: Campagnes océanographiques
2023 BICOSE 3 (Ride médio-Atlantique), microbiologie et mesures d’activité (7 semaines). Blog de la campagne.
2022 HERMINE 2 (Ride médio-Atlantique), microbiologie et mesures d’activité (7 semaines). Blog de la campagne.
2021 GeoFLAMME (Mayotte) microbiologie et mesures d’activité (6 semaines). Blog de la campagne
2020 LuckyDivMic / MoMARSAT 2020 (Ride médio-Atlantique), microbiologie et mesures d’activité (5 semaines). Blog de la campagne.
2020 ESSROV 2020 (Mer Méditerranée), tests d'outils à la mer, IBIS (9 jours)
2019 ESSNAUT 2019 (Mer Méditerranée), tests d'outils à la mer, IBIS (5 jours)
2018 BICOSE 2 (Ride médio-Atlantique), microbiologie et mesures d’activité (6 semaines). Blog de la campagne.
2017 ESSNAUT 2017 (Mer Méditerranée), tests d'outils à la mer, IBIS (9 jours)
2017 HERMINE (Ride médio-Atlantique), microbiologie et mesures d’activité (7 semaines). Blog de la campagne.
2014 BICOSE (Ride médio-Atlantique), microbiologie et mesures d’activité (5 semaines). Blog de la campagne.
2008/2013 Campagnes saisonnières dans l’estuaire de la Severn (Pays de Galles), prélèvements de sédiments.
2006 MOBIDIC V (Bassin Marennes-Oléron), prélèvements de sédiments.
2006 MATACORE / AUSFAIR / ZoNéCo 12 (Mer de Tasmanie), microbiologie et biologie moléculaire (5 semaines).
2005 EXOMAR (Ride médio-Atlantique), microbiologie et biologie moléculaire (5 semaines).
Jeux de données
2021
Roussel Erwan, Leroy Elodie, Aube Johanne, Chloe Baumas, Francois David, Moalic Yann, Le Guellec Sebastien, Redou Creff Vanessa, Lesongeur Francoise, Brizard Raphael, Godfroy Anne (2021). Résultats du séquençage PacBio de métagénomes affiliées au superphylum des DPANN. IFREMER. https://doi.org/10.12770/5f64eb4b-e39c-4993-880c-2dac3ec9bd71
Bibliographie
2024
Cueff-Gauchard Valerie, Aube Johanne, Lagadec Jean Romain, Bignon Laurent, Lafontaine Jean-Pierre, Hernandez-Avila I., Marsaud N., Shillito B., Amand L., Roussel Erwan, Cambon Marie-Anne . FISH, a new tool for in situ preservation of RNA in tissues of deep-sea mobile fauna . BioRxiv IN PRESS . Publisher's official version : https://doi.org/10.1101/2024.07.23.604794 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00902/101364/
Besson Florian, Cathalot Cecile, Cambon Marie-Anne, Giunta Thomas, Pelleter Ewan, Rospabé Mathieu, Roussel Erwan, Rouxel Olivier, Ybert Sebastien (2024). Rapport quinquennal sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM) – Période quinquennale 2020-2024 – . REM/2024-016 .
McTeer Logan, Moalic Yann, Cueff-Gauchard Valerie, Catchpole Ryan, Hogrel Gaëlle, Lu Yang, Laurent Sebastien, Hemon Marie, Aubé Johanne, Leroy Elodie, Roussel Erwan, Oberto Jacques, Flament Didier, Dulermo Remi (2024). Cooperation between two modes for DNA replication initiation in the archaeon Thermococcus barophilus . Mbio , 15(4), 15p. Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/mbio.03200-23 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00883/99483/
Cambon Marie-Anne, Cathalot Cecile, Giunta Thomas, Pelleter Ewan, Pradillon Florence, Rospabé Mathieu, Roussel Erwan, Rouxel Olivier, Ybert Sebastien (2024). Rapport annuel sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM) – Période du 1er janvier au 31 décembre 2023 . REM/2024- 006 .
2023
Alix Anne-Sophie, Cambon Marie-Anne, Cathalot Cecile, Cueff-Gauchard Valerie, Giunta Thomas, Pelleter Ewan, Pradillon Florence, Roussel Erwan, Ybert Sebastien (2023). Rapport annuel sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM). Période du 1er janvier au 31 décembre 2022 . REM/2023-003 .
