Julien Quere

Julien Quere

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Site : Brest

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Dataset

2022

Le Gac Mickael, Quere Julien, Rodriguez Francisco, Sechet Veronique (2022). RNA sequencing of 15 strains of Dinophysis, 2021. IFREMER. https://doi.org/10.12770/b8f4f6fc-fbb0-4f11-a63c-ef9482188f10
Quere Julien, Le Gac Mickael, Rodriguez Francisco (2022). RNA sequencing of 19 strains of Alexandrium minutum, 2021. IFREMER. https://doi.org/10.12770/f3f3a478-7385-45a8-b0e3-50222035bc58
Le Gac Mickael, Quere Julien, Rodriguez Francisco, Prigent Lea (2022). Coastal micro-eukaryote community metatranscriptomic reads. IFREMER. https://doi.org/10.12770/44f3c5bd-1286-443d-8b82-40ac0504066d
Mary Lou, Quere Julien, Le Gac Mickael (2022). RNA sequencing of 62 strains of Alexandrium minutum for Alex_genetic_linkage project, 2022. IFREMER. https://doi.org/10.12770/83a7d65c-816c-4c7b-9f56-c80bde39d879

2021

Le Gac Mickael, Quere Julien, Rodriguez Francisco, Léa Prigent (2021). RNA sequencing of 143 phytoplankton community samples, 2021. IFREMER. https://doi.org//10.12770/e09498d3-cc68-4945-ae78-119d2dd32fcf

2016

Lema Anais Kimberley, Quere Julien, Le Gac Mickael (2016). Inter and intra-specific transcriptional and phenotypic responses of Pseudo-nitzschia under different nutrient conditions. IFREMER. https://doi.org/10.12770/78bba5d5-2112-467c-b35c-722992ded656
Le Gac Mickael, Metegnier Gabriel, Chomerat Nicolas, Malestroit Pascale, Quere Julien, Bouchez Olivier, Siano Raffaele, Destombe Christophe, Guillou Laure, Chapelle Annie (2016). Evolutionary processes and cellular functions underlying divergence in Alexandrium minutum . SEANOE . https://doi.org/10.17882/45445

2015

Metegnier Gabriel, Quere Julien, Le Gac Mickael (2015). Metatranscriptomic sequences from Alexandrium minutum blooms sampled in situ in the bay of Brest (France) between 2013 and 2015. IFREMER. https://doi.org/10.12770/9d4131da-b33b-429b-9cdd-e7325b06f7d8


Bibliography

2023

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Siano Raffaele, Arzul Isabelle, Gourmelon Michele, Le Guyader Soizick, Durand Patrick, Serghine Joelle, Parnaudeau Sylvain, Quere Julien, Schmitt Sophie, Francoise Sylvaine, Mary Charlotte, Hernandez Farinas Tania, Terre Terrillon Aouregan, Lebrun Luc, Chomerat Nicolas, Seugnet Jean-Luc, Pepin Jean-Francois, Felix Christine, Serais Ophelie, Gobet Angélique, Chevalier Mathieu, Chevignon Germain, Lecadet Cyrielle, Morga Benjamin, Piquet Jean-Come, Lemoine Maud, Leroi Laura, Noel Cyril (2023). Coastal microbiomes in riverine ecosystems of the French coastline: the ROME project . ISEEMPD 2022 - International Symposium on Ecology and Evolution of Marine Parasites and Diseases. 15-18 November 2022 .
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Siano Raffaele, Arzul Isabelle, Gourmelon Michele, Le Guyader Soizick, Durand Patrick, The Rome Consortium (2023). Coastal microbiomes in estuarine ecosystems of France: the eDNA network ROME . ASC 2023 - ICES Annual Science Conference 2023. 11–14 September 2023 Bilbao, Spain .
Siano Raffaele, Arzul Isabelle, Gourmelon Michele, Le Guyader Soizick, Durand Patrick, Serghine Joelle, Parnaudeau Sylvain, Quere Julien, Schmitt Sophie, Francoise Sylvaine, Mary Charlotte, Hernandez Farinas Tania, Terre Terrillon Aouregan, Lebrun Luc, Chomerat Nicolas, Seugnet Jean-Luc, Pepin Jean-Francois, Felix Christine, Serais Ophelie, Gobet Angélique, Chevalier Mathieu, Chevignon Germain, Lecadet Cyrielle, Morga Benjamin, Piquet Jean-Come, Lemoine Maud, Leroi Laura, Noel Cyril (2023). Coastal microbiomes in estuarine ecosystems of France: the eDNA network ROME . ASLO - Aquatic Sciences Meeting 2023 "Resilience and Recovery in Aquatic Systems". 4-9 June 2023, Palma de Mallorca, Spain.

