Marion Desdouits

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Employeur : Ifremer

Site : Nantes

Adresse postale : Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03

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Jeux de données

2020

Desdouits Marion, Wacrenier Candice, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Le Guyader Soizick (2020). Raw deep-sequencing data of targeted metagenomics to study the diversity of norovirus GII in shellfish. IFREMER. https://doi.org/10.12770/6e0c6687-22fe-47e0-bc67-81dde633d25b
Ollivier Joanna, James Lowther, Desdouits Marion, Schaeffer Julien, Candice Wacrenier, Bas B. Oude Munnink, Alban Besnard, Frederico Mota Batista, Pascal Garry, Tina Stapleton, Anna Charlotte Schultz, Frank Aarestrup, Marion Koopmans, Miranda de Graaf, Le Guyader Soizick (2020). Application of Next Generation Sequencing on Norovirus-contaminated oyster samples. IFREMER. https://doi.org//10.12770/d26e15ea-a389-402b-b421-48e5d73a2776


Bibliographie

2024

Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2024). Rapport d’activités 2023. Laboratoire Santé, Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00900/101169/
Troja Fulvia, Schaeffer Julien, Desdouits Marion, Indio Valentina, de Cesare Alessandra, Le Guyader Soizick (2024). Use of shotgun metagenomic for the analysis of shellfish virome: Comparative assessment of the performances of three capture enrichment kits . FSM 2024 - Food System Microbiomes. 14-17 May 2024, Torino, Italy .

2023

Desdouits Marion, Reynaud Yann, Philippe Cecile, Le Guyader Soizick (2023). A Comprehensive Review for the Surveillance of Human Pathogenic Microorganisms in Shellfish . Microorganisms , 11(9), 2218 (24p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/microorganisms11092218 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00851/96297/
Contrant Maud, Bigault Lionel, Andraud Mathieu, Desdouits Marion, Rocq Sophie, Le Guyader Soizick, Blanchard Yannick (2023). Porcine Epidemic Diarrhea Virus, Surrogate for Coronavirus Decay Measurement in French Coastal Waters and Contribution to Coronavirus Risk Evaluation . Microbiology Spectrum , 11(4), 13p. Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/spectrum.01844-23 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00845/95719/
Auger Audrey, Yu Shin-Yi, Guu Shih-Yun, Quéméner Agnès, Euller Gabriel, Ando Hiromune, Desdouits Marion, Le Guyader Soizick, Khoo Kay-Hooi, Le Pendu Jacques, Chirat Frédéric, Guerardel Yann (2023). Species-Specific N-Glycomes and Methylation Patterns of Oysters Crassostrea gigas and Ostrea edulis and Their Possible Consequences for the Norovirus–HBGA Interaction . Marine Drugs , 21(6), 342 (25p.) . Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00840/95215/
Euller Gabriel, Le Mennec Cecile, Schaeffer Julien, Zeng Xi-Lei, Ettayebi Khalil, Atmar Robert L., Le Guyader Soizick, Estes Mary K., Desdouits Marion (2023). Human Sapovirus Replication in Human Intestinal Enteroids . Journal of Virology , 97(4), e00383-23 (14p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1128/jvi.00383-23 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00839/95134/
Contrant Maud, Bigault Lionel, Andraud Mathieu, Desdouits Marion, Rocq Sophie, Le Guyader Soizick, Blanchard Yannick . Evaluation of coronavirus decay in French coastal water and application to SARS-CoV-2 risk evaluation using Porcine Epidemic Diarrhea Virus as surrogate . medRxiv IN PRESS . Publisher's official version : https://doi.org/10.1101/2023.04.18.23288060 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00879/99115/
Schaeffer Julien, Desdouits Marion, Besnard Alban, Le Guyader Soizick (2023). Looking into sewage: how far can metagenomics help to detect human enteric viruses? Frontiers In Microbiology , 14, 1161674 (17p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1161674 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00834/94622/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2023). Rapport d’activités 2022. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence Microbiologie des coquillages . RBE/MASAE/LSEM 23-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00831/94264/

