise d'Arcachon - Année 2006 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00306/41708/