2022

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Mary Lou, Quere Julien, Latimier Marie, Rovillon Georges-Augustin, Hégaret Helene, Réveillon Damien, Le Gac Mickael (2022). Genetic association of toxin production in the dinoflagellate Alexandrium minutum . Microbial Genomics , 8(11), 000879 (17p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1099/mgen.0.000879 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00801/91345/

2021

Schapira Mathilde, Roux Pauline, Andre Coralie, Mertens Kenneth, Bilien Gwenael, Terre Terrillon Aouregan, Le Gac-Abernot Chantal, Siano Raffaele, Quere Julien, Bizzozero Lucie, Bonneau Francoise, Bouget Jean-Francois, Cochennec-Laureau Nathalie, Collin Karine, Fortune Mireille, Gabellec Raoul, Le Merrer Yoann, Manach Soazig, Pierre-Duplessix Olivier, Retho Michael, Schmitt Anne, Souchu Philippe, Stachowski-Haberkorn Sabine (2021). Les Efflorescences de Lepidodinium chlorophorum au large de la Loire et de la Vilaine : Déterminisme et conséquences sur la qualité des masses d’eau côtières . Projet EPICE – Rapport final. RST/LER/MPL/21.10 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00724/83598/
Siano Raffaele, Lassudrie Duchesne Malwenn, Cuzin Pierre, Briant Nicolas, Loizeau Veronique, Schmidt Sabine, Ehrhold Axel, Mertens Kenneth, Lambert Clément, Quintric Laure, Noël Cyril, Latimier Marie, Quéré Julien, Durand Patrick, Penaud Aurélie (2021). Sediment archives reveal irreversible shifts in plankton communities after World War II and agricultural pollution . Current Biology , 31(12), 2682-2689.e7 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.03.079 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00690/80195/

2020

Labry Claire, Delmas Daniel, Moriceau Brivaela, Gallinari Morgane, Quere Julien, Youenou Agnes (2020). Effect of P depletion on the functional pools of diatom carbohydrates, and their utilization by bacterial communities . Marine Ecology Progress Series , 641, 49-62 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3354/meps13297 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00628/74045/
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2019

Lema Anais Kimberley, Metegnier Gabriel, Quéré Julien, Latimier Marie, Youenou Agnes, Lambert Christophe, Fauchot Juliette, Le Gac Mickael (2019). Inter and intra-specific transcriptional and phenotypic responses of Pseudo-nitzschia under different nutrient conditions . Genome Biology And Evolution , 11(3), 731-747 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/gbe/evz030 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00482/59392/

2018

Mondeguer Florence, Souard Florence, Guitton Yann, Allard Pierre-Marie, Elie Nicolas, Sibat Manoella, Latimier Marie, Quere Julien, Wolfender Jean-Luc, Siano Raffaele, Hess Philipp (2018). Innovative metabolomic workflows to study growth kinetics dinoflagellate cysts revived from modern and ancient sediments . ICHA2018 - 18th International Conference on Harmful Algae "From ecosystems to socio-ecosystems". 21-26 october 2018, Nantes, France. https://archimer.ifremer.fr/doc/00464/57591/
Mondeguer Florence, Souard Florence, Guitton Yann, Latimier Marie, Quere Julien, Sibat Manoella, Hess Philipp, Siano Raffaele (2018). First insight on metabolomics workflows and differences between dinoflagellate: characterization and discrimination of modern and ancient strains and their algal growth . 11èmes Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RMFM). 23-25 mai 2018, Liège, Belgique . https://archimer.ifremer.fr/doc/00440/55199/
Siano Raffaele, Mondeguer Florence, Latimier Marie, Quere Julien, Sibat Manoella, Le Gac Mickael, Hess Philipp (2018). Dinoflagellate adaptation to coastal ecosystem variations revealed through metabolomic analyses of revived strains . ICHA2018 - 18th International Conference on Harmful Algae "From ecosystems to socio-ecosystems". 21-26 october 2018, Nantes, France .