2022

Vincent-Hubert Francoise, Wacrenier Candice, Desdouits Marion, Jousse Sarah, Schaeffer Julien, Le Mehaute Phillipe, Nakache-Danglot Frederique, Le Guyader Soizick, Obepine Consortium (2022). Development of passive samplers for the detection of SARS-CoV-2 in sewage and seawater: Application for the monitoring of sewage . Science Of The Total Environment , 833, 155139 (8p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.155139 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00765/87737/
Desdouits Marion, Polo Montero David, Le Mennec Cecile, Strubbia Sofia, Zeng Xi-Lei, Ettayebi Khalil, Atmar Robert L., Estes Mary K., Le Guyader Soizick (2022). Use of Human Intestinal Enteroids to Evaluate Persistence of Infectious Human Norovirus in Seawater . Emerging Infectious Diseases , 28(7), 1475-1479 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3201/eid2807.220219 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00786/89824/
Barbe Laure, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Jousse Sarah, Wurtzer Sébastien, Moulin Laurent, Le Guyader Soizick, Desdouits Marion (2022). SARS-CoV-2 Whole-Genome Sequencing Using Oxford Nanopore Technology for Variant Monitoring in Wastewaters . Frontiers In Microbiology , 13, 889811 (14p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.889811 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00775/88715/
Ollivier Joanna, Lowther James, Desdouits Marion, Schaeffer Julien, Wacrenier Candice, Oude Munnink Bas B., Besnard Alban, Mota Batista Frederico, Stapleton Tina, Schultz Anna Charlotte, Aarestrup Frank, Koopmans Marion, de Graaf Miranda, Le Guyader Soizick (2022). Application of Next Generation Sequencing on Norovirus‐contaminated oyster samples . EFSA Supporting Publications , 19(6), EN-7348E (144p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2022.EN-7348 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00776/88826/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2022). Rapport d'activités 2021. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence Microbiologie des coquillages . RBE/MASAE/LSEM 22-01 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00760/87250/

2021

Bonny Patrice, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Desdouits Marion, Essia Ngang Jean Justin, Le Guyader Soizick (2021). Human and Animal RNA Virus Diversity Detected by Metagenomics in Cameroonian Clams . Frontiers In Microbiology , 12, 770385 (15p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.770385 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00737/84861/
Euller Gabriel, Auger Audrey, Breiman Adrien, Jazat Jennifer, Le Moullac-Vaidye Béatrice, Chirat Frédéric, Desdouits Marion, Le Pendu Jacques, Guerardel Yann, Le Guyader Soizick (2021). Caractérisation des glycanes impliqués dans les interactions entre huître et virus entériques humains . SFM 2021 - 16e congrès national de la Société Française de Microbiologie « MICROBES ». 22 au 24 septembre 2021, Nantes. https://archimer.ifremer.fr/doc/00727/83879/
Bonny Patrice, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Desdouits Marion, Essia Ngang Jean Justin, Le Guyader Soizick (2021). Diversité des virus entériques dans les palourdes du fleuve SANAGA au Cameroun . SFM 2021 - 16e congrès national de la Société Française de Microbiologie « MICROBES ». 22 au 24 septembre 2021, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00727/83884/
Desdouits Marion, Piquet Jean-Come, Jousse Sarah, Wacrenier Candice, Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Rocq Sophie, Bigault Lionel, Contrant Maud, Garry Pascal, Blanchard Yannick, Le Guyader Soizick (2021). Utiliser les coquillages pour surveiller la contamination du littoral par SARS-CoV-2 ? SFM 2021 - 16e congrès national de la Société Française de Microbiologie « MICROBES ». 22 au 24 septembre 2021, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00727/83880/
Desdouits Marion, Piquet Jean-Come, Wacrenier Candice, Le Mennec Cecile, Parnaudeau Sylvain, Jousse Sarah, Rocq Sophie, Bigault Lionel, Contrant Maud, Garry Pascal, Chavanon Fabienne, Gabellec Raoul, Lamort Laure, Lebrun Luc, Le Gall Patrik, Meteigner Claire, Schmitt Anne, Seugnet Jean-Luc, Serais Ophelie, Peltier Cécile, Bressolette-Bodin Céline, Blanchard Yannick, Le Guyader Soizick (2021). Can shellfish be used to monitor SARS-CoV-2 in the coastal environment? Science Of The Total Environment , 778, 146270 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.146270 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00684/79569/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2021). Rapport d'activités 2020. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . RBE/SGMM/LSEM 21-03 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00691/80332/