2022
Besson Florian, Cathalot Cecile, Cuif Marion (coord.), Fouquet Yves, Pelleter Ewan, Alix Anne-Sophie, Cambon Marie-Anne, Menot Lenaick, Pradillon Florence, Roussel Erwan, Cueff-Gauchard Valerie (2022). Rapport annuel sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM). Période du 1er janvier au 31 décembre 2021 . REM/2022-008 .
Konn Cecile, Donval Jean-Pierre, Guyader Vivien, Germain Yoan, Alix Anne-Sophie, Roussel Erwan, Rouxel Olivier (2022). Extending the dataset of fluid geochemistry of the Menez Gwen, Lucky Strike, Rainbow, TAG and Snake Pit hydrothermal vent fields: Investigation of temporal stability and organic contribution . Deep-sea Research Part I-oceanographic Research Papers , 179, 103630 (26p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.dsr.2021.103630 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00728/84052/
2021
Le Guellec Sebastien, Leroy Elodie, Courtine Damien, Godfroy Anne, Roussel Erwan (2021). H2-dependent formate production by hyperthermophilic Thermococcales: an alternative to sulfur reduction for reducing-equivalents disposal . Isme Journal , 15(12), 3423-3436 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1038/s41396-021-01020-x , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00697/80950/
Cathalot Cecile, Roussel Erwan, Perhirin Antoine, Redou Creff Vanessa, Donval Jean-Pierre, Guyader Vivien, Roullet Guillaume, Gula Jonathan, Tamburini Christian, Garel Marc, Godfroy Anne, Sarradin Pierre-Marie, Redou (2021). Hydrothermal plumes as hotspots for deep-ocean heterotrophic microbial biomass production . Nature Communications , 12(1), 6861 (10p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1038/s41467-021-26877-6 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00736/84818/
Alix Anne-Sophie, Besson Florian, Cambon Marie-Anne, Cathalot Cecile, Cuif Marion, Fouquet Yves, Menot Lenaick, Pelleter Ewan, Pradillon Florence, Roussel Erwan (2021). Rapport annuel sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM). Période du 1er janvier au 31 décembre 2020 . REM/2021-008 .
Cozannet Marc, Borrel Guillaume, Roussel Erwan, Moalic Yann, Allioux Maxime, Sanvoisin Amandine, Toffin Laurent, Alain Karine (2021). New Insights into the Ecology and Physiology of Methanomassiliicoccales from Terrestrial and Aquatic Environments . Microorganisms , 9(1), 30 (31p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/microorganisms9010030 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00665/77716/
François David, Godfroy Anne, Mathien Clémentine, Aubé Johanne, Cathalot Cecile, Lesongeur Francoise, L'Haridon Stephane, Philippon Xavier, Roussel Erwan (2021). Persephonella atlantica sp. nov.: How to adapt to physico-chemical gradients in high temperature hydrothermal habitats . Systematic And Applied Microbiology , 44(1), 126176 (10p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.syapm.2020.126176 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00665/77688/
2020
L'Haridon Stephane, Haroun Hani, Corre Erwan, Roussel Erwan, Chalopin Morgane, Pignet Patricia, Balière Charlotte, La Cono Violetta, Jebbar Mohamed, Yakimov Michail, Toffin Laurent (2020). Methanohalophilus profundi sp. nov., a methylotrophic halophilic piezophilic methanogen isolated from a deep hypersaline anoxic basin . Systematic And Applied Microbiology , 43(5), 126107 (8p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.syapm.2020.126107 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00635/74744/
L'Haridon Stephane, Toffin Laurent, Roussel Erwan (2020). Methanococcoides . In Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB). William B. Whitman (Superv.Ed.) Online ISBN: 9781118960608| DOI: 10.1002/9781118960608. 9p. (Wiley) . https://archimer.ifremer.fr/doc/00614/72595/
2019
Pelleter Ewan, Cambon Bonavita Marie-Anne, Fouquet Yves, Besson Florian, Alix Anne-Sophie, Menot Lenaick, Pradillon Florence, Roussel Erwan, Cueff-Gauchard Valerie, Cathalot Cecile, Zeppilli Daniela, Ybert Sebastien (2019). Rapport quinquennal sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM). Période 2014 - 2019 . REM/2019-009 .