2017

Siano Raffaele, Mondeguer Florence, Latimier Marie, Quere Julien, Sibat Manoella, Guillou Laure, Hess Philipp (2017). Metabolomic differences between modern and ancient dinoflagellates in phosphorous-limited culture conditions . DINO11 - 11th International Conference on Modern and Fossil Dinoflagellates. 17 to 21 July 2017, Bordeaux (France) .
Siano Raffaele, Mondeguer Florence, Latimier Marie, Quere Julien, Youenou Agnes, Sibat Manoella, Guillou Laure, Hess Philipp (2017). Mini projet GDR. MEDINA 2016-2017. MEtabolomics of ancient populations of DInoflAgellates in phosphorous-limited conditions . Phycotox2017 : conférence annuelle GdR Phycotox - GIS Cyano 2017. 14-16 mars 2017, Gif sur Yvette .

2016

Klouch Z. Khadidja, Caradec Florian, Plus Martin, Hernandez Farinas Tania, Pineau-Guillou Lucia, Chapelle Annie, Schmitt Sophie, Quere Julien, Pineau-Guillou Lucia, Siano Raffaele (2016). Heterogeneous distribution in sediments and dispersal in waters of Alexandrium minutum in a semi-enclosed coastal ecosystem . Harmful Algae , 60, 81-91 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.hal.2016.11.001 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00357/46858/
Klouch Khadidja, Schmidt Sabine, Christen Richard, Andrieux-Loyer Francoise, Le Gac Mickael, Hervio Heath Dominique, Nohemy Quiminet Zujaila, Quere Julien, Madec Lauriane, Bigeard Estelle, Guillou Laure, Siano Raffaele (2016). Multidecadal dynamics of protists and toxic dinoflagellates revealed from paleogenetic analyses of dated sediments of the Bay of Brest (France) . ICHA2016 - 17th International Conférence on Harmful Algae. 9-14 October 2016, Brazil.
Siano Raffaele, Klouch Khadidja, Caradec Florian, Plus Martin, Hernandez Farinas Tania, Pineau-Guillou Lucia, Chapelle Annie, Schmitt Sophie, Quere Julien, Guillou L (2016). Heterogeneous distribution in sediments and dispersal in waters of Alexandrium minutum in a semi-enclosed ecosystem . ICHA2016 - 17th International Conférence on Harmful Algae. 9-14 October 2016, Brazil .
Le Gac Mickael, Metegnier Gabriel, Chomerat Nicolas, Malestroit Pascale, Quere Julien, Bouchez Olivier, Siano Raffaele, Destombe Christophe, Guillou Laure, Chapelle Annie (2016). Evolutionary processes and cellular functions underlying divergence in Alexandrium minutum . Molecular Ecology , 25(20), 5129-5143 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/mec.13815 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00347/45857/
Klouch Khadidja, Schmidt Sabine, Andrieux-Loyer Francoise, Le Gac Mickael, Hervio-Heath Dominique, Qui-Minet Zujaila Nohemi, Quere Julien, Bigeard Estelle, Guillou Laure, Siano Raffaele (2016). Historical records from dated sediment cores reveal the multidecadal dynamic of the toxic dinoflagellate Alexandrium minutum in the Bay of Brest (France) . Fems Microbiology Ecology , 92(7), fiw101 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/femsec/fiw101 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00334/44516/
Labry Claire, Delmas Daniel, Youenou Agnes, Quere Julien, Leynaert Aude, Fraisse Stephane, Raimonet Melanie, Ragueneau Olivier (2016). High alkaline phosphatase activity in phosphate replete waters: The case of two macrotidal estuaries . Limnology And Oceanography , 61(4), 1513-1529 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1002/lno.10315 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00337/44840/
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2015