2020

Euller Gabriel, Desdouits Marion, Pilven Sophie, Le Guyader Soizick, Garry Pascal (2020). De la terre à la mer. "Usual suspects" de la contamination microbiologique des coquillages . Fête de la science 2020. 09 au 11 octobre 2020, Muséum d'Histoire Naturel, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00675/78754/
Desdouits Marion, Piquet Jean-Come, Rocq Sophie, Euller Gabriel, Le Guyader Soizick, Garry Pascal (2020). De la terre à la mer, les microbes sous surveillance . Fête de la science 2020. 09 au 11 octobre 2020, Muséum d'Histoire Naturel, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00675/78756/
Euller Gabriel, Desdouits Marion, Pilven Sophie, Preux Guillemette, Le Guyader Soizick, Garry Pascal (2020). VirOdyssée, la course du norovirus de la terre à la mer . Fête de la science 2020. 09 au 11 octobre 2020, Muséum d'Histoire Naturel, Nantes . https://archimer.ifremer.fr/doc/00675/78757/
Bonny Patrice, Desdouits Marion, Schaeffer Julien, Garry Pascal, Essia Ngang Jean Justin, Le Guyader Soizick (2020). Contamination of Clams with Human Norovirus and a Novel Hepatitis A Virus in Cameroon . Food And Environmental Virology , 12(3), 274-277 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1007/s12560-020-09432-2 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00635/74745/
Desdouits Marion, Wacrenier Candice, Ollivier Joanna, Schaeffer Julien, Le Guyader Soizick (2020). A Targeted Metagenomics Approach to Study the Diversity of Norovirus GII in Shellfish Implicated in Outbreaks . Viruses-basel , 12(9), 978 (17p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.3390/v12090978 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00646/75831/
Strubbia Sofia, Schaeffer Julien, Besnard Alban, Wacrenier Candice, Le Mennec Cecile, Garry Pascal, Desdouits Marion, Le Guyader Soizick (2020). Metagenomic to evaluate norovirus genomic diversity in oysters: Impact on hexamer selection and targeted capture-based enrichment . International Journal Of Food Microbiology , 323, 108588 (13p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108588 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00614/72575/
Desdouits Marion, de Graaf Miranda, Strubbia Sofia, Oude Munnink Bas B., Kroneman Annelies, Le Guyader Soizick, Koopmans Marion P. G. (2020). Novel opportunities for NGS-based one health surveillance of foodborne viruses . One Health Outlook , 2(1), 14 (8p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1186/s42522-020-00015-6 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00641/75330/
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2020). Rapport d’activités 2019. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . RBE/SG2M/LSEM . https://archimer.ifremer.fr/doc/00615/72671/

2019

Gueguen Yannick, Arzul Isabelle, Goulletquer Philippe (2019). Groupe de Travail « Huîtres » - Plan d’Action 2020-2023. Comprendre et prévoir l’évolution du socio-écosystème ostréicole dans le cadre du changement global . https://archimer.ifremer.fr/doc/00900/101196/

2018

Lapegue Sylvie, Bechemin Christian, Le Guyader Soizick, Stavrakakis Christophe, Rivet Florence (2018). Rapport d’activités 2017 de l’unité SG2M, Santé Génétique et Microbiologie des Mollusques . R.RBE/SG2M/2018-01 .
Garry Pascal, Le Guyader Soizick (2018). Rapport d’activités 2017. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie. Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00465/57686/

2017

Garry Pascal, Hervio Heath Dominique, Le Guyader Soizick (2017). Rapport d’activités 2016. Laboratoire Santé Environnement et Microbiologie, Laboratoire National de Référence de Microbiologie des coquillages . https://archimer.ifremer.fr/doc/00433/54493/
Tricou Vianney, Desdouits Marion, Nakouné Emmanuel, Gessain Antoine, Kazanji Mirdad, Berthet Nicolas (2017). Complete Genome Sequences of Two Chikungunya Viruses Isolated in the Central African Republic in the 1970s and 1980s . Genome Announcements , 5(9), e00003-17 (2p.) . https://doi.org/10.1128/genomeA.00003-17

2016

Biacchesi Stephane, Jouvion Gregory, Merour Emilie, Boukadiri Abdelhak, Desdouits Marion, Ozden Simona, Huerre Michel, Ceccaldi Pierre-Emmanuel, Bremont Michel (2016). Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) muscle satellite cells are targets of salmonid alphavirus infection . Veterinary Research , 47(9), 1-10 . https://doi.org/10.1186/s13567-015-0301-1