Parkes Ronald John, Berlendis Sabrina, Roussel Erwan, Bahruji Hasiliza, Webster Gordon, Oldroyd Anthony, Weightman Andrew J., Bowker Michael, Davies Philipp R, Sass Henrik (2019). Rock-crushing derived hydrogen directly supports a methanogenic community: significance for the deep biosphere . Environmental Microbiology Reports , 11(2), 165-172 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/1758-2229.12723 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00483/59444/
Besson Florian, Alix Anne-Sophie, Cathalot Cecile, Fouquet Yves, Pelleter Ewan, Cambon Bonavita Marie-Anne, Menot Lenaick, Pradillon Florence, Roussel Erwan, Cueff-Gauchard Valerie, Ybert Sebastien (2019). Rapport annuel sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM). Période du 1er janvier au 31 décembre 2018 . REM/2019-002 .
2018
Cambon-Bonavita Marie-Anne, Fouquet Yves, Pelleter Ewan, Menot Lenaick, Alix Anne-Sophie, Cathalot Cecile, Pradillon Florence, Roussel Erwan, Ybert Sebastien (2018). Rapport annuel sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM). Période du 1er janvier au 31 décembre 2017 . REM/2018-006 .
Konn Cecile, Donval Jean-Pierre, Guyader Vivien, Roussel Erwan, Fourre E., Jean-Baptiste P., Pelleter Ewan, Charlou Jean-Luc, Fouquet Yves (2018). Organic, Gas, and Element Geochemistry of Hydrothermal Fluids of the Newly Discovered Extensive Hydrothermal Area in the Wallis and Futuna Region (SW Pacific) . Geofluids , (7692839), 25p. Publisher's official version : https://doi.org/10.1155/2018/7692839 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00431/54245/
2017
Sauvadet Anne-Laure, Lynn Denis H., Roussel Erwan, Le Panse Sophie, Bigeard Estelle, Schrevel Joseph, Guillou Laure (2017). Redescription and phylogenetic analyses of Durchoniella spp. (Ciliophora, Astomatida) associated with the polychaete Cirriformia tentaculata (Montagu, 1808) . European Journal Of Protistology , 61(Part A), 265-277 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ejop.2017.06.007 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00392/50312/
Cambon-Bonavita Marie-Anne, Pelleter Ewan, Fouquet Yves, Alix Anne-Sophie, Besson Florian, Roussel Erwan, Ybert Sebastien (2017). Rapport annuel sur les activités menées par l’Ifremer dans le cadre du contrat d'exploration des sulfures polymétalliques conclu, au nom de la France, avec l'Autorité Internationale des Fonds Marins (AIFM) - Période du 1er janvier au 31 décembre 2016. REM/2017-008 .
2016
Dalmasso Cecile, Oger Philippe, Selva Gwendoline, Courtine Damien, L'Haridon Stephane, Garlaschelli Alexandre, Roussel Erwan, Miyazaki Junichi, Reveillaud Julie, Jebbar Mohamed, Takai Ken, Maignien Lois, Alain Karine (2016). Thermococcus piezophilus sp. nov., a novel hyperthermophilic and piezophilic archaeon with a broad pressure range for growth, isolated from a deepest hydrothermal vent at the Mid-Cayman Rise . Systematic And Applied Microbiology , 39(7), 440-444 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.syapm.2016.08.003 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00348/45949/
Landreau M., Duthoit Frederique, Roussel Erwan, Schonherr S., Georges Myriam, Godfroy Anne, Le Blay G. (2016). Cultivation of an immobilized (hyper)thermophilic marine microbial community in a bioreactor . Fems Microbiology Letters , 363(17), fnw194 (1-7) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/femsle/fnw194 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00347/45851/
2015
Roussel Erwan, Cragg Barry A., Webster Gordon, Sass Henrik, Tang Xiaohong, Williams Angharad S., Gorra Roberta, Weightman Andrew J., Parkes R. John (2015). Complex coupled metabolic and prokaryotic community responses to increasing temperatures in anaerobic marine sediments: critical temperatures and substrate changes . Fems Microbiology Ecology , 91(8), fiv084 (1-16) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1093/femsec/fiv084 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00273/38464/
Vigneron Adrien, L Haridon Stephane, Godfroy Anne, Roussel Erwan, Cragg Barry A., Parkes R. John, Toffin Laurent (2015). Evidence of active methanogen communities in shallow sediments of the Sonora Margin cold seeps . Applied And Environmental Microbiology , 81(10), 3451-3459 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.00147-15 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00256/36737/
O'Sullivan Louise A., Roussel Erwan, Weightman Andrew J., Webster Gordon, Hubert Casey R. J., Bell Emma, Head Ian, Sass Henrik, Parkes R. John (2015). Survival of Desulfotomaculum spores from estuarine sediments after serial autoclaving and high-temperature exposure . Isme Journal , 9(4), 922-933 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1038/ismej.2014.190 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00216/32759/