Chapelle Annie, Le Gac Mickael, Labry Claire, Siano Raffaele, Quere Julien, Caradec Florian, Le Bec Claude, Nezan Elisabeth, Doner Anne, Gouriou Jeremie (2015). The Bay of Brest (France), a new risky site for toxic Alexandrium minutum blooms and PSP shellfish contamination . Harmful algae news , 51, 4-5 . Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00278/38921/
Lunven Michel, Colas Florent, Youenou Agnes, Le Gall Erwan, Crassous Marie-Pierre, Tardivel Morgan, Danielou Marie-Madeleine, Quere Julien, Malestroit Pascale, Delmas Daniel, Labry Claire, Siano Raffaele, Jegou Klet, Bryere Philippe, Gohin Francis, Thyssen Melilotus, Sourisseau Marc, Chapelle Annie, Compere Chantal (2015). Méthodes d’observation et stratégie d’échantillonnage des communautés phytoplanctoniques en milieu côtier. Illustrations à partir de résultats de campagnes réalisées à bord du Côtes de la Manche . 3èmes journées de la Flotte océanographique française - Colloque Flotte côtière. 11-12 juin 2015, Bordeaux .
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2014

Chapelle Annie, Le Bec Claude, Amzil Zouher, Dreanno Catherine, Guillou Laure, Klouch Khadidja, Labry Claire, Le Gac Mickael, Pineau-Guillou Lucia, Siano Raffaele, Abernot Chantal, Andrieux Francoise, Caradec Florian, Destombe Christophe, Dia A., Doner Anne, Duval Julia, Gouriou Jeremie, Lazure Pascal, Lebrun Luc, Le Gal Dominique, Malestroit Pascale, Petton Sebastien, Plus Martin, Quere Julien, Savar Veronique, Schmitt Sophie, Terre A., Youenou Agnes (2014). Étude sur la prolifération de la micro algue Alexandrium minutum en rade de Brest . R.INT.ODE/Dyneco/Pelagos 2014-07 . https://doi.org/10.13155/36487
Nezan Elisabeth, Siano Raffaele, Boulben Sylviane, Six Christophe, Bilien Gwenael, Cheze Karine, Duval Audrey, Le Panse Sophie, Quere Julien, Chomerat Nicolas (2014). Genetic diversity of the harmful family Kareniaceae (Gymnodiniales, Dinophyceae) in France, with the description of Karlodinium gentienii sp. nov.: A new potentially toxic dinoflagellate . Harmful Algae , 40, 75-91 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.hal.2014.10.006 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00225/33611/
Klouch Khadidja, Le Gac Mickael, Schmidt Sabine, Andrieux Francoise, Quere Julien, Bigeard Estelle, Guillou Laure, Siano Raffaele (2014). Invasions of Alexandrium minutum unveiled by sediment biological archives . ICHA 2014 New Zealand. The 16th International conference on Harmful Algae. 27-31 October 2014, Wellington, New Zealand .
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Klouch Khadidja, Qui Minet Zujaila N., Andrieux-Loyer Françoise, Schmidt Sabine, Daniel Anne, Le Gac Mickael, Caradec Florian, Quere Julien, Youenou Agnes, Bigeard Estelle, Guillou Laure, Siano Raffaele (2014). Multidisciplinary paleoecological approach unveiled toxic phytoplankton species invasions and the eutrophication status of coastal ecosystems . ISOBAY 14 - XIV International Symposium on Oceanography of the Bay of Biscay, 11-13 june 2014, Bordeaux, France .
Chapelle Annie, Le Bec Claude, Siano Raffaele, Caradec Florian, Andrieux Francoise (2014). Étude sur la prolifération de la micro algue Alexandrium minutum en rade de Brest. Projet Daoulex. Rapport d’avancement n° 2 : Analyse des traces biologiques d’Alexandrium minutum dans les sédiments de la Rade de Brest. ODE/DYNECO/PELAGOS 2014-03 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00191/30231/
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2013

Chapelle Annie, Le Bec Claude, Le Gac Mickael, Labry Claire, Amzil Zouher, Guillou Laure, Dreanno Catherine, Pineau-Guillou Lucia (2013). Etude sur la prolifération de la micro algue Alexandrium minutum en rade de Brest. Projet Daoulex. Rapport d’avancement n° 1 : Novembre 2013 . ODE/DYNECO/PELAGOS 2013-02 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00191/30230/

2010

Jauzein Cecile, Labry Claire, Youenou Agnes, Quere Julien, Delmas Daniel, Collos Yves (2010). Growth and phosphorus uptake by the toxic dinoflagellate Alexandrium catenella (dinophyceae) in response to phosphate limitation . Journal Of Phycology , 46(5), 926-936 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/j.1529-8817.2010.00878.x , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12641/

2006

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