2015

Desdouits Marion, Kamgang Basile, Berthet Nicolas, Tricou Vianney, Ngoagouni Carine, Gessain Antoine, Manuguerra Jean-Claude, Nakoune Emmanuel, Kazanji Mirdad (2015). Genetic characterization of Chikungunya virus in the Central African Republic . Infection Genetics And Evolution , 33, 25-31 . https://doi.org/10.1016/j.meegid.2015.04.006
Graziano Francesca, Desdouits Marion, Garzetti Livia, Podini Paola, Alfano Massimo, Rubartelli Anna, Furlan Roberto, Benaroch Philippe, Poli Guido (2015). Extracellular ATP induces the rapid release of HIV-1 from virus containing compartments of human macrophages . Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America , 112(25), E3265-E3273 . https://doi.org/10.1073/pnas.1500656112

2014

Mariani Charlotte, Desdouits Marion, Favard Cyril, Benaroch Philippe, Muriaux Delphine M. (2014). Role of Gag and lipids during HIV-1 assembly in CD4(+) T cells and macrophages . Frontiers In Microbiology , 5(312), 1-9 . Publisher's official version : https://doi.org/10.3389/fmicb.2014.00312 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00344/45490/

2013

Berre Stefano, Gaudin Raphael, de Alencar Bruna Cunha, Desdouits Marion, Chabaud Melanie, Naffakh Nadia, Rabaza-Gairi Marc, Gobert Francois-Xavier, Jouve Mabel, Benaroch Philippe (2013). CD36-specific antibodies block release of HIV-1 from infected primary macrophages and its transmission to T cells . Journal Of Experimental Medicine , 210(12), 2523-2538 . https://doi.org/10.1084/jem.20130566
Desdouits Marion, Munier Sandie, Prevost Marie-Christine, Jeannin Patricia, Butler-Browne Gillian, Ozden Simona, Gessain Antoine, Van Der Werf Sylvie, Naffakh Nadia, Ceccaldi Pierre-Emmanuel (2013). Productive Infection of Human Skeletal Muscle Cells by Pandemic and Seasonal Influenza A(H1N1) Viruses . Plos One , 8(11), e79628 . Publisher's official version : https://doi.org/10.1371/journal.pone.0079628 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00344/45492/
Desdouits Marion, Cassar Olivier, Maisonobe Thierry, Desrames Alexandra, Aouba Achille, Hermine Olivier, Mikol Jacqueline, Polivka Marc, Penisson-Besnier Isabelle, Marcorelles Pascale, Zagnoli Fabien, Papo Thomas, Lacour Arnaud, Amoura Zahir, Haroche Julien, Cherin Patrick, Teixeira Antonio, Benveniste Olivier, Herson Serge, Morin Anne-Sophie, Mortreux Franck, Wattel Eric, Huerre Michel, Cumont Marie-Christine, Martin-Latil Sandra, Butler-Browne Gillian, Gout Olivier, Taylor Graham, Gessain Antoine, Ozden Simona, Ceccaldi Pierre-Emmanuel (2013). HTLV-1-associated inflammatory myopathies: Low proviral load and moderate inflammation in 13 patients from West Indies and West Africa . Journal Of Clinical Virology , 57(1), 70-76 . https://doi.org/10.1016/j.jcv.2012.12.016

2012

Sane Jussi, Kurkela Satu, Desdouits Marion, Kalimo Hannu, Mazalrey Simon, Lokki Marja-Liisa, Vaheri Antti, Helve Tapani, Tornwall Jyrki, Huerre Michel, Butler-Browne Gillian, Ceccaldi Pierre-Emmanuel, Gessain Antoine, Vapalahti Olli (2012). Prolonged Myalgia in Sindbis Virus Infection: Case Description and In Vitro Infection of Myotubes and Myoblasts . Journal Of Infectious Diseases , 206(3), 407-414 . https://doi.org/10.1093/infdis/jis358
Martin-Latil Sandra, Gnaedig Nina F., Mallet Adeline, Desdouits Marion, Guivel-Benhassine Florence, Jeannin Patricia, Prevost Marie-Christine, Schwartz Olivier, Gessain Antoine, Ozden Simona, Ceccaldi Pierre-Emmanuel (2012). Transcytosis of HTLV-1 across a tight human epithelial barrier and infection of subepithelial dendritic cells . Blood , 120(3), 572-580 . https://doi.org/10.1182/blood-2011-08-374637

2010

Brandler Samantha, Lepelley Alice, Desdouits Marion, Guivel-Benhassine Florence, Ceccaldi Pierre-Emmanuel, Levy Yves, Schwartz Olivier, Moris Arnaud (2010). Preclinical Studies of a Modified Vaccinia Virus Ankara-Based HIV Candidate Vaccine: Antigen Presentation and Antiviral Effect . Journal Of Virology , 84(10), 5314-5328 . https://doi.org/10.1128/JVI.02329-09


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