2014
Vigneron Adrien, Cruaud Perrine, Roussel Erwan, Pignet Patricia, Caprais Jean-Claude, Callac Nolwenn, Ciobanu Maria Cristina, Godfroy Anne, Cragg Barry A., Parkes John R., Van Nostrand Joy D., He Zhili, Zhou Jizhong, Toffin Laurent, Callac Nolwenn (2014). Phylogenetic and Functional Diversity of Microbial Communities Associated with Subsurface Sediments of the Sonora Margin, Guaymas Basin . Plos One , 9(8), e104427 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1371/journal.pone.0104427 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00203/31408/
Parkes R. John, Cragg Barry, Roussel Erwan, Webster Gordon, Weightman Andrew, Sass Henrik (2014). A review of prokaryotic populations and processes in sub-seafloor sediments, including biosphere:geosphere interactions . Marine Geology , 352, 409-425 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.margeo.2014.02.009 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00178/28965/
Watkins Andrew J., Roussel Erwan, Parkes R. John, Sass Henrik (2014). Glycine betaine as a direct substrate for methanogens (Methanococcoides spp.) . Applied And Environmental Microbiology , 80(1), 289-293 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/AEM.03076-13 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00161/27235/
2012
Watkins Andrew J., Roussel Erwan, Webster Gordon, Parkes R. John, Sass Henrik (2012). Choline and N,N-Dimethylethanolamine as Direct Substrates for Methanogens . Applied And Environmental Microbiology , 78(23), 8298-8303 . https://doi.org/10.1128/AEM.01941-12
Parkes R. John, Brock Fiona, Banning Natasha, Hornibrook Edward R. C., Roussel Erwan, Weightman Andrew J., Fry John C. (2012). Changes in methanogenic substrate utilization and communities with depth in a salt-marsh, creek sediment in southern England . Estuarine Coastal And Shelf Science , 96, 170-178 . https://doi.org/10.1016/j.ecss.2011.10.025
2011
Roussel Erwan, Konn Cecile, Charlou Jean-Luc, Donval Jean-Pierre, Fouquet Yves, Querellou Joel, Prieur Daniel, Cambon-Bonavita Marie-Anne (2011). Comparison of microbial communities associated with three Atlantic ultramafic hydrothermal systems . Fems Microbiology Ecology , 77(3), 647-665 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/j.1574-6941.2011.01161.x , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00067/17836/
2010
Webster Gordon, Rinna Joachim, Roussel Erwan, Fry John C., Weightman Andrew J., Parkes R. John (2010). Prokaryotic functional diversity in different biogeochemical depth zones in tidal sediments of the Severn Estuary, UK, revealed by stable-isotope probing . Fems Microbiology Ecology , 72(2), 179-197 . https://doi.org/10.1111/j.1574-6941.2010.00848.x
Durand Lucile, Zbinden Magali, Cueff-Gauchard Valerie, Duperron Sebastien, Roussel Erwan, Shillito Bruce, Cambon-Bonavita Marie-Anne (2010). Microbial diversity associated with the hydrothermal shrimp Rimicaris exoculata gut and occurrence of a resident microbial community . Fems Microbiology Ecology , 71(2), 291-303 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/j.1574-6941.2009.00806.x , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/11142/
2009
Cambon-Bonavita Marie-Anne, Nadalig Thierry, Roussel Erwan, Delage Eloise, Duperron Sebastien, Caprais Jean-Claude, Boetius A., Sibuet Myriam (2009). Diversity and distribution of methane-oxidizing microbial communities associated with different faunal assemblages in a giant pockmark of the Gabon continental margin . Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography , 56(23), 2248-2258 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.dsr2.2009.04.007 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/7298/
Roussel Erwan, Sauvadet Anne-Laure, Chaduteau Carine, Fouquet Yves, Charlou Jean-Luc, Prieur Daniel, Cambon Marie-Anne (2009). Archaeal communities associated with shallow to deep subseafloor sediments of the New Caledonia Basin . Environmental Microbiology , 11(9), 2446-2462 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2009.01976.x , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6801/
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Zbinden M, Shillito B, Le Bris Nadine, de Montlaur C, Roussel Erwan, Guyot F, Gaill F, Cambon-Bonavita Marie-Anne (2008). New insigths on the metabolic diversity among the epibiotic microbial communitiy of the hydrothermal shrimp Rimicaris exoculata . Journal of Experimental Marine Biology and Ecology , 359(2), 131-140 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.jembe.2008.03.009 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